Diferència clau: Exome vs Transcriptoma
Un gen conté regions codificants i no codificants. Les seqüències codificants es coneixen com a exons, i les seqüències no codificants es coneixen com a introns. La seqüència de nucleòtids dels exons d'un gen representa el codi genètic del gen per sintetitzar la proteïna específica. Per tant, els exons romanen a la molècula d'ARNm. La regió total de l'exó del genoma es coneix com a exoma i és una part important del genoma. El codi genètic dels gens es converteix en el codi genètic de la molècula d'ARNm, que és necessari per a la producció de proteïnes. Totes les molècules d'ARNm transcrites en una cèl·lula o població cel·lular alhora es coneix com a transcriptoma. La diferència clau entre l'exoma i el transcriptoma és que l'exoma representa les seqüències de les regions exòniques del genoma mentre que el transcriptoma representa l'ARNm total d'una cèl·lula o un teixit en un moment determinat.
Què és Exome?
Els gens estan formats per exons, introns i seqüències reguladores. Els exons són les regions gèniques que es transcriuen a la seqüència d'ARNm durant la transcripció. Els introns i altres regions no codificants s'eliminen durant la transcripció. La seqüència de nucleòtids dels exons determina el codi genètic del gen que sintetitza la proteïna específica que codifica. Només romanen els exons dins de l'ARNm d'una proteïna. La col·lecció d'exons en el genoma es coneix com a exoma d'un organisme. Representa una part del genoma que s'expressa en gens. En humans, l'exoma representa l'1% del genoma. És la part que codifica proteïnes del genoma humà.
Figura 01: Exome
Què és Transcriptome?
El transcriptoma és la col·lecció de totes les transcripcions (ARN) codificants i no codificants de proteïnes en un teixit determinat. El transcriptoma representa la col·lecció de molècules totals d'ARNm expressades pels gens en una cèl·lula o un teixit. El transcriptoma d'una cèl·lula es pot variar amb el transcriptoma d'un altre tipus de cèl·lula. El transcriptoma també és dinàmic: canvia amb el temps en resposta a estímuls tant interns com externs. Fins i tot dins del mateix teixit o dins del mateix tipus de cèl·lula, el transcriptoma pot canviar al cap d'uns minuts.
El transcriptoma és diferent de l'exoma d'un organisme. El transcriptoma inclou només les seqüències d'exoma expressades. Tot i que l'exoma d'una cèl·lula segueix sent el mateix, el transcriptoma difereix entre cèl·lules ja que l'expressió gènica no és la mateixa per a totes les cèl·lules o teixits. Només els gens essencials s'expressen en diferents cèl·lules i teixits. L'expressió gènica és un procés específic de teixit o tipus de cèl·lula. Està regulat per diversos factors, inclosos els factors ambientals. Per tant, el transcriptoma pot variar segons les condicions ambientals externes.
Transcriptome s'utilitza com a precursor per als estudis de proteòmica. Totes les proteïnes es deriven de seqüències d'ARNm. Les modificacions translacionals poden provocar canvis en les proteïnes. Tanmateix, el transcriptoma proporciona informació bàsica important per als estudis proteòmics.
Figura 02: transcriptoma de cèl·lules mare embrionàries
Quina diferència hi ha entre Exome i Transcriptome?
Exome vs Transcriptome |
|
| Exome és la col·lecció de la regió dels gens que codifica proteïnes. | Transcriptoma és la col·lecció de tot l'ARN transcrit, inclòs l'ARNm. |
| Mostra | |
| L'exoma s'estudia mitjançant una mostra d'ADN. | El transcriptoma s'estudia mitjançant una mostra d'ARN. |
| Mètode d'estudi | |
| La seqüenciació de l'exoma sencer és el mètode d'estudi de l'exoma. | La seqüenciació de l'ARN és el mètode d'estudi del transcriptoma. |
Resum: Exome vs Transcriptoma
Els exons són les seqüències codificants dels gens i determinen les seqüències d'ARNm de les proteïnes. La col·lecció d'aquestes seqüències codificants (exons) es coneix com a exoma d'un organisme. Els gens es transcriuen a molècules d'ARNm abans de fabricar proteïnes. El total de molècules d'ARNm d'una cèl·lula o d'un teixit en un moment donat es coneixen com a transcriptoma. El transcriptoma representa els gens que s'estan expressant activament a l'ARNm en un moment donat. El transcriptoma és específic de cèl·lules i teixits i afecta les condicions ambientals. Aquesta és la diferència entre l'exoma i el transcriptoma.
