La diferència clau entre els introns del grup I i del grup II és que als introns del grup I, la reacció d'empalmament s'inicia per un cofactor de guanosina, mentre que als introns del grup II, la reacció d'empalmament s'inicia per l'adenosina interna.
El pre-ARNm és la transcripció principal que té introns i exons. El pre-ARNm s'ha de convertir en ARNm abans de la traducció. L'empalmament d'ARN o l'empalmament pre-ARNm és una d'aquestes modificacions post-transcripcionals. En l'empalmament d'ARN, els introns s'eliminen de la molècula pre-ARNm i s'uneixen els exons. Els introns del grup I i del grup II són introns d'autoempalme. Es separen de la molècula pre-ARNm sense l'ajuda de cap altre enzim. Per tant, són enzims d'ARN o ribozimes que catalitzen el seu propi splicing a partir del pre-ARNm. A més, tenen la capacitat de funcionar com a elements mòbils. Durant l'empalmament, es produeixen una sèrie de reaccions de transesterificació per tal d'extirpar l'intró i lligar els exons. Aquests ribozimes estan presents en els tres dominis, inclosos els bacteris, les arquees i els eucariotes.
Què són els introns del grup I?
Els introns del grup I són un tipus de ribozims autoempalmes que es troben en bacteris, bacteriòfags i eucariotes (genomes organics i nuclears). Es troben en gens essencials. Són capaços de catalitzar el seu propi splicing a partir de la molècula pre-ARNm. Els introns del grup I poden tenir uns quants centenars a tres mil nucleòtids. A més, presenten poca semblança de seqüències entre els organismes.
Figura 01: introns del grup I
Les estructures secundàries estan molt conservades en quatre regions curtes. Hi ha dos passos de reacció de transesterificació d'empalmament. Els introns del grup I inicien el mecanisme d'empalmament per l'atac nucleòfil de l'hidroxil 3' d'un cofactor de guanosina al lloc d'empalmament 5P.
Què són els introns del grup II?
Els introns del grup II són un tipus d'introns autoempalmes que es troben en organismes que pertanyen als tres dominis. Són ribozims que catalitzen les seves pròpies reaccions d'splicing a partir del pre-ARNm. Es troben en ARNr, ARNt i gens codificants de proteïnes. Però no es troben als genomes nuclears, a diferència dels introns del grup I.
Figura 02: introns del grup II
Els introns del grup II catalitzen l'empalmament mitjançant dos passos de transesterificació similars als introns del grup I. Aquests enzims inicien la reacció d'empalmament per l'atac nucleòfil de 2′ OH de l'adenosina del lloc de la branca a la unió d'empalmament 5′. Durant les reaccions d'empalmament, els introns del grup II formen una estructura semblant a lariat. A més, l'empalmament d'introns té lloc en absència de GTP.
Quines similituds hi ha entre els introns del grup I i del grup II?
- Els introns del grup I i del grup II són dos tipus d'enzims d'ARN, ribozims que catalitzen el seu propi splicing mitjançant diferents mecanismes.
- Són ribozims grans.
- Tots dos es troben als tres dominis.
- Són elements mòbils.
- A més, es troben en l'ARNr, l'ARNt i els gens que codifiquen proteïnes.
- Ambdós enzims s'estan utilitzant com a eines en biotecnologia i medicina molecular per a sistemes d'eliminació/eliminació de gens dirigits, lliurament de gens o sistemes de teràpia gènica.
Quina diferència hi ha entre els introns del grup I i del grup II?
Els introns del grup I són ribozims que es troben en bacteris, bacteriòfags i genomes orgànics i nuclears eucariotes. Els introns del grup II són ribozims que es troben en bacteris, arquees i orgànuls eucariotes. A més, els introns del grup I inicien la reacció d'empalmament per l'atac nucleòfil de l'hidroxil 3' d'un cofactor de guanosina al lloc d'empalmament 5P, mentre que els introns del grup II inicien la reacció d'empalmament per l'atac nucleòfil del 2' OH de l'adenosina del lloc de branca a la Unió d'empalmament de 5′. Per tant, aquesta és la diferència clau entre els introns del grup I i del grup II.
A més, els introns del grup II formen una estructura semblant a un lariat durant l'empalmament, mentre que els introns del grup I no es formen. Per tant, aquesta és una altra diferència significativa entre els introns del grup I i del grup II. A més, els introns del grup I es troben en genomes nuclears eucariotes, mentre que els introns del grup II no es troben en genomes nuclears eucariotes.
A sota de la infografia s'enumeren les diferències entre els introns del grup I i del grup II en forma de taula per comparar-les.
Resum – Grup I vs Grup II Introns
Els introns del grup I i II són grans ribozims que catalitzen una reacció de transesterificació per empalmar els introns de la transcripció primària. Es troben en els tres dominis. Tots dos són elements genètics mòbils. A més, s'utilitzen com a eines en biotecnologia i medicina molecular. Tanmateix, els introns del grup I inicien la reacció d'empalmament per l'atac nucleòfil del 3′ OH d'un cofactor de guanosina al lloc d'empalmament 5P. Però, els introns del grup II inicien la reacció d'empalmament per l'atac nucleòfil de l'adenosina 2′ OH del lloc de branca a la unió d'empalmament 5′. A més, els introns del grup II formen una estructura semblant a lariat durant l'empalmament, mentre que els introns del grup I no formen una estructura semblant a lariat. Per tant, aquest és el resum de la diferència entre els introns del grup I i del grup II.
