La diferència clau entre cis i trans splicing és que cis splicing és un mecanisme intramolecular que elimina introns i uneix els exons que es troben dins de la mateixa transcripció d'ARN, mentre que trans-splicing és un mecanisme intermolecular que elimina introns o outrons i s'uneix als exons que no es troben dins de la mateixa transcripció d'ARN.
El splicing d'ARN és una forma de processament d'ARN abans de la síntesi de proteïnes. En aquest procés, una transcripció d'ARN pre-missatger acabada de fer es transforma en un ARN missatger madur. L'ARN missatger madur ajuda a produir una molècula de proteïna. Durant l'empalmament de l'ARN, els introns (regions no codificants) s'eliminen i els exons (regions codificants) s'uneixen per formar ARNm madur. L'splicing cis i trans són dos tipus de mecanismes d'empalmament d'ARN.
Què és Cis Splicing?
Cis splicing és un mecanisme intramolecular que elimina introns i uneix els exons que es troben dins de la mateixa transcripció d'ARN. L'empalmament cis normal processa una sola molècula d'ARN. L'empalmament cis és el procés d'empalmament típic del pre ARNm dut a terme pels spliceosomes. A l'intró, un lloc donant (extrem 5' de l'intró), un lloc de branca (prop de l'extrem 3' de l'intró) i un lloc acceptor (extrem 3' de l'intró) són molt essencials per a l'empalmament. El lloc donant d'empalmament inclou una seqüència invariant GU a l'extrem 5' de l'intró. El lloc acceptor d'empalmament a l'extrem 3' de l'intró té una seqüència AG invariant. Amunt de la seqüència AG, hi ha una regió anomenada regió de pirimidina (tracte de polipirimidina). Més aigües amunt del tracte polipirimidínic, hi ha un punt de ramificació que inclou un nucleòtid d'adenosina. Aquest nucleòtid està implicat en la formació de lariat.
Figura 01: Empalmament Cis i Trans
Els spliceosomes principals són U1, U2, U4, U5 i U6. Entre ells, U1 i U2 són molt importants. En l'empalmament cis, l'U1 s'uneix al lloc d'empalmament de 5 'i U2 s'uneix al punt de ramificació proper al lloc d'empalmament de 3'. U5/U4/U6 s'uneix als exons al lloc 5', amb U6 s'uneix a U2. Més tard, U1 s'estrena. U5 passa d'exó a intró i U6 s'uneix al lloc d'empalmament de 5'. A més, també s'estrena U4. U6/U2 catalitza la transesterificació, fent que l'extrem 5' de l'intró es lligui al nucleòtid A de l'intró. Això desencadena la formació de lariats. En la formació d'un lariat, U5 s'uneix a l'exó al lloc d'empalmament 3 'i el lloc 5' es trenca. A la fase final de l'empalmament, U2/U5/U6 romanen units al lariat i el lloc 3' es trenca. A més d'això, els exons es lliguen mitjançant la hidròlisi d'ATP en aquesta fase.
Què és el Trans Splicing?
L'empalmament trans és un mecanisme intermolecular que elimina introns o outrons i uneix els exons que no es troben dins de la mateixa transcripció d'ARN. En el trans-splicing, no hi ha cap lloc d'empalmament de 5' a la molècula de pre ARNm perquè la proteïna U1 s'uneixi. En canvi, l'ARN del líder d'empalmament capat (SL) s'empalma trans a la seqüència a l'outron.
Figura 02: Empalmament trans
Outron és una regió del pre ARNm entre la tapa de 5' i el lloc d'empalmament trans. Tanmateix, la proteïna U2 s'uneix al lloc d'empalmament 3' normalment. Després d'eliminar l'outron, l'exó líder d'empalmament (SL) s'empalma amb el primer exó del pre ARNm. A més, el trans-splicing és un mecanisme que s'observa en certs microorganismes com els protistes de la classe Kinetoplastae per expressar gens.
Quines similituds hi ha entre l'empalmament Cis i Trans?
- Els splicing cis i trans són dos tipus de mecanismes d'empalmament d'ARN.
- En ambdós mecanismes, s'eliminen introns.
- A més, en ambdós mecanismes, els exons s'uneixen per formar ARNm madur.
- Ambdós mecanismes es troben en eucariotes.
- Aquests mecanismes estan absents en els procariotes.
Quina diferència hi ha entre Cis i Trans Splicing?
Cis splicing és un mecanisme intramolecular que elimina introns i uneix els exons que es troben dins de la mateixa transcripció d'ARN, mentre que el trans-splicing és un mecanisme intermolecular que elimina introns o outrons i uneix els exons que no estan dins del mateix ARN transcripció. Per tant, aquesta és la diferència clau entre cis i trans splicing. A més, en l'empalmament cis, els introns s'eliminen per formar ARNm madur. D' altra banda, en l'empalmament trans s'eliminen introns o outrons per formar ARNm madur.
La infografia següent mostra les diferències entre l'empalmament cis i trans en forma de taula per comparar-les.
Resum: Cis vs Trans Splicing
L'empalmament de l'ARN és una forma de processament d'ARN abans del procés de síntesi de proteïnes. L'splicing cis i trans són dos tipus de mecanismes d'empalmament d'ARN que es troben als eucariotes. L'empalmament cis és un mecanisme intramolecular que elimina introns i uneix els exons que es troben dins de la mateixa transcripció d'ARN, mentre que el trans-splicing és un mecanisme intermolecular que elimina introns o outrons i uneix els exons que no es troben dins de la mateixa transcripció d'ARN. Així, això conclou la discussió sobre la diferència entre cis i trans splicing.
