La diferència clau entre la seqüència conservada i la seqüència consens és que la seqüència conservada es refereix a seqüències similars d'àcids nucleics o aminoàcids que es troben en espècies diferents o iguals al llarg de generacions, mentre que la seqüència de consens és una seqüència de nucleòtids o seqüència d'aminoàcids que es troba habitualment. en una regió altament conservada d'ADN, ARN o proteïnes.
Els organismes comparteixen característiques semblants i diferents. A l'hora d'estudiar les relacions entre organismes i classificar-les, és molt important el genoma o la composició genètica dels organismes. Hi ha algunes seqüències de nucleòtids o aminoàcids que són comunes entre diferents organismes. Una seqüència conservada és un àcid nucleic o una seqüència d'aminoàcids que és coherent entre les espècies. Per tant, són filogenèticament importants a l'hora de generar arbres filogenètics. A les seqüències conservades, hi ha seqüències de nucleòtids específiques que es troben amb més freqüència. Es coneixen com a seqüències de consens.
Què és la seqüència conservada?
Una seqüència conservada és una seqüència d'àcids nucleics o una seqüència d'aminoàcids que és similar entre les espècies. Per tant, és coherent entre les espècies al llarg de l'evolució. En general, aquestes seqüències es mantenen per selecció natural. Es mantenen sense canvis molt amunt de l'arbre filogenètic. Per tant, les seqüències conservades són importants en la construcció d'arbres filogenètics. Es creu que les seqüències molt conservades sovint tenen un valor funcional important. També són útils per identificar mal alties genètiques. Tanmateix, les seqüències conservades poden ser seqüències d'àcids nucleics codificants o no codificants. A més, les seqüències conservades mostren taxes de mutació més lentes. Per tant, mostren canvis molt mínims en la seva composició; de vegades, no mostren canvis al llarg de les generacions.
Figura 01: seqüència conservada
Els components d'ARN dels ribosomes estan presents en tots els dominis de la vida, les seqüències d'homeobox en eucariotes i l'ARNt en bacteris són diversos exemples de seqüències altament conservades. La identificació de seqüències conservades és fàcil quan s'utilitzen enfocaments bioinformàtics, especialment l'eina d'alineació de seqüències. A més, l'alineació de múltiples seqüències facilita la visualització de seqüències conservades.
Què és la seqüència de consens?
Una seqüència consens és una seqüència que es troba habitualment en una determinada regió conservada d'ADN o ARN. És una seqüència de nucleòtids molt específica. Com a exemple, hi ha una seqüència consens al -10 com a TATAAT (caixa Pribnow) en els promotors d'E. coli, que són seqüències molt conservades. De la mateixa manera, hi ha una altra seqüència de consens: TTGACA en els promotors d'E. coli també al -35. Les seqüències de consens també es coneixen com a "caixes".
Figura 02: seqüència de consens
A més de l'ADN i l'ARN, les proteïnes també tenen seqüències consensuades d'aminoàcids. Els llocs d'unió de proteïnes solen estar representats per seqüències consensuades. Els enzims de restricció també tenen seqüències consensuades. A més, els llocs d'empalmament també són seqüències de consens. De manera semblant a les seqüències conservades, les seqüències de consens es poden calcular i visualitzar mitjançant eines bioinformàtiques.
Quines són les similituds entre la seqüència conservada i la seqüència consensuada?
- Les seqüències conservades i consensuades són seqüències d'àcids nucleics o d'aminoàcids que són comunes a totes les espècies.
- Tant les seqüències conservades com les de consens es poden visualitzar mitjançant eines bioinformàtiques.
- S'utilitzen àmpliament en biologia molecular.
Quina diferència hi ha entre la seqüència conservada i la consensuada?
La seqüència conservada és un àcid nucleic o una seqüència d'aminoàcids que és coherent entre les espècies, mentre que les seqüències de consens són molt específiques i es troben habitualment bases o aminoàcids en una regió conservada determinada. Per tant, aquesta és la diferència clau entre la seqüència conservada i la seqüència consensuada. A més, una altra diferència entre la seqüència conservada i la de consens és que les seqüències conservades són filogenèticament importants, mentre que les seqüències de consens solen ser llocs d'unió a proteïnes, llocs d'empalmament, llocs de tall d'enzims de restricció, etc.
Resum: seqüència conservada vs consens
Les seqüències conservades són les seqüències d'àcids nucleics o proteïnes que són similars entre les espècies vives. Un promotor, un lloc d'unió al ribosoma, un origen de replicació i una seqüència d'aminoàcids de la proteïna histona són diversos exemples de seqüències conservades. En canvi, les seqüències de consens són bases o aminoàcids específics que es troben més comunament en una seqüència conservada determinada. La caixa -10, la caixa -35 del promotor d'E. coli, els llocs d'unió de proteïnes, els llocs d'empalmament i els llocs de reconeixement d'enzims de restricció són diversos exemples de seqüències de consens. Per tant, aquest és el resum de la diferència entre la seqüència conservada i la seqüència consensuada.
