La diferència clau entre la CGH i la matriu CGH és que la CGH és un mètode citogenètic molecular tradicional per analitzar la variació del nombre de còpies en l'ADN d'una mostra de prova que té una resolució més baixa, mentre que la CGH matriu és un mètode citogenètic molecular totalment automatitzat per analitzant la variació del nombre de còpies a l'ADN d'una mostra de prova que té una resolució més alta.
CGH i la matriu CGH són dues tècniques per detectar les variacions del nombre de còpies en individus. La variació del nombre de còpies fa referència a les seccions del genoma que es repeteixen. El número de còpia varia entre individus. La variació del nombre de còpies generalment es classifica en dos grups: repeticions curtes i repeticions llargues. Un dels exemples més coneguts per a una variació del nombre de còpies curtes és la repetició del trinucleòtid CAG en el gen de la huntingtina. Això provoca un trastorn neurològic anomenat huntingtina. El millor exemple de la variació del nombre de còpies de repeticions llargues és el gen de l'alfa amilasa, que causa resistència a la insulina. La variació del nombre de còpies es pot detectar mitjançant tècniques com FISH, CGH i matriu CGH.
Què és CGH?
CGH és un mètode citogenètic molecular tradicional per analitzar la variació del nombre de còpies en l'ADN d'una mostra de prova en comparació amb una mostra de referència. Té una resolució més baixa en comparació amb les tècniques automatitzades. L'objectiu d'aquesta tècnica és comparar de manera ràpida i eficient dues mostres d'ADN genòmic que sorgeixen de diferents fonts.
Figura 01: CGH
El procediment implica l'aïllament de l'ADN de dues fonts: prova i referència. A continuació, el següent pas és l'etiquetatge independent de mostres d'ADN de prova i de referència amb fluoròfors de diferents colors. Més tard, les dues mostres d'ADN es van desnaturalitzar per obtenir les mostres d'ADN monocatenari. Finalment, es va realitzar la hibridació de les dues mostres d'ADN resultants en una proporció 1:1 amb una propagació normal en metafase dels cromosomes. Les diferències cromosòmiques es poden identificar entre les dues fonts mitjançant un microscopi de fluorescència i un programari informàtic. A més, la tècnica CGH només és capaç de detectar anomalies cromosòmiques desequilibrades.
Què és Array CGH?
Array CGH és un mètode citogenètic molecular totalment automatitzat per analitzar la variació del nombre de còpies en l'ADN d'una mostra de prova en comparació amb una mostra de referència. Té una resolució més alta, i s'ha desenvolupat per tal de minimitzar les limitacions de la CGH tradicional. Array CGH combina els principis de CGH amb l'ús de microarrays. En lloc d'utilitzar la propagació de cromosomes en metafase, aquest mètode utilitza diapositives disposades amb petits segments d'ADN com a objectius. Aquests microarrays es van fer dipositant i immobilitzant una petita quantitat d'ADN (sondes) sobre un suport de vidre sòlid. La mida de les sondes pot variar des d'un oligonucleòtid fins a un cromosoma artificial bacterià.
Figura 02: matriu CGH
Independentment de les sondes, el mètode bàsic de la matriu CGH és similar a la CGH. Un cop preparades les sondes que contenen microarrays, les dues mostres d'ADN (prova i referència) marcades amb fluoròfors de diferents colors es barregen i s'afegeixen al microarray. Com que l'ADN de les mostres és monocatenari a causa de la desnaturalització, aquest ADN s'hibrida amb sondes monocatenaris disposades. Mitjançant un sistema d'imatge digital, és possible identificar les diferències cromosòmiques entre les dues fonts.
Quines similituds hi ha entre CGH i Array CGH?
- CGH i la matriu CGH són dues tècniques per detectar les variacions del nombre de còpies.
- Són mètodes citogenètics moleculars.
- Ambdós mètodes diagnostiquen anomalies cromosòmiques desequilibrades.
- Els Els fluoròfors estan implicats en tots dos mètodes.
- Ambdós mètodes es poden utilitzar per detectar trastorns genètics a causa de les variacions del nombre de còpies.
- S'utilitzen àmpliament en l'anàlisi genòmica comparada.
Quina diferència hi ha entre CGH i Array CGH?
CGH és un mètode citogenètic molecular tradicional per analitzar la variació del nombre de còpies en l'ADN d'una mostra de prova que té una resolució més baixa, mentre que la matriu CGH és un mètode citogenètic molecular totalment automatitzat per analitzar la variació del nombre de còpies en l'ADN d'una mostra de prova. que té una resolució més alta. Per tant, aquesta és la diferència clau entre CGH i la matriu CGH. A més, a la CGH, les mostres d'ADN de prova i de referència s'hibriditzen amb una propagació normal en metafase dels cromosomes, però en la matriu de CGH, les mostres d'ADN de prova i de referència s'hibriditzen amb les sondes d'ADN immobilitzades que contenen microarrays..
La infografia següent mostra les diferències entre la CGH i la matriu de CGH en forma de taula per comparar-les.
Resum: CGH vs Array CGH
CGH i array CGH són dues tècniques citogenètiques moleculars per detectar anomalies cromosòmiques desequilibrades. S'utilitzen àmpliament en l'anàlisi genòmica comparada. CGH és un mètode citogenètic molecular tradicional per analitzar la variació del nombre de còpies en l'ADN d'una mostra de prova que té una resolució més baixa. En canvi, la matriu CGH és un mètode citogenètic molecular totalment automatitzat per analitzar la variació del nombre de còpies en l'ADN d'una mostra de prova que té una resolució més alta. Així, això resumeix la diferència entre la CGH i la matriu CGH.
