La diferència clau entre la proteòmica dirigida i la no dirigida és que la proteòmica dirigida té com a objectiu mesurar l'abundància d'una proteïna específica mentre que la proteòmica no dirigida no s'orienta a una proteïna específica.
La proteòmica és l'estudi a gran escala de les proteïnes, les seves estructures i funcions. Estudia tot el complement proteic d'una cèl·lula, un teixit o un organisme en condicions específiques. Hi ha dos tipus de proteòmica com la proteòmica dirigida i la proteòmica no dirigida.
Què és la proteòmica dirigida?
Com el seu nom indica, la proteòmica dirigida s'adreça a una proteïna específica o un pèptid en una barreja complexa de proteïnes per a l'anàlisi. A continuació, analitza la presència i la quantitat d'aquesta proteïna específica preseleccionada. Aquest mètode només és possible per a una mostra o en diverses mostres. Aquest mètode és adequat fins i tot per a un grup específic de proteïnes. Dóna com a resultat dades més precises, quantitatives i sensibles. A més, l'espectrometria de masses juntament amb la proteòmica dirigida produeix mesures fiables més precises. Aquest mètode utilitza un espectròmetre de masses triple quadrupol (QQQ) per a la seva anàlisi.
Figura 01: Proteòmica
La proteòmica dirigida és un mètode adequat si voleu verificar si un objectiu derrocat realment està enderrocat o quan voleu quantificar una proteïna/pèptid en concret en sèrum sanguini, líquid cerebral o lisat cel·lular, etc. També podeu utilitzeu-lo si voleu comprovar si una proteïna concreta s'expressa de manera diferencial entre mostres o durant un experiment temporal.
Què és la proteòmica no dirigida?
La proteòmica no dirigida, com el seu nom indica, no s'adreça a una proteïna o pèptid específic per a la seva anàlisi. La proteòmica de descobriment és un altre nom de la proteòmica no dirigida. De fet, és una anàlisi més "global". En general, realitzar proteòmica no dirigida és respondre a la pregunta "quines proteïnes o proteïnes hi ha en aquesta mostra o en diverses mostres?". Aquest mètode no és sensible com a proteòmica dirigida. Però pot identificar i mesurar moltes proteïnes, incloses proteïnes noves. La proteòmica no dirigida pot produir mesures tant quantitatives com qualitatives.
Quines són les similituds entre la proteòmica dirigida i la no orientada?
- Tant la proteòmica orientada com la no orientada mesuren proteïnes a les mostres.
- Són importants en l'anàlisi del proteoma.
- Aquests mètodes utilitzen espectrometria de masses.
Quina diferència hi ha entre la proteòmica dirigida i la no orientada?
En primer lloc, la proteòmica dirigida és la determinació de la presència i la quantitat d'una proteïna o pèptid en particular en una barreja complexa de proteïnes. En canvi, la proteòmica no dirigida és l'estudi quantitatiu i qualitatiu de proteïnes presents en una mostra o mostres sense dirigir-se a una proteïna concreta. La proteòmica dirigida es realitza amb proteïnes preseleccionades o dirigides, mentre que la proteòmica no dirigida es realitza per esbrinar els tipus de proteïnes d'aquesta mostra. A més, la proteòmica dirigida és més sensible que la proteòmica no dirigida.
Resum: proteòmica dirigida versus no orientada
En resum, la proteòmica dirigida i no dirigida són dos tipus d'estudis de proteïnes. Com suggereixen els seus noms, la proteòmica dirigida s'adreça a una proteïna específica mentre que la proteòmica no dirigida no s'orienta a una proteïna específica. Aquesta és la diferència entre la proteòmica dirigida i la no orientada.
