La diferència clau entre QTL i GWAS depèn del tipus de seqüències utilitzades en l'anàlisi. QTL utilitza loci de gens d'enllaç per analitzar trets fenotípics associats a l'herència poligènica, mentre que GWAS utilitza seqüències senceres del genoma per analitzar polimorfismes d'un sol nucleòtid d'una condició determinada.
Els mapes QTL i GWAS tenen un paper important en les anàlisis genètiques de diferents trets. A més, són importants per analitzar diverses mal alties amb etiologia desconeguda. A més, la seqüenciació juga un paper clau en ambdues tècniques. Aquestes tècniques es poden combinar a més amb altres tècniques d' alt rendiment per augmentar la precisió i la precisió.
Què és QTL?
QTL són les sigles de Quantitative Trait Locus. És una regió de l'ADN associada a un tret fenotípic. Generalment, un QTL dóna lloc a efectes poligènics. La distribució de QTL varia i el nombre de QTL suggereix el grau de variació d'un tret fenotípic particular. A més, normalment codifiquen els trets continus subjacents i no els trets discrets.
Un cop identificades les regions QTL, és important seqüenciar una àrea QTL particular. A més, per facilitar les investigacions i la investigació, la seqüenciació i l'emmagatzematge de les dades de la seqüència de les regions QTL comunes tenen lloc amb la implicació de la bioinformàtica. A aquesta tècnica anomenem mapeig QTL. Posteriorment, s'acumula una base de dades amb les seqüències de la regió QTL.
Figura 01: exploració QTL
A més, les aplicacions de seqüències QTL es basen principalment en l'eina BLAST, on es pot determinar la similitud de seqüències. És important per deduir les relacions entre organismes. A més, és important per determinar la complexitat d'un fenotip poligènic particular. També determina l'evolució d'un tret concret.
En l'actualitat, l'anàlisi QTL es combina amb altres tècniques d' alt rendiment com ara microarrays d'ADN. Això és important en l'anàlisi d'expressió del fenotip. Actualment, els científics estan molt interessats a desenvolupar la base de dades QTL, ja que les regions QTL són responsables de molts trets importants de diferents espècies.
Què és GWAS?
GWAS significa Genome Wide Association Study. També es refereix a estudis d'associació del genoma sencer. Aquests estudis se centren principalment en estudis observacionals. Analitza les variants genètiques de diferents individus normalment associades a un tret específic. A més, tot el genoma és important per a l'anàlisi GWAS.
Figura 02: GWAS
GWAS és una eina important en l'anàlisi de polimorfismes d'un sol nucleòtid associats a diverses mal alties. Aquest també és un estudi comparatiu dels diferents polimorfismes d'un sol nucleòtid en una àmplia població. A més, la mostra d'estudi de GWAS és molt elevada; per tant, també pren el format d'un estudi de cohort transversal.
A més, es va realitzar el primer estudi GWAS pel que fa a l'infart de miocardi i analitzant els gens associats a l'infart de miocardi. Actualment, el GWAS té un paper important a l'hora de determinar el fons genètic de mal alties complexes d'etiologia desconeguda.
Quines similituds hi ha entre QTL i GWAS?
- Depenen de les dades de seqüències d'ADN per a l'anàlisi.
- Tots dos estan associats amb els antecedents genètics de diversos personatges.
- A més, requereixen eines bioinformàtiques per deduir i interpretar resultats.
- Es fan en grans poblacions.
Quina diferència hi ha entre QTL i GWAS?
QTL analitza els trets fenotípics associats a l'herència poligènica mitjançant loci genètics enllaçats, mentre que GWAS analitza polimorfismes d'un sol nucleòtid d'una condició particular mitjançant seqüències de genoma sencer. Per tant, aquesta és la diferència clau entre QTL i GWAS. El mapatge QTL és comparativament una tècnica menys complexa que GWAS, ja que requereix seqüenciació del genoma sencer.
La infografia següent resumeix la diferència entre QTL i GWAS en forma de taula.
Resum: QTL vs GWAS
El cartografia QTL i el GWAS tenen un paper important a l'hora de determinar el fons genètic de diversos trets fenotípics. També ajuden a analitzar el fons genètic de diferents mal alties. El mapeig QTL mapeja els gens d'enllaç responsables dels trets continus i també implica mapejar els gens d'herència poligènica. GWAS, d' altra banda, té lloc amb l'anàlisi del genoma sencer per a polimorfismes d'un sol nucleòtid. A més, això té lloc en una població més gran. Per tant, aquest és el resum de la diferència entre QTL i GWAS.
