La diferència clau entre ITS1 i ITS2 és que ITS1 és un ADN espaiador situat entre els gens d'ARNr 18S i 5,8S en eucariotes, mentre que ITS2 és un ADN espaiador situat entre els gens d'ARNr 5,8S i 28S en eucariotes.
L'espaiador transcrit intern (ITS) és l'ADN espaiador situat normalment entre els gens de l'ARN ribosòmic de subunitats petites i els gens de l'ARN ribosòmic de subunitats grans al cromosoma o a la regió transcrita corresponent a la molècula de transcripció del precursor de l'ARNr policistrònic. En els bacteris i les arquees, només hi ha un sol ITS entre els gens d'ARNr 16S i 23S. Però als eucariotes, hi ha dos ADN espaiador ITS: ITS1 (entre 18S i 5.gens 8S rRNA) i ITS2 (entre 5.8S i 28S rRNA). Per tant, ITS1 i ITS2 són dos ADN espaiadors que es troben entre els gens d'ARNr en eucariotes.
Què és ITS1?
ITS1 és un ADN espaiador situat entre els gens d'ARNr 18S i 5.8S en eucariotes. ITS es refereix a una peça d'ADN espaiador no funcional situada entre els gens de l'ARNr. ITS1 té una major variació de longitud que ITS2. La variació de longitud d'ITS1 és d'aproximadament (200-300 pb). Els marcadors ITS com ITS1 han demostrat la seva eficiència per dilucidar les relacions filogenètiques entre diferents tàxons. A més, l'ADN espaiador ITS1 està menys conservat que l'ADN espaiador ITS2. Les estructures ITS1 només es conserven en unitats taxonòmices molt més petites. Cada cúmul de ribosomes eucariotes també conté regions anomenades espaiadors transcrits externs (ETS de 5’ i 3’).
Figura 01: regió ITS1
L'ADN espaiador ITS1 està molt a prop de l'espaiador transcrit extern de 5' (ETS de 5'). A més, si algú vol amplificar la regió ITS1 per a estudis de relacions filogenètiques, ha d'utilitzar un parell d'encebadors específics (primers inversos i directes) per a aquest propòsit. Per amplificar la regió ITS1, normalment s'utilitzen dos conjunts d'imprimadors als protocols de PCR dels laboratoris. Són ITS1 cap endavant i ITS2 cap enrere o ITS1 cap endavant i ITS4 cap enrere.
Què és ITS2?
ITS2 és un ADN espaiador situat entre els gens d'ARNr 5.8S i 28S en eucariotes. La regió ITS2 té una variació de longitud més curta que la regió ITS1. La variació de longitud d'ITS2 és aproximadament (180-240 pb). Tanmateix, la regió ITS2 està més conservada que la regió ITS1 en moltes unitats taxonòmices. Identifica que totes les seqüències ITS2 comparteixen un nucli comú de l'estructura secundària. A més, el 40% de la regió ITS2 es conserva entre totes les angiospermes, mentre que és possible alinear el 50% de la regió ITS2 a nivell familiar i superior.
Figura 02: regió ITS2
Independentment de l'abast de conservació, l'ús de la regió ITS2 també és molt popular, com ara la regió ITS1, en estudis de relacions filogenètiques, especialment en codis de barres d'ADN de fongs. Per amplificar la regió ITS2, generalment s'utilitza un conjunt d'imprimadors específics en els protocols de PCR dels laboratoris. Això és ITS1 cap endavant i ITS4 invers. Però quan el protocol de PCR utilitza aquest conjunt d'imprimadors, també amplifica la regió ITS1 juntament amb la regió ITS2. A més, l'ADN espaiador ITS2 està molt a prop de l'espaiador transcrit extern de 3' (ETS de 3').
Similituds entre ITS1 i ITS2
- ITS1 i ITS2 són dos ADN espaiadors situats entre els gens de l'ARNr.
- Només estan presents en eucariotes.
- Tots dos es poden amplificar utilitzant parells d'imprimadors específics.
- Tots dos s'extreuen en la maduració de l'ARNr com a subproductes no funcionals.
- Tots dos són molt importants per als estudis de relacions filogenètiques, especialment en els codis de barres de l'ADN dels fongs.
Diferència entre ITS1 i ITS2
ITS1 és un ADN espaiador present entre els gens d'ARNr 18S i 5,8S en eucariotes, mentre que ITS2 és un ADN espaiador situat entre els gens d'ARNr 5,8S i 28S en eucariotes. Per tant, aquesta és la diferència clau entre ITS1 i ITS2. A més, ITS1 té una major variació de longitud en comparació amb ITS2. D' altra banda, ITS2 té una variació de longitud més curta en comparació amb ITS1. Aquesta és una altra diferència entre ITS1 i ITS2.
La infografia següent mostra les diferències entre ITS1 i ITS2 en forma de taula per comparar-les.
Resum: ITS1 vs ITS2
La regió interna transcrita (ITS) és una peça no funcional d'ADN espaiador situat entre els gens de l'ARNr. En bacteris i arquees, només hi ha una sola regió ITS. Però als eucariotes, hi ha dues regions ITS: ITS1 i ITS2. ITS1 és un ADN espaiador que es troba entre els gens d'ARNr 18S i 5,8S en eucariotes, mentre que ITS2 és un ADN espaiador que es troba entre els gens d'ARNr 5,8S i 28S en eucariotes. Per tant, aquest és el resum de la diferència entre ITS1 i ITS2.
