La diferència clau entre la seqüència de Shine Dalgarno i la de Kozak és que la seqüència de Shine Dalgarno és un lloc d'unió ribosòmica a l'ARN missatger bacterià i arqueo, mentre que la seqüència de Kozak és un lloc d'iniciació de la traducció de proteïnes en la majoria dels ARN missatgers eucariotes.
La seqüència de Shine Dalgarno i Kozak són dues seqüències de consens molt importants per a l'inici de la traducció. En biologia molecular, la traducció és el procés pel qual els ribosomes del citoplasma sintetitzen proteïnes després del procés de transcripció. En traducció, un ARNm (ARN missatger) es descodifica en un ribosoma per produir una cadena d'aminoàcids específica fora del nucli. Normalment, un ribosoma indueix el procés de descodificació facilitant la unió de seqüències d'anticodons d'ARNt complementàries als codons d'ARNm. La traducció transcorre en tres etapes: iniciació, allargament i terminació.
Què és la seqüència Shine Dalgarno?
La seqüència Shine Dalgarno és un lloc d'unió ribosòmica a l'ARN missatger bacterià i arqueològic. Generalment es troba al voltant de 8 bases aigües amunt del codó d'inici AUG. Aquesta seqüència d'ARN ajuda a reclutar ribosomes a l'ARN missatger alineant el ribosoma amb un codó d'inici d'ARNm. Per tant, inicia la síntesi de proteïnes. Un cop després del reclutament, l'ARNt pot afegir aminoàcids en seqüència segons el dictat pels codons de l'ARNm. Aquesta seqüència especial és comuna en bacteris però més rara en arquea. A més, també està present en les transcripcions de cloroplasts i mitocondrials. La seqüència de Shine Dalgarno va ser proposada per primera vegada pels científics australians John Shine i Lynn Dalgarno. La seqüència de consens de sis bases és AGGAGG. Per exemple, a Escherichia coli la seqüència és AGGAGGU.
Figura 01: Seqüència Shine Dalgarno
La selecció del lloc d'iniciació (AUG) depèn de la interacció entre la subunitat 30S del ribosoma i la plantilla d'ARNm. La regió rica en pirimidines del component 16srRNA de la subunitat 30S s'uneix a la regió rica en purines coneguda com a seqüència de Shine Dalgarno aigües amunt del codó d'iniciació AUG a l'ARNm. A més, durant la formació del complex d'iniciació, aquestes seqüències de nucleòtids complementàries s'aparellen per formar una estructura d'ARN de doble cadena. Això facilita la unió de l'ARNm a un ribosoma de tal manera que el codó d'inici es col·loca al lloc P del ribosoma.
Què és la seqüència de Kozak?
La seqüència de Kozak és un lloc d'iniciació de la traducció de proteïnes en la majoria d'ARNm eucariotes. Aquesta seqüència també s'anomena seqüència de consens de Kozak. La seqüència de Kozak és la seqüència òptima per iniciar la traducció en eucariotes. Aquesta seqüència és un aspecte integral de la regulació de proteïnes. També és molt important per a la salut cel·lular en general. Ajuda a corregir la traducció de proteïnes dels missatges genètics mitjançant la mediació de l'assemblatge de ribosomes i l'inici de la traducció.
Figura 02: seqüència de Kozak
Aquesta seqüència va rebre el nom de la científica que la va descobrir, Marilyn Kozak. La va descobrir mitjançant una anàlisi detallada de seqüències genòmiques d'ADN. La seqüència de Kozak és 5' (gcc) gccRccAUGG-3'. Les lletres majúscules indiquen bases conservades, mentre que les lletres minúscules indiquen bases variables comunes. R indica una purina (adenina o guanina) que sempre es col·loca en aquesta ubicació.
Quines similituds hi ha entre la seqüència Shine Dalgarno i Kozak?
- La seqüència de Shine Dalgarno i Kozak són dues seqüències de consens molt importants en l'inici de la traducció.
- Tots dos són seqüències d'ARN.
- La subunitat més petita del ribosoma s'uneix a les dues seqüències.
- Les dues seqüències medien el muntatge adequat del ribosome i l'inici de la traducció.
- Són aspectes integrals de la regulació de proteïnes i la salut cel·lular en general.
Quina diferència hi ha entre la seqüència Shine Dalgarno i Kozak?
La seqüència Shine Dalgarno és un lloc d'unió ribosòmica que es troba a l'ARN missatger bacterià i arqueo, mentre que la seqüència de Kozak és un lloc d'iniciació de la traducció de proteïnes que es troba a la majoria de l'ARN missatger eucariota. Per tant, aquesta és la diferència clau entre la seqüència de Shine Dalgarno i Kozak. A més, la seqüència de Shine Dalgarno és 5'AGGAGGU3' mentre que la seqüència de Kozak és 5' (gcc) gccRccAUGG-3'.
La següent infografia mostra les diferències entre la seqüència de Shine Dalgarno i Kozak en forma de taula per comparar-les una al costat de l' altra.
Resum: seqüència Shine Dalgarno vs Kozak
Les seqüències Shine Dalgarno i Kozak són dues seqüències d'ARN consensuades que són molt importants per al muntatge de ribosomes i l'inici de la traducció. La seqüència de Shine Dalgarno és un lloc d'unió ribosòmica a l'ARN missatger bacterià i arqueo, mentre que la seqüència de Kozak és un lloc d'inici de la traducció de proteïnes en la majoria de l'ARN missatger eucariota. Així, això resumeix la diferència entre la seqüència de Shine Dalgarno i Kozak.
