La diferència clau entre l'electroforesi en gel 1D i 2D són les propietats utilitzades per a la separació de proteïnes a l'electroforesi en gel. L'electroforesi en gel 1D només separa les proteïnes en funció del pes molecular, mentre que l'electroforesi en gel 2D separa les proteïnes en funció del seu punt isoelèctric i el seu pes molecular.
La separació de proteïnes per electroforesi en gel és una tècnica important per caracteritzar les proteïnes. Les proteïnes tenen propietats diferents; per tant, la separació és més complexa en comparació amb la separació d'ADN mitjançant electroforesi en gel d'agarosa.
Què és l'electroforesi en gel 1D?
L'electroforesi en gel 1D, també coneguda com a electroforesi en gel d'una dimensió, és un mètode de separació de proteïnes basat en el pes molecular. La separació de proteïnes es realitza principalment mitjançant electroforesi en gel de poliacrilamida. Basant-se en el concepte d'electroforesi en gel, les molècules se separen per la seva propietat de pes molecular i càrrega.
Per tant, per donar una càrrega uniforme a les proteïnes, es fa un tractament amb dodecil sulfat de sodi (SDS) abans de l'electroforesi en gel. SDS desnaturalitza les proteïnes i proporciona una càrrega negativa uniforme a la proteïna; quan es produeix l'aplicació del camp elèctric, les proteïnes migren al terminal positiu en funció del seu pes molecular. Així, en la separació, només es considera una propietat. És per això que aquest mètode s'anomena electroforesi en gel 1D.
Figura 01: electroforesi en gel 1D
Durant l'electroforesi en gel 1D, les proteïnes es separen en funció del seu pes molecular. En aquest sentit, les molècules de menor pes migren més ràpidament al gel en comparació amb les proteïnes d' alt pes molecular. Així, les proteïnes d' alt pes romanen a prop dels pous.
Què és l'electroforesi en gel 2D?
L'electroforesi en gel 2D o l'electroforesi en gel bidimensional separa les proteïnes en funció de dues propietats. Les dues propietats són el punt isoelèctric de la proteïna i el pes molecular. Aquest mètode de separació de proteïnes augmenta la resolució de la separació de proteïnes. El punt isoelèctric de la proteïna depèn del pH en què la proteïna és neutra.
Figura 02: electroforesi en gel 2D
Així, en l'electroforesi en gel 2D, es permet que la proteïna funcioni amb un gradient de pH fix a la primera dimensió. En la segona dimensió, les proteïnes es separen mitjançant electroforesi en gel de poliacrilamida vertical o horitzontal. Així, les proteïnes se separen segons el seu pes molecular en la segona dimensió.
A més, aquest mètode d'electroforesi en gel augmenta la resolució de la separació de proteïnes. Per tant, les proteïnes separades són més pures. Tanmateix, el cost de la tècnica és molt superior a l'electroforesi en gel d'una dimensió.
Quines similituds hi ha entre l'electroforesi en gel 1D i 2D?
- Les dues tècniques separen les proteïnes.
- Per tant, són importants per caracteritzar les proteïnes.
Quina diferència hi ha entre l'electroforesi en gel 1D i 2D?
La diferència clau entre l'electroforesi en gel 1D i 2D és que l'electroforesi en gel 1D separa les proteïnes només en funció del pes molecular, mentre que l'electroforesi en gel 2D separa les proteïnes en funció tant del punt isoelèctric com del pes molecular. A causa d'aquesta diferència bàsica entre l'electroforesi en gel 1D i 2D, la resolució de separació de les proteïnes i el cost de les dues tècniques també varien. L'electroforesi en gel 2D mostra una alta resolució que l'electroforesi en gel 1D. Tanmateix, l'electroforesi en gel 2D és més costosa que l'electroforesi en gel 1D.
La infografia següent resumeix la diferència entre l'electroforesi en gel 1D i 2D.
Resum: electroforesi en gel 1D vs 2D
La separació de proteïnes depèn de molts factors. L'electroforesi en gel 1D separa les proteïnes en funció només del pes molecular. Tanmateix, l'electroforesi en gel bidimensional o 2D augmenta la resolució de la separació de proteïnes. A més, l'electroforesi en gel 2D separa les proteïnes en funció del punt isoelèctric i el pes molecular. Per tant, aquestes dades són importants per al processament aigües avall de proteïnes i en el camp de la proteòmica. Per tant, aquest és el resum de la diferència entre l'electroforesi en gel 1D i 2D.