La diferència clau entre l'electroforesi en gel d'agarosa i poliacrilamida és que l'electroforesi en gel d'agarosa utilitza gels d'agarosa abocats horitzontalment per separar fragments d'ADN relativament més grans, mentre que l'electroforesi en gel de poliacrilamida utilitza gels de poliacrilamida abocats verticalment per separar fragments d'àcid nucleic més curts..
L'electroforesi és un tipus de tècnica que utilitza un camp elèctric aplicat a través d'una matriu de gel per separar biomolècules com l'ADN, l'ARN i les proteïnes. Aquesta separació de biomolècules com ADN, ARN i proteïnes mitjançant electroforesi es basa en la càrrega i la mida. Les mostres es carreguen als pous del gel. Més tard, el camp elèctric s'aplica a través del gel. El camp fa que les molècules carregades negativament es moguin cap a l'elèctrode positiu. La matriu de gel actua com un garbell molecular a través del qual passen o viatgen ràpidament les molècules més petites mentre que les molècules més grans es mouen lentament. Això permet la separació de molècules en funció de la càrrega i la mida. Per tant, l'electroforesi en gel d'agarosa i de poliacrilamida són dos tipus de tècniques d'electroforesi en gel que ajuden principalment a separar les molècules en funció de la seva mida i càrrega.
Què és l'electroforesi en gel d'agarosa?
L'electroforesi en gel d'agarosa és una tècnica que utilitza gels d'agarosa per separar biomolècules com l'ADN i l'ARN. És una tècnica utilitzada per separar els àcids nucleics principalment per mida. El principal compost anomenat agarosa utilitzat en aquesta tècnica és un polisacàrid. Prové de les algues. L'agarosa es pot dissoldre en un tampó d'ebullició i després es pot abocar en una safata que es manté horitzontal. A la safata, es solidifica quan es refreda formant una llosa. Els gels d'agarosa s'aboquen amb una pinta al seu lloc per fer pous en els quals es carreguen àcids nucleics com l'ADN o l'ARN un cop el gel s'ha solidificat.
Figura 01: electroforesi en gel d'agarosa
El gel es submergeix més tard en un tampó adequat i s'aplica un corrent a través del gel. L'ADN té una càrrega negativa uniforme que és independent de la composició de la seqüència de la molècula. Per tant, les molècules d'ADN migraran des del càtode (-) cap a l'ànode (+). La velocitat de migració depèn directament de la mida de la molècula. Les macromolècules més grans tenen més dificultats per navegar pel gel. D' altra banda, les macromolècules més petites llisquen pel gel ràpidament i amb força facilitat.
Què és l'electroforesi en gel de poliacrilamida?
L'electroforesi en gel de poliacrilamida (PAGE) és una tècnica que utilitza gels de poliacrilamida per separar biomolècules. És una tècnica molt utilitzada per separar macromolècules biològiques, normalment proteïnes i àcids nucleics, segons la seva mobilitat electroforètica. La hidratació de l'acrilonitril dóna lloc a la formació de molècules d'acrilamida per la nitril hidratasa. L'acrilamida és soluble en aigua, i després de l'addició d'iniciadors de radicals lliures, l'acrilamida es polimeritza, donant lloc a la formació de gel de poliacrilamida. Normalment, l'augment de les concentracions d'acrilamida provoca una disminució de la mida dels porus del gel. Els gels de poliacrilamida s'aboquen verticalment, a diferència dels gels d'agarosa.
Figura 02: electroforesi en gel de poliacrilamida
En l'electroforesi en gel de poliacrilamida, les molècules poden funcionar en el seu estat natiu, conservant l'estructura d'ordre superior de les molècules. Aquest mètode s'anomena PAGE nativa. Alternativament, també es pot afegir un desnaturalitzant químic per eliminar l'estructura d'ordre superior i convertir la molècula en una molècula no estructurada la mobilitat de la qual només depèn de la seva longitud. Aquest tipus s'anomena SDS-PAGE.
Quines similituds hi ha entre l'electroforesi en gel d'agarosa i de poliacrilamida?
- L'electroforesi en gel d'agarosa i poliacrilamida són dos tipus de tècniques d'electroforesi en gel.
- De fet, són tècniques de biologia molecular.
- Ambdues tècniques s'utilitzen per detectar macromolècules biològiques com l'ADN i les proteïnes.
- Aquestes tècniques les fan tècnics o investigadors qualificats.
- En ambdues tècniques, la separació de macromolècules es basa en la càrrega i la mida.
- Ambdues tècniques permeten la separació d'àcids nucleics com l'ADN i l'ARN.
Quina diferència hi ha entre l'electroforesi en gel d'agarosa i de poliacrilamida?
L'electroforesi en gel d'agarosa és una tècnica que utilitza gels d'agarosa abocats horitzontalment per separar biomolècules, mentre que l'electroforesi en gel de poliacrilamida és una tècnica que utilitza gels de poliacrilamida abocats verticalment per separar biomolècules. Aquesta és la diferència clau entre l'electroforesi en gel d'agarosa i poliacrilamida. A més, l'electroforesi en gel d'agarosa s'utilitza per a la separació d'ADN i ARN, mentre que l'electroforesi en gel de poliacrilamida s'utilitza per a la separació d'àcids nucleics com ADN, ARN o proteïnes.
La taula següent resumeix la diferència entre l'electroforesi en gel d'agarosa i de poliacrilamida.
Resum: agarosa vs electroforesi en gel de poliacrilamida
L'electroforesi en gel d'agarosa i poliacrilamida són dos tipus de tècniques d'electroforesi en gel utilitzades als laboratoris de biologia molecular. L'electroforesi en gel d'agarosa utilitza un gel d'agarosa per separar biomolècules. L'agarosa generalment no és tòxica per als humans, mentre que la poliacrilamida és tòxica per als humans. A més, l'electroforesi en gel d'agarosa mostra una resolució baixa mentre que l'electroforesi en gel de poliacrilamida mostra una resolució més. L'electroforesi en gel de poliacrilamida utilitza un gel de poliacrilamida per separar biomolècules. Això resumeix la diferència entre l'electroforesi en gel d'agarosa i de poliacrilamida
