La diferència clau entre la sintènia i la colinealitat és que la sintènia és la co-localització física de loci genètics en el mateix cromosoma en espècies, mentre que la colinealitat és la co-localització física de loci genètics en el mateix cromosoma en diferents espècies conservant. la mateixa comanda.
Sintenia i colinealitat són dos termes que s'utilitzen indistintament en genòmica. Tots dos termes descriuen els patrons de localització gènica en cromosomes de diferents espècies. Aquests arranjaments gènics relacionats entre els tàxons són informació valuosa quan es dedueix l'ascendència compartida dels gens. La sintènia es refereix a la co-localització física de loci genètics en el mateix cromosoma en espècies. La colinealitat es refereix a la co-localització física de loci genètics en el mateix cromosoma en diferents espècies que conserven el mateix ordre. Per tant, és una forma de sintènia.
Què és Synteny?
En diferents espècies, hi ha un conjunt de gens situats al mateix cromosoma. I aquesta co-localització física de gens en el mateix cromosoma en diferents espècies es coneix com a sintènia. A més, aquests gens es troben molt a prop els uns dels altres en un únic cromosoma. L'ordre dels gens pot no ser necessàriament el mateix. Però, la localització de gens a prop dels altres en el mateix cromosoma té lloc en sintènia. Per tant, synteny descriu principalment el patró de distribució dels gens en un cromosoma. Aquests patrons de co-localització gènica indiquen relacions entre diferents espècies i la seva evolució. Tanmateix, la sintènia es pot interrompre a causa de reordenacions cromosòmiques com translocacions, inversió i fusió cromosòmica, etc., duplicacions, pèrdua i recombinació homòloga desigual.
Figura 01: Synteny
Es creu que tots els gens enllaçats són sintènics. Tanmateix, no tots els gens sintènics estan necessàriament vinculats. Tenen seqüències cromosòmiques comunes. Els humans tenim molts gens sintènics amb altres mamífers. A més, molts cereals tenen gens sintènics.
Què és la colinealitat?
La colinealitat és una forma més específica de sintènia en què un conjunt de gens es troben en el mateix cromosoma de diferents espècies en el mateix ordre que en les espècies ancestrals. Per tant, si hi ha una desviació de la colinealitat, serà un caràcter filogenètic més fiable, ja que la colinealitat explica l'ascendència compartida dels gens.
Figura 02: Colinealitat
L'anàlisi de colinealitat múltiple proporciona informació molt més fiable sobre les espècies relacionades i la seva filogènia.
Quines similituds hi ha entre la sintonia i la colinealitat?
- Tant en sintènia com en colinealitat, un conjunt de loci de dues espècies diferents es troba al mateix cromosoma.
- Aquests termes descriuen la co-localització física dels loci genètics al mateix cromosoma.
- La colinealitat és una forma més específica de sintènia.
- De vegades els dos termes s'utilitzen indistintament en genòmica.
- Si dues regions tenen colinealitat, òbviament són sintènies.
- Són útils per inferir filogènia.
Quina diferència hi ha entre sintonia i colinealitat?
Sintenia i colinealitat són dos termes que s'utilitzen indistintament en genòmica. La sintènia fa referència a la co-localització física d'un conjunt de gens en un mateix cromosoma en espècies diferents. La colinealitat és una forma de sintènia en la qual el conjunt de gens es co-localitza en el mateix ordre entre les diferents espècies. Per tant, aquesta és la diferència clau entre sintènia i colinealitat.
Resum: sintonia i colinealitat
Els termes sintènia i colinealitat fan referència a un conjunt de gens que es troben al mateix cromosoma en espècies diferents. De fet, aquests gens estan co-localitzats en el mateix cromosoma en diferents espècies. Synteny descriu la co-localització física del conjunt de gens en el mateix cromosoma en diferents espècies, mentre que la colinealitat és una forma més específica de sintènia en què el conjunt de gens es co-localitza en el mateix ordre. Així, això resumeix la diferència entre sintènia i colinealitat.
