La diferència clau entre la proteòmica i la metabolòmica és que la proteòmica és l'estudi de totes les proteïnes d'un organisme mentre que la metabolòmica és l'estudi de tots els metabòlits d'un organisme.
La genòmica és l'estudi de la composició genètica d'un organisme. La proteòmica i la metabolòmica són dues ciències òmiques relacionades amb la genòmica. El proteoma fa referència a totes les proteïnes d'una cèl·lula o un organisme. El metaboloma, en canvi, fa referència a tots els metabòlits d'un organisme. Així, l'estudi del proteoma és la proteòmica mentre que l'estudi del metaboloma és la metabolòmica. Tant la proteòmica com la metabolòmica són importants en el diagnòstic de mal alties i en la caracterització i cribratge d'organismes. A més, tots dos estan connectats en molts aspectes de la biologia cel·lular, especialment en la senyalització cel·lular, la degradació i generació de proteïnes i la modificació post-traducció.
Què és la proteòmica?
El proteoma és el complement proteic total d'una cèl·lula, un teixit o un organisme. Per tant, la proteòmica és l'estudi del proteoma d'un organisme. En proteòmica s'analitzen diferents característiques de les proteïnes. Per tant, la proteòmica se centra principalment en l'estructura, l'orientació, les funcions, les interaccions de proteïnes, les modificacions, les aplicacions i la importància de les proteïnes. És per això que actualment es duen a terme molts projectes de recerca en el camp de la proteòmica.
Es van fer els primers estudis proteòmics per identificar el contingut de proteïnes a Escherichia coli. El mapeig del contingut total de proteïnes es va fer mitjançant gels bidimensionals (2D). Després de l'èxit d'aquest projecte, els científics van passar a caracteritzar el contingut total de proteïnes en animals com els conillets d'índies i els ratolins. Actualment, el mapatge de proteïnes humanes es fa mitjançant electroforesi en gel 2D.
Hi ha molts avantatges d'estudiar la proteòmica, ja que les proteïnes són les molècules que governen la majoria de l'activitat a causa de la propietat catalitzadora de les proteïnes. Així, l'estudi de proteïnes senceres pot proporcionar informació sobre l'estat de salut d'un organisme. A més, la proteòmica té moltes aplicacions en l'anotació del genoma, la identificació i el diagnòstic de mal alties, la realització d'estudis d'expressió de proteïnes durant l'experimentació i modificacions de proteïnes i estudis d'interacció, etc.
Figura 01: Proteòmica
Hi ha diferents tècniques implicades en proteòmica, entre les quals destaquen l'extracció de la proteïna total, la separació d'elles mitjançant electroforesi en gel 2D, la seqüenciació de les proteïnes extretes mitjançant mètodes com el mètode de seqüenciació d'Edmund o l'espectrometria de masses i l'anàlisi d'estructura i funcionalitat. propietats de la proteïna mitjançant programari informàtic i eines bioinformàtiques.
Què és la metabolòmica?
La metabolòmica és l'estudi de tots els metabòlits d'una cèl·lula, un teixit o un organisme. Inclou la identificació i quantificació de metabòlits cel·lulars mitjançant diferents eines analítiques i estadístiques avançades. La metabolòmica és un estudi important ja que revela informació sobre el metabolisme d'un organisme.
Figura 02: Metabolòmica
Per estudiar substrats i productes de reaccions metabòliques, la metabolòmica utilitza l'espectrometria de masses com a plataforma analítica. L'espectrometria de masses dóna com a resultat metabòlits i les seves concentracions, que reflecteixen l'estat bioquímic real de les cèl·lules o dels teixits. Per tant, la metabolòmica es pot considerar com la millor representació del fenotip molecular d'un organisme. A més d'aquests, la metabolòmica es pot considerar una extensió de la proteòmica perquè la majoria de metabòlits es generen a causa de l'activitat dels enzims que són proteïnes.
Quines similituds hi ha entre la proteòmica i la metabolòmica?
- La proteòmica i la metabolòmica són dues ciències òmiques relacionades amb la genòmica.
- La metabolòmica es pot considerar una extensió de la proteòmica.
- El proteoma i el metaboloma estan estretament entrellaçats amb molts estudis.
Quina diferència hi ha entre la proteòmica i la metabolòmica?
La proteòmica és l'estudi a gran escala de les proteïnes, inclosa la seva estructura i funció, dins d'una cèl·lula o un organisme. Mentrestant, la metabolòmica és l'estudi dels perfils de metabòlits en una cèl·lula, teixit o organisme sota un conjunt de condicions determinat. Per tant, aquesta és la diferència clau entre la proteòmica i la metabolòmica. A més, la proteòmica es refereix principalment al conjunt complet de proteïnes, mentre que la metabolòmica es refereix principalment al conjunt complet de metabòlits, incloent una varietat diversa de molècules petites com pèptids, carbohidrats, lípids, nucleòsids i productes catabòlics de compostos exògens, etc. Per tant, aquesta és una altra diferència entre la proteòmica i la metabolòmica.
La infografia següent resumeix la diferència entre la proteòmica i la metabolòmica.
Resum: proteòmica vs metabolòmica
Els organismes vius es poden estudiar mitjançant el seu genoma, proteïnes i metabòlits. La genòmica, la proteòmica i la metabolòmica són les tres àrees que estudien la composició genètica, les proteïnes i els metabòlits d'una cèl·lula o d'un organisme, respectivament. La proteòmica és important ja que és un reflex dinàmic tant dels gens com del medi ambient. La metabolòmica és molt important ja que reflecteix directament l'estat actual de la reacció bioquímica de les cèl·lules o l'estat metabòlic d'un organisme. Així, això resumeix la diferència entre proteòmica i metabolòmica.