La diferència clau entre hèlix-bucle-hèlix i hèlix-gir-hèlix és que hèlix-bucle-hèlix media la dimerització de proteïnes mentre que l'hèlix-gir-hèlix regula l'expressió gènica mitjançant la unió a l'ADN.
Un motiu proteic és una seqüència curta conservada associada a diferents funcions de l'ADN. S'associa principalment a un lloc estructural especial amb una funció química o biològica única. Aquests motius contenen petites regions d'estructures tridimensionals d'aminoàcids amb diferents molècules de proteïnes. Normalment, els motius individuals contenen només uns quants elements. Hèlix-bucle-hèlix i hèlix-gir-hèlix contenen tres elements. Els seus motius estructurals proteics inclouen bucles amb longituds variables i estructures no especificades.
Què és Helix-Loop-Helix?
Una hèlix-loop-hèlix (HLH) és un motiu estructural de proteïnes que defineix una de les famílies més grans de factors de transcripció dimeritzants. Aquests factors de transcripció contenen residus d'aminoàcids per facilitar el mecanisme d'unió a l'ADN, i són dimèrics. El motiu estructural de la proteïna conté dues hèlixs α i estan connectades per un bucle. Una hèlix sembla més petita de les dues hèlixs, i la flexibilitat del bucle permet la dimerització empaquetant i plegant contra una altra hèlix. L'hèlix que sembla més gran normalment conté regions d'unió a l'ADN. Les proteïnes HLH s'uneixen a una seqüència consens que es coneix com a caixa E. Una seqüència consens és un ordre calculat que conté residus de nucleòtids o aminoàcids. E-box és un element que respon a l'ADN d'alguns eucariotes que actua com a lloc d'unió a proteïnes i regula l'expressió gènica.
Figura 01: motiu d'hèlix-bucle-hèlix
Els factors de transcripció HLH són essencials per al desenvolupament i l'activitat cel·lular. Les proteïnes HLH pertanyen principalment a sis grups, que s'indiquen de les lletres A a F. Els factors de transcripció inclosos en cada grup són:
Grup A: MyoD, Myf5, Beta2/NeuroD1, Scl, p-CaMK, NeuroD i Neurogenins, grup B: MAX, C-Myc, N-Myc i TCF4
Grup C: AhR, BMAL-1-CLOCK, HIF, NPAS1, NPAS3 i MOP5
Grup D; EMC
Grup E: HEY1 i HEY2
Grup F: EBF1
Com que la majoria dels factors de transcripció de l'HLH són heterodimèrics, la dimerització sovint els regula.
Què és Helix-Turn-Helix?
Helix-turn-helix (HTH) és un motiu estructural de proteïnes que és capaç d'unir-se a l'ADN. Cada monòmer s'organitza amb dues hèlixs α i està unit per una cadena curta d'aminoàcids. Això s'uneix a un solc de l'hèlix d'ADN. Els motius HTH solen regular l'expressió gènica. El reconeixement i la unió de HTH a l'ADN es duen a terme per dues hèlixs α. Una hèlix ocupa l'extrem N-terminal mentre que l' altra està a l'extrem C-terminal. En la majoria dels escenaris, l'hèlix realitza el reconeixement de l'ADN. Per tant, es coneix com a hèlix de reconeixement. La unió al solc de l'ADN té lloc mitjançant una sèrie d'interaccions de Van der Waals i enllaços d'hidrogen amb bases exposades. L' altra hèlix α estabilitza la interacció entre proteïnes i ADN i no té un paper important en el reconeixement. Tanmateix, l'hèlix de reconeixement i l'hèlix restant tenen una orientació similar.
Figura 02: Hèlix-gir-hèlix de la família TetR
L'HTH es classifica segons l'estructura i la disposició espacial de les hèlixs. Els tipus principals són HTH dihelicoïdal, trihelicoïdal, tetrahelicoïdal i HTH alat. El tipus dihelicoïdal és el tipus més simple amb dues hèlixs i un domini proteic de plegament independent. El tipus trihelicoïdal es troba a l'activador transcripcional Myb. El tipus tetrahelicoïdal té una hèlix C-terminal addicional. Finalment, l'HTH alat està format per un paquet de 3 helicoïdals i un full beta de 3 o 4 cadenes.
Quines similituds hi ha entre Helix-Loop-Helix i Helix-Turn-Helix?
- Hèlix-bucle-hèlix i hèlix-gir-hèlix són motius estructurals de proteïnes.
- Tots dos contenen un denominador comú en factors de transcripció basals i específics.
- Estan presents en eucariotes.
Quina diferència hi ha entre Helix-Loop-Helix i Helix-Turn-Helix?
Helix-loop-hèlix media la dimerització de proteïnes, mentre que l'hèlix-gir-hèlix regula l'expressió gènica mitjançant la unió a l'ADN. Per tant, aquesta és la diferència clau entre hèlix-bucle-hèlix i hèlix-gir-hèlix. A més, HLH conté certs proto-oncogens i gens implicats en la diferenciació que codifiquen factors de transcripció, mentre que HTH conté molts gens homeòtics que codifiquen factors de transcripció. A més, l'hèlix-bucle-hèlix consisteix principalment en hèlixs alfa unides per un bucle, mentre que l'hèlix-gir-hèlix consisteix principalment en llaços units per un suport d'aminoàcids curt que forma un solc.
La infografia següent presenta les diferències entre hèlix-bucle-hèlix i hèlix-gir-hèlix en forma de taula per comparar-les una al costat de l' altra.
Resum: Helix-Loop-Helix vs Helix-Turn-Helix
Un motiu proteic és una seqüència curta conservada associada a diferents funcions de l'ADN. Hèlix-bucle-hèlix i hèlix-gir-hèlix són dos tipus de motius estructurals de proteïnes. La diferència clau entre hèlix-bucle-hèlix i hèlix-gir-hèlix és que l'hèlix-bucle-hèlix media la dimerització de proteïnes, mentre que l'hèlix-gir-hèlix regula l'expressió gènica mitjançant la unió a l'ADN. HLH és un motiu estructural de proteïnes que defineix una de les famílies més grans de factors de transcripció dimeritzants. El motiu estructural de la proteïna conté dues hèlixs α i estan connectades per un bucle. L'HTH és un motiu estructural de proteïnes capaç d'unir l'ADN. Cada monòmer s'organitza amb dues hèlixs α, i està unit per una cadena curta d'aminoàcids i s'uneix a un solc de l'hèlix d'ADN. Així doncs, això resumeix la diferència entre hèlix-bucle-hèlix i hèlix-gir-hèlix.
