La diferència clau entre l'SF1 i l'SF2 és la seva capacitat per desenrotllar els àcids nucleics. Mentre que l'SF1 només desenrotlla l'ADN, l'SF2 desenrotlla l'ADN i l'ARN.
L'helicasa és un dels enzims clau que participen en el procés de replicació de l'ADN, així com en els processos de reparació de l'ADN. El paper principal de l'helicasa és participar en el procés de desenrotllament per tal de facilitar la separació de molècules d'ADN de doble cadena. L'activitat de l'enzim és essencial durant la fase d'inici de la replicació de l'ADN. Les helicases es divideixen en Super Family 1 i Super Family 2, principalment en funció de les seves diferències estructurals. Dins de cada Súper Família, hi ha més diversos tipus d'helicases.
Què és SF1?
L'helicasa de la Super Família 1 és un tipus d'helicasa que comprèn una estructura hexamèrica juntament amb la proteïna interna del nucli, que representa l'activitat de l'helicasa. L'helicasa SF1 és una de les classes més grans d'helicases i es pot classificar com a helicases SF1A i helicases SF1B. Proteïnes com PcrA, Rep i UvrD, pertanyen a la classe de les helicases SF1A. En comparació, proteïnes com RecA i Dda pertanyen a la classe de les helicases SF1B. Les funcions de les helicases SF1 varien àmpliament. Algunes de les funcions vitals de les helicases SF1 inclouen la replicació de l'ADN, la recombinació de l'ADN, el processament de fragments d'Okazaki, la formació de telòmers i la reparació de l'excisió de nucleòtids del dany de l'ADN. En algunes espècies bacterianes, les helicases del tipus SF1 també participen en la transferència horitzontal de gens mitjançant la conjugació. A més, en els virus, les helicases SF1 ajuden a la replicació viral.
Figura 01: Acció de l'helicasa
Hi ha molts motius diferents associats a l'estructura de les helicases SF1. Contenen almenys 7 motius conservats entre tots els diferents tipus d'helicases SF1 (Q, I, Ia, II, III, IV, V i VI). L'estructura de l'helicasa SF1 és un cristall, on els motius s'agrupen. Hi ha una butxaca característica d'unió d'ATP entre els motius i el lloc d'unió a l'ADN. Els dominis no conservats es distribueixen per mantenir la integritat estructural de la molècula de l'helicasa. Aquests dominis poden variar entre les helicases SF1A i les helicases SF1B.
Què és SF2?
Super family 2 helicase és un dels grups més diversos de superfamílies d'helicase. Hi ha molts tipus d'helicases SF2 com les helicases semblants a RecQ, RecG, com les helicases, les helicases Rad3/XPD i NS3. Alguns enzims de restricció, com els enzims de restricció de tipus I, també entren en aquesta categoria. La funció general de les helicases SF2 és el desenrotllament de l'ADN de doble cadena. Tanmateix, alguns tipus d'helicases SF2 no tenen la capacitat d'actuar completament com a enzims d'helicases. Les helicases SF2 també s'utilitzen àmpliament en el processament de l'ARN. La família DEAD-box d'helicases SF2 participa en el processament de l'ARN, inclòs la transcripció, l'empalmament, el processament de la traducció i el muntatge del complex ARN-proteïna.
Figura 02: helicasa
L'estructura de l'helicasa SF2 també conté motius conservats. Tanmateix, alguns dominis difereixen lleugerament del de l'helicasa SF1. També contenen un domini d'unió a l'ATP a part del domini d'unió a l'ADN.
Quines similituds hi ha entre SF1 i SF2?
- SF1 i SF2 mostren activitat helicasa.
- A més, tots dos participen en la replicació i recombinació de l'ADN.
- SF1 i SF2 es componen de motius conservats.
- Tots dos tenen un domini d'unió a l'ATP i un domini d'unió a l'ADN.
- Aquestes formes són proteïnes multidomini.
- A més, si es produeixen mutacions en qualsevol tipus, es produiran efectes nocius.
- Tant l'SF1 com l'SF2 són crucials per garantir la continuïtat del cicle cel·lular.
- SF1 i SF2 es troben tant en procariotes com en eucariotes.
Quina diferència hi ha entre SF1 i SF2?
SF1 i SF2 són dues súper famílies d'helicasa. Mostren una gran diversitat. La diferència clau entre SF1 i SF2 és que SF1 participa principalment en el desenrotllament de l'ADN, mentre que SF2 també participa en el processament de l'ARN durant la transcripció i la traducció. Quan es comparen els diferents motius de la proteïna, SF1 i SF2 difereixen principalment segons el motiu III i el motiu IV. Tot i que tenen una similitud estructural, les helicases SF1 formen estructures hexamèriques toroidals mentre que SF2 no forma aquestes disposicions estructurals.
Una altra diferència entre l'SF1 i l'SF2 és que les helicases SF1 prefereixen més els nucleòtids d'adenina, mentre que les helicases SF2 prefereixen els cinc nucleòtids per desenrotllar-se. Quan es comparen la direcció de desenrotllament, les helicases SF1 només es transloquen en la direcció de 5' a 3', mentre que les helicases SF2 tenen la capacitat de translocar-se juntament amb els àcids nucleics en ambdues direccions.
La infografia següent presenta les diferències entre SF1 i SF2 en forma de taula per comparar-les.
Resum: SF1 vs SF2
Les helicases són un grup molt important i divers d'enzims que participen en la replicació de l'ADN. Tanmateix, a causa de la seva gran diversitat, els enzims es classifiquen en superfamílies. SF1 i SF2 són les dues superfamílies d'helicases més grans. Mentre que l'SF1 s'associa principalment amb el processament relacionat amb l'ADN, l'SF2 s'associa tant amb el processament de l'ADN com de l'ARN. Per tant, aquesta és la diferència clau entre SF1 i SF2. A més, SF1 i SF2 també difereixen en la seva disposició estructural, ja que SF2 no forma estructures hexamèriques. Les mutacions a les helicases SF1 i SF2 provocaran el desenvolupament de càncer després de la desregulació del cicle cel·lular i d' altres mecanismes vitals com la reparació de l'ADN.
