La diferència clau entre FISH i CGH és que FISH és una tècnica molecular que detecta una seqüència específica d'ADN en un cromosoma mitjançant sondes marcades fluorescentment, mentre que la CGH és una altra tècnica citogenètica molecular que detecta alteracions en l'ADN genòmic..
L'anàlisi citogenètica té un paper important en medicina a l'hora de detectar anomalies cromosòmiques, com ara aneuploïdies, supressions, duplicacions i reordenaments, etc. Les anomalies cromosòmiques eventualment condueixen a mal alties genètiques com el càncer, la infertilitat, la síndrome de Down, la síndrome de Klinefelter, Turner. síndrome, leucèmia, etc. Existeixen diversos mètodes citogenètics moleculars per detectar els defectes i mal alties esmentades anteriorment. Entre elles, FISH (hibridació fluorescent in situ) i CGH (hibridació genòmica comparada) són dues tècniques d'hibridació potents. Tanmateix, tots dos mètodes tenen pros i contres.
Què és FISH?
FISH és una tècnica d'hibridació d'àcids nucleics realitzada sobre una porció o secció de teixit, en tot el teixit o cèl·lules. És un mètode basat en sondes. La tècnica depèn de la teoria de l'aparellament de bases complementàries de Watson Crick, donant lloc a híbrids ADN-ADN o híbrids ADN-ARN, que poden detectar gens mutats o identificar el gen d'interès. A més, aquesta tècnica utilitza seqüències d'ADN monocatenari, seqüències d'ADN de doble cadena, seqüències d'ARN monocatenari o oligonucleòtids sintètics preparats mitjançant la traducció de nick com a sondes que són complementàries a les seqüències gèniques d'interès. A més, la característica més important d'aquesta tècnica és l'etiquetatge de sondes amb colorants de fluorescència. Així, les sondes s'uneixen a les parts complementàries del cromosoma i faciliten la seva detecció.
A més, FISH és un mètode molt sensible i específic. Per tant, és una tècnica habitual tant en la investigació com en el diagnòstic de tumors hematològics i tumors sòlids. Però FISH mostra una resolució baixa. També requereix un coneixement previ de l'anormalitat diana per dissenyar seqüències de sondes.
Figura 01: PEIX
Hi ha moltes aplicacions de FISH, principalment en el diagnòstic molecular de mal alties infeccioses per identificar la presència de patògens i confirmar el patogen mitjançant diagnòstics moleculars. A més, FISH és una tècnica d'ús habitual en els camps de la biologia del desenvolupament, el cariotip i l'anàlisi filogenètica i el mapeig físic de cromosomes.
Què és CGH?
La hibridació genòmica comparada (CGH) és una altra tècnica citogenètica molecular basada en l'ADN que pot detectar les alteracions de les seqüències d'ADN genòmic. El mètode és un mètode avançat que pot analitzar modificacions cromosòmiques i genètiques per detectar els canvis o alteracions en les seqüències d'ADN genòmic. A més, CGH requereix l'aïllament i la fragmentació de l'ADN de la mostra experimental i la mostra de referència. A continuació, s'han d'etiquetar les mostres amb dos colorants fluorescents diferents (normalment vermell i verd). Més tard, ambdues mostres es barregen i es permeten una hibridació competitiva. El pas final és l'anàlisi de les mostres per detectar alteracions en l'ADN, com ara la duplicació de gens, la pèrdua de gens, etc. En especial, mesura les diferències de nombre de còpies d'ADN entre la mostra de prova i la mostra de control.
Figura 02: CGH
Ara està disponible una altra versió de CGH; és un mètode més avançat que el CGH normal. És una tècnica anomenada CGH basada en matrius o aCGH. aCGH permet la identificació precisa de supressions de gens o seqüències en molts milers de seqüències en un sol experiment.
Quines similituds hi ha entre FISH i CGH?
- FISH i CGH són dues tècniques moleculars.
- Tant FISH com CGH depenen de la hibridació d'àcids nucleics.
- A més, ambdues tècniques necessiten sondes dissenyades per detectar objectius específics d'ADN.
- Els fem servir per al diagnòstic prenatal i postnatal de mal alties genètiques.
- A més, tant FISH com CGH són eines molt potents per estudiar alteracions genòmiques.
- Utilitzen tints fluorescents per etiquetar les sondes.
Quina diferència hi ha entre FISH i CGH?
FISH és un procediment d'hibridació in situ que utilitza sondes fluorescents per detectar seqüències específiques d'ADN, mentre que la CGH és una tècnica d'hibridació molecular que detecta les alteracions de seqüències d'ADN genòmic. Per tant, aquesta és la diferència clau entre FISH i CGH.
A més, FISH requereix un coneixement previ de l'anormalitat diana per dissenyar seqüències de sondes, mentre que CGH no requereix coneixements previs. A més, una altra diferència entre FISH i CGH és que FISH mostra una resolució limitada mentre que aCGH mostra una alta resolució.
La infografia següent resumeix la diferència entre FISH i CGH.
Resum: FISH vs CGH
FISH i CGH són dues tècniques citogenètiques moleculars que faciliten la detecció de seqüències gèniques d'interès. FISH facilita la detecció d'una seqüència específica d'ADN en un cromosoma mitjançant sondes marcades fluorescentment mentre que CGH facilita la detecció d' alteracions en l'ADN genòmic. Per tant, aquesta és la diferència clau entre FISH i CGH.
