La diferència clau entre la metagenòmica i la metatranscriptòmica es basa en el tipus de biomolècules estudiades a cada àrea. La metagenòmica estudia l'ADN, les seves seqüències i el seu comportament en els organismes, mentre que la metatranscriptòmica estudia l'ADN transcrit, principalment les seqüències d'ARNm i el seu comportament en els organismes.
La metagenòmica i la metatranscriptòmica són dos camps que han guanyat molta popularitat al llarg dels anys en relació a la comunitat microbiana. Són importants en la sanitat, la indústria i la biotecnologia agrícola. Tant la metagenòmica com la metatranscriptòmica permeten l'estudi d'organismes individuals en una comunitat i els seus rols funcionals que són beneficiosos o nocius.
Què és la metagenòmica?
La metagenòmica és el camp d'estudi que explora l'àcid desoxiribonucleic (ADN). És més rellevant per a la comunitat microbiana. A més, és un camp més avançat en comparació amb la genòmica. En genòmica, l'anàlisi de l'ADN d'un organisme particular té lloc. Tanmateix, la metagenòmica implica l'anàlisi del material genètic a través d'una comunitat d'organismes. Així, això permet estudiar el comportament d'una comunitat d'organismes que pertany a una condició o un entorn.
Figura 01: Metagenòmica
La principal tècnica implicada en els estudis de metagenòmica és la seqüenciació de nova generació (NGS) que utilitza la tecnologia de microarrays. Els mètodes NGS poden analitzar múltiples organismes en una sola reacció per a la presència o absència de seqüències específiques d'ADN. Aquestes seqüències d'ADN poden ser responsables d'una sola mal altia o d'una condició ambiental. Per tant, utilitzant el coneixement metagenòmic, el cribratge d'organismes es pot fer de manera fàcil i precisa. La seqüenciació durant l'NGS té lloc en lectures breus i es produeix el perfil de l'ADN dels organismes. La seqüència d'ADN 16s és una seqüència popular estudiada en metagenòmica sobre microorganismes.
Després de la seqüenciació de la comunitat d'organismes, s'ha de fer l'alineació de les seqüències. Eines com l'eina de seqüència d'alineació local bàsica (BLAST) s'utilitzen per complir la tasca d'alineació. Després de l'alineació, un arbre filogenètic proporciona la relació de cada organisme de la comunitat i detalls sobre el seu comportament.
Què és la metatranscriptòmica?
La metatranscriptòmica és el camp d'estudi que tracta el transcriptoma d'un organisme. El transcriptoma constitueix la totalitat de les seqüències d'ARN transcrites durant la transcripció de l'ADN. Les seqüències d'ARNm presents al transcriptoma proporcionen informació sobre l'expressió genètica. La metatranscriptòmica és l'anàlisi de diversos transcriptomes entre poblacions o comunitats.
Figura 02: anàlisi del transcriptoma
Els estudis de metatranscriptòmica també utilitzen tecnologies de microarrays per trobar les seqüències de les seqüències de lectura curtes. A més, la metatranscriptòmica també implica una anàlisi bioinformàtica exhaustiva utilitzant eines d'alineació i mètodes de disseny d'arbres. Tanmateix, el camp de la metatranscriptòmica és molt més difícil en comparació amb la metagenòmica. L'extracció de l'ARNm o l'ARN en conjunt no és tan fàcil com sembla. Com que l'ARN és molt propens a la destrucció i té un temps de vida molt curt, el manteniment i l'emmagatzematge d'aquests podria ser una possible consulta.
Quines similituds hi ha entre la metagenòmica i la metatranscriptòmica?
- La metagenòmica i la metatranscriptòmica són tècniques d' alt rendiment per analitzar comunitats d'organismes, principalment comunitats microbianes.
- Les dues tècniques utilitzen la tecnologia de microarrays per deduir les troballes.
- Els resultats obtinguts s'analitzen sovint mitjançant l'alineació BLAST i els arbres filogenètics.
- A més, ambdues tècniques no se centren en un organisme, sinó en un grup o en organismes comunitaris.
- A més, ambdós conceptes també s'estudien principalment en relació amb els microbis; la raó principal és la seva diversitat de funcions.
Quina diferència hi ha entre la metagenòmica i la metatranscriptòmica?
La metagenòmica i la metatranscriptòmica impliquen l'anàlisi de matèria genètica en una comunitat d'organismes. Així, la metagenòmica es refereix als patrons i seqüències de l'ADN, mentre que la metatranscriptòmica es refereix a l'anàlisi de l'ARNm o l'ADN transcrit. Per tant, aquesta és la diferència clau entre la metagenòmica i la metatranscriptòmica.
A més, el procediment d'extracció difereix en ambdues tècniques; la metagenòmica implica procediments d'extracció d'ADN i la metatranscriptòmica implica procediments d'extracció d'ARN. Per tant, aquesta també és una diferència significativa entre la metagenòmica i la metatranscriptòmica.
La infografia següent resumeix la diferència entre la metagenòmica i la metatranscriptòmica:
Resum: metagenòmica vs metatranscriptòmica
La metagenòmica i la metatranscriptòmica són camps d'estudi nous que analitzen una comunitat d'organismes per a una determinada condició. Així, la metagenòmica fa referència a l'anàlisi de seqüències d'ADN. En canvi, la metatranscriptòmica es refereix a l'anàlisi de seqüències d'ARN o productes d'ADN transcrits. En aquest sentit, la metatranscriptòmica permet identificar l'expressió gènica per a un cas concret. Tots dos són importants per analitzar les mutacions i els seus efectes. Aquestes són tècniques ràpides i més fiables utilitzades en el diagnòstic previ. Per tant, aquest és el resum de la diferència entre la metagenòmica i la metatranscriptòmica.
