La diferència clau entre NGS i WGS és que la seqüenciació de propera generació (NGS) és una tecnologia de seqüenciació de segona generació massivament paral·lela que és d' alt rendiment, baix cost i ràpida, mentre que la seqüenciació de genoma sencer (WGS) és un mètode complet per analitzar tot l'ADN genòmic d'una cèl·lula alhora mitjançant tècniques de seqüenciació com ara la seqüenciació Sanger, l'enfocament amb escopeta o la seqüenciació NGS d' alt rendiment.
En les últimes dècades, la comprensió del genoma dels humans i altres animals ha augmentat massivament a causa del descobriment de tècniques de seqüenciació ràpida i eines bioinformàtiques. Les tècniques de seqüenciació convencionals, com la seqüenciació de Sanger, tenien les seves limitacions, la qual cosa va requerir el desenvolupament de nous mètodes de seqüenciació ràpida com ara la seqüenciació de nova generació (NGS) i la seqüenciació de nanopors. La tècnica de seqüenciació del genoma sencer (WGS) és un enfocament recent que ja s'utilitza en molts projectes d'investigació genòmica, com ara el projecte genòmic 100.000 de Genomic England, Regne Unit. Així, NGS i WGS són dos mètodes de seqüenciació que s'estan incorporant actualment en molts projectes genòmics.
Què és NGS?
NGS (seqüenciació de nova generació) és una tecnologia de seqüenciació de segona generació massivament paral·lela que té un alt rendiment, un baix cost i una velocitat. No hi ha una definició precisa per a la seqüenciació de nova generació. Però el podem distingir clarament de les tècniques de seqüenciació convencionals basades en capil·lars. La seqüenciació de nova generació permet seqüenciar una molècula d'ADN amb una mida total superior a 1 milió de parells de bases en un sol experiment. Ofereix una velocitat sense precedents i opcions de gran rendiment, com ara permetre la seqüenciació de l'ADN de diversos individus alhora. Això s'aconsegueix miniaturitzant el volum de les reaccions de seqüenciació individuals. A més, això també limita la mida dels instruments i minimitza el cost dels reactius per reacció.
Figura 01: plataformes NGS
NGS és un mètode de seqüenciació de lectura curta que ja ha revolucionat el camp de la investigació biològica. A més, NGS s'aplica en diverses àrees com la seqüenciació del genoma de novo, la seqüenciació del genoma sencer, l'anàlisi del transcriptoma, la seqüenciació d'ARN petit i micro ARN, la reseqüenciació dirigida i la seqüenciació de l'exoma sencer.
Què és WGS?
WGS (seqüenciació del genoma sencer) és un mètode complet per analitzar tot l'ADN genòmic d'una cèl·lula alhora mitjançant tècniques de seqüenciació com ara la seqüenciació Sanger, l'enfocament amb escopeta o la seqüenciació NGS d' alt rendiment. També es coneix com a seqüenciació completa del genoma o seqüenciació completa del genoma. La seqüenciació del genoma sencer implica la seqüenciació de tot l'ADN cromosòmic d'un organisme, així com l'ADN dels mitocondris i, per a les plantes, l'ADN del cloroplast alhora. WGS permet als científics llegir la seqüència exacta de totes les lletres que formen el conjunt complet d'ADN. S'espera que WGS que utilitza la plataforma NGS revolucioni la configuració clínica.
Figura 02: seqüenciació WGS vs escopeta jeràrquica
La seqüenciació del genoma sencer es va introduir a l'atenció clínica l'any 2014. A més, l'aplicació de WGS implica la seqüenciació de gens a nivell SNP per identificar variants funcionals en estudis d'associació, intervenció terapèutica en medicina personalitzada, biologia evolutiva, anàlisi genòmica comparada., estudis de mutacions i reordenaments, estudis d'associació de variants rares i predicció de la susceptibilitat a la mal altia i la resposta als fàrmacs.
Quines similituds hi ha entre NGS i WGS?
- NGS i WGS són dues tècniques de seqüenciació.
- Les dues tècniques seqüencien l'ADN o l'ARN.
- Aquestes tècniques són noves i fiables.
- Tots dos s'utilitzen per al diagnòstic de mal alties i el descobriment de fàrmacs.
Quina diferència hi ha entre NGS i WGS?
NGS és una tecnologia de seqüenciació de segona generació massivament paral·lela que és d' alt rendiment, baix cost i ràpid, mentre que WGS és un mètode complet per analitzar tot l'ADN genòmic d'una cèl·lula alhora mitjançant tècniques de seqüenciació com ara com la seqüenciació Sanger, l'aproximació amb escopeta o la seqüenciació NGS d' alt rendiment. Per tant, aquesta és la diferència clau entre NGS i WGS. A més, NGS només consta de mètodes de seqüenciació de segona generació, mentre que WGS consta de mètodes de seqüenciació de primera, segona i tercera generació.
La taula següent presenta les diferències entre i NGS i WGS en forma de taula per comparar-les.
Resum: NGS vs WGS
En les últimes dècades, s'han aplicat rutinàriament diferents tècniques de seqüenciació en la investigació molecular contemporània. I fins i tot són eines molt potents per a moltes aplicacions clíniques. NGS i WGS són dos mètodes de seqüenciació que s'estan incorporant actualment en molts projectes genòmics. NGS és una tecnologia de seqüenciació de segona generació d' alt rendiment, baix cost i ràpida. D' altra banda, WGS és un mètode per analitzar tot l'ADN genòmic o l'ADN genòmic complet d'una cèl·lula alhora mitjançant tècniques de seqüenciació com ara la seqüenciació Sanger, l'enfocament amb escopeta o la seqüenciació NGS d' alt rendiment. Per tant, aquest és el resum de la diferència entre NGS i WGS.
