Diferència clau: electroforesi en gel vs pàgina SDS
L'electroforesi en gel és una tècnica que separa macromolècules en un camp elèctric. És un mètode comú en biologia molecular per separar ADN, ARN i proteïnes de mescles segons les seves mides moleculars. La pàgina SDS és un tipus d'electroforesi en gel que s'utilitza per separar proteïnes d'una barreja de proteïnes en funció de les seves mides. L'electroforesi en gel és un terme utilitzat per referir-se a la tècnica normal aplicada per a la separació d'ADN, ARN i proteïnes, mentre que SDS Page és un tipus d'electroforesi en gel. Aquesta és la diferència clau entre l'electroforesi en gel i la pàgina SDS.
Què és l'electroforesi en gel?
L'electroforesi en gel és una tècnica habitual que s'utilitza als laboratoris per separar molècules carregades com ADN, ARN, proteïnes, etc. de les seves mescles. Un gel s'utilitza en l'electroforesi en gel. Actua com a garbell molecular. Hi ha dos tipus de gels utilitzats en l'electroforesi en gel, és a dir, l'agarosa i la poliacrilamida. La selecció d'un gel i la preparació del gel són factors importants a tenir en compte en les electroforesis en gel, ja que la mida dels porus del gel s'ha de manipular amb cura per a una bona separació de molècules mitjançant electroforesi en gel. L'electroforesi en gel té un camp elèctric connectat a dos extrems del gel. Un extrem del gel mostra una càrrega positiva mentre que l' altre extrem està carregat negativament.
L'ADN i l'ARN són molècules carregades negativament. Una vegada que es carreguen al gel des de l'extrem negatiu del gel i s'apliquen al camp elèctric, migren a través dels porus del gel cap a l'extrem carregat positivament del gel. La velocitat de la migració depèn de la càrrega i de la mida de la molècula. Les molècules més petites migren fàcilment a través dels porus del gel que les molècules més grans. Per tant, les molècules més petites viatgen una llarga distància a través del gel i les molècules més grans viatgen una distància curta. Per observar el viatge de les molècules sobre el gel, s'utilitzen tipus especials de colorants. El camp elèctric s'aplica durant un període de temps determinat i s'atura per evitar la pèrdua de molècules i mantenir les molècules en les seves posicions recorregudes. Es poden observar diferents bandes al gel. Aquestes bandes representen les molècules de diferents mides. Per tant, l'electroforesi en gel és útil per diferenciar molècules segons les seves mides.
L'electroforesi en gel s'incorpora a diverses tècniques com a tècnica preparativa en biologia molecular com ara PCR, RFLP, clonació, seqüenciació d'ADN, Southern blotting, mapeig del genoma, etc.
Figura 01: electroforesi en gel d'agarosa
Què és la pàgina SDS?
L'electroforesi en gel de poliacrilamida de dodecil sulfat de sodi (Pàgina SDS) és un tipus d'electroforesi en gel que s'utilitza per separar proteïnes. Quan s'utilitza l'electroforesi en gel per separar proteïnes, es necessiten tractaments especials, ja que les proteïnes no estan carregades negativament com l'ADN i l'ARN i no migren cap a l'extrem positiu o negatiu. Per tant, les proteïnes es desnaturalitzen i es recobreixen amb una càrrega negativa abans de l'electroforesi en gel. Es fa amb un detergent anomenat dodecil sulfat de sodi (SDS). L'electroforesi en gel que utilitza SDS i un gel de poliacrilamida per al medi de suport es coneix com a pàgina SDS. Aquesta tècnica s'utilitza habitualment en bioquímica, genètica, medicina forense i biologia molecular.
Durant la pàgina SDS, les proteïnes es barregen amb SDS. SDS desplega les proteïnes en una forma lineal i les cobreix amb una càrrega negativa proporcional a la seva massa molecular. A causa de la càrrega negativa, les molècules de proteïnes migren cap a l'extrem de càrrega positiva del gel i se separen segons les seves masses moleculars. A SDS Page, la poliacrilamida s'utilitza com a suport sòlid per al gel. La separació real de les proteïnes depèn principalment de les propietats del gel. Per tant, la preparació del gel de poliacrilamida s'ha de fer amb cura i s'han d'utilitzar concentracions correctes de poliacrilamida. Els gels de poliacrilamida mostren una alta resolució que els gels d'agarosa. Per tant, SDS Page es considera una tècnica d' alta resolució per a la separació de proteïnes.
La pàgina SDS és un tipus d'electroforesi en gel desnaturalitzant. Té una limitació important en l'anàlisi de proteïnes. Com que l'SDS desnaturalitza les proteïnes abans de la separació, no permet la detecció d'activitat enzimàtica, interaccions d'unió a proteïnes, cofactors de proteïnes, etc.
Figura 02: pàgina SDS
Quina diferència hi ha entre l'electroforesi en gel i la pàgina SDS?
Electroforesi en gel vs pàgina SDS |
|
| L'electroforesi en gel és un mètode que es realitza per separar macromolècules mitjançant un camp elèctric. | La pàgina SDS és una tècnica d'electroforesi en gel d' alta resolució que s'utilitza per separar proteïnes en funció de la seva massa. |
| Gel Run | |
| Es pot fer de manera horitzontal o vertical. | La pàgina SDS sempre s'executa verticalment. |
| Base per a la separació | |
| La separació es produeix segons el càrrec i la mida. | La separació de proteïnes es produeix segons la massa i la càrrega. |
| Resolució | |
| L'electroforesi en gel d'agarosa té una resolució baixa i l'electroforesi en gel de poliacrilamida té una resolució més alta | La pàgina SDS té una millor resolució. |
| Desnaturalització | |
| L'electroforesi en gel inclou tècniques desnaturalitzants i no desnaturalitzants. | La pàgina SDS desnaturalitza les proteïnes abans de la separació. |
Resum: electroforesi en gel vs pàgina SDS
L'electroforesi en gel és una tècnica comuna utilitzada per a la separació i anàlisi d'ADN, ARN i proteïnes en funció de la seva mida i càrrega. Hi ha dos tipus principals d'electroforesi en gel, a saber, l'electroforesi en gel d'agarosa i l'electroforesi en gel de poliacrilamida. Els gels d'agarosa s'utilitzen principalment per a la separació d'àcids nucleics; quan es requereix una resolució més alta, s'utilitzen gels de poliacrilamida. SDS Page és un tipus d'electroforesi en gel que s'utilitza habitualment per separar mescles complexes de proteïnes. Es considera una tècnica de separació de proteïnes d' alta resolució. Aquesta és la diferència entre l'electroforesi en gel i la pàgina SDS.
