Diferència clau: fulla plisada Alpha Helix vs Beta
Les hèlixs alfa i els fulls plegats beta són les dues estructures secundàries més freqüents en una cadena polipeptídica. Aquests dos components estructurals són els primers passos principals en el procés de plegament d'una cadena polipeptídica. La diferència clau entre Alpha Helix i Beta Pleated Sheet està en la seva estructura; tenen dues formes diferents per fer una feina específica.
Què és Alpha Helix?
Una hèlix alfa és una bobina dreta de residus d'aminoàcids en una cadena polipeptídica. El rang de residus d'aminoàcids pot variar de 4 a 40 residus. Els enllaços d'hidrogen formats entre l'oxigen del grup C=O a la bobina superior i l'hidrogen del grup N-H de la bobina inferior ajuden a mantenir la bobina unida. Es forma un enllaç d'hidrogen per cada quatre residus d'aminoàcids de la cadena de la manera anterior. Aquest patró uniforme li dóna característiques definides com ara el gruix de la bobina i determina la longitud de cada volta completa al llarg de l'eix de l'hèlix. L'estabilitat de l'estructura de l'hèlix alfa depèn de diversos factors.
O àtoms en vermell, N àtoms en blau i enllaços d'hidrogen com a línies de punts verds
Què és el full plegat beta?
El full plegat beta, també conegut com a full beta, es considera la segona forma d'estructura secundària de les proteïnes. Conté cadenes beta que estan connectades lateralment per un mínim de dos o tres enllaços d'hidrogen per formar una làmina plisada i retorçada, tal com es mostra a la imatge. Una cadena beta és un tram de cadena polipeptídica; la seva longitud és generalment igual a 3 a 10 aminoàcids, inclosa la columna vertebral en una confirmació ampliada.
Fragment de fulla β antiparal·lel de 4 cadenes d'una estructura cristal·lina de l'enzim catalasa.
a) que mostra els enllaços d'hidrogen antiparal·lels (puntejats) entre els grups pèptids NH i CO a les cadenes adjacents. Les fletxes indiquen la direcció de la cadena i els contorns de densitat d'electrons dibuixen els àtoms que no són H. Els àtoms O són boles vermelles, els àtoms N són blaus i els àtoms d'H s'ometen per simplicitat; les cadenes laterals només es mostren al primer àtom C de la cadena lateral (verd)
b) Vista de vora dels dos filaments β centrals
A les làmines plisades beta, les cadenes polipeptídiques corren una al costat de l' altra. Rep el nom de "full plisat" a causa de l'aspecte ondulat de l'estructura. Estan units per ponts d'hidrogen. Aquesta estructura permet formar més ponts d'hidrogen estirant la cadena polipeptídica.
Quina diferència hi ha entre Alpha Helix i Beta Pleated Sheet?
Estructura de l'hèlix alfa i fulla plegada Beta
Alpha Helix:
En aquesta estructura, la columna vertebral polipeptídica està estretament lligada al voltant d'un eix imaginari com una estructura espiral. També es coneix com a disposició helicoïdal de la cadena peptídica.
La formació de l'estructura de l'hèlix alfa es produeix quan les cadenes polipeptídiques es retorcen en espiral. Això permet que tots els aminoàcids de la cadena formin enllaços d'hidrogen (un enllaç entre una molècula d'oxigen i una molècula d'hidrogen) entre si. Els enllaços d'hidrogen permeten que l'hèlix mantingui la forma d'espiral i dóna una bobina ajustada. Aquesta forma espiral fa que l'hèlix alfa sigui molt forta.
Els enllaços d'hidrogen s'indiquen amb punts grocs.
Full plegat beta:
Quan dos o més fragments de cadenes polipeptídiques se superposen entre si, formant una fila d'enllaços d'hidrogen entre si, es poden trobar les estructures següents. Pot passar de dues maneres; disposició paral·lela i disposició antiparal·lel.
Exemples de l'estructura:
Alpha Helix: les ungles dels dits o dels peus es poden prendre com a exemple d'estructura d'hèlix alfa.
Full plegat beta: l'estructura de les plomes és similar a l'estructura del full plegat beta.
Característiques de l'estructura:
Alfa Hèlix: a l'estructura de l'hèlix alfa, hi ha 3,6 aminoàcids per volta de l'hèlix. Tots els enllaços peptídics són trans i plans, i els grups N-H dels enllaços peptídics apunten en la mateixa direcció, que és aproximadament paral·lela a l'eix de l'hèlix. Els grups C=O de tots els enllaços peptídics apunten en la direcció oposada i són paral·lels a l'eix de l'hèlix. El grup C=O de cada enllaç peptídic s'uneix al grup N-H de l'enllaç peptídic formant un enllaç d'hidrogen. Tots els grups R s'apunten cap a fora des de l'hèlix.
Full plegat beta: cada enllaç peptídic del full plegat beta és pla i té la trans-conformació. Els grups C=O i N-H d'enllaços peptídics de cadenes adjacents es troben en el mateix pla i s'apunten l'un cap a l' altre formant enllaços d'hidrogen entre ells. Tots els grups R de qualsevol cadena poden ocórrer alternativament per sobre i per sota del pla del full.
Definicions:
Estructura secundària: és la forma d'una proteïna plegable a causa dels enllaços d'hidrogen entre els seus grups amida i carbonil de la seva columna vertebral.
