Diferència clau: transposases bacterianes i integrases retrovirals
El material genètic transportable ha evolucionat amb dues estratègies principals per passar d'una regió a la següent regió dins i entre els genomes. Un mètode és desplaçar-se a través d'una molècula d'ARN abans de la formació d'una molècula d'ADN, mentre que l' altra via implica intermedis d'ADN. Les transposases i les integrases virals són exemples d'aquest material genètic transposable. Les transposases bacterianes s'uneixen a l'extrem dels transposons i faciliten la catàlisi del moviment dels transposons a una altra part del genoma mitjançant diversos mecanismes. Les integrases retrovirals són enzims que ajuden a la integració del material genètic del retrovirus com el VIH en el material genètic (ADN) de la cèl·lula hoste que infecta. Aquesta és la diferència clau entre les transposases bacterianes i les integrases retrovirals.
Què són les transposases bacterianes?
La La transposasa es pot definir com un enzim lligat a l'extrem dels transposons que faciliten la catàlisi del moviment del transposó a una altra part del genoma mitjançant diversos mecanismes. Aquests mecanismes inclouen el "mecanisme de retallar i enganxar" i el "mecanisme de transposició replicatiu". La transposasa es va introduir per primera vegada mitjançant la clonació de l'enzim que es necessita per a la transposició del transposó Tn3. Els elements genètics transposables han utilitzat dues estratègies importants per al desplaçament entre genomes o d'un lloc a un altre. El transport a través d'un intermedi d'ARN abans de la síntesi d'una còpia d'ADN és una estratègia, mentre que l' altra s'uneix només als intermedis d'ADN. Les reaccions de recombinació que estan implicades en la integració d'ambdós elements es produeixen a causa d'enzims específics d'elements. Així, en una instància d'elements d'ADN, aquests enzims es coneixen com a transposases, mentre que en una instància d'elements d'ARN, es coneixen com a integrases.
Quan es comparen les diferències entre ambdues estratègies de transposició, sembla que el procés d'inserció és idèntic químicament. Però, l'evidència recent proposa que certes similituds en el mecanisme d'integració es veuen a les regions de seqüències d'aminoàcids que formen un lloc actiu; el motiu DDE. Actualment s'estan classificant cinc famílies de transposases, però el nombre de famílies encara no ha augmentat amb nous caràcters de transposases. Les famílies inclouen la transposasa DDE, la transposasa de tirosina (Y), la transposasa de serina (S), la transposasa de cercle rodant, les transcriptases inverses/endonucleases (RT/En), etc. Aquestes famílies utilitzen mecanismes catalítics únics per trencar i reunir l'ADN. La transposasa DDE participa en el mecanisme de tallar i enganxar del transposó original i porta tres conjunts d'aminoàcids conservats, és a dir; aspartat (D), aspartat (D) i glutamat (E). Les transposases de tirosina també participen en el mecanisme de tallar i enganxar mitjançant la utilització de residus de tirosina, que és específic del lloc.
Figura 01: Transposases bacterianes
Les transposases de serina impliquen un intermedi d'ADN circular i duen a terme el mecanisme de tallar i enganxar igual que les famílies anteriors. La transposasa del cercle rodant implica el mecanisme de còpia en què una sola cadena es copia directament al lloc objectiu mitjançant la replicació de l'ADN. Això garanteix que la cadena de plantilla i la cadena copiada tinguin una cadena que s'acaba de sintetitzar. La transcriptasa inversa/endonucleases transposasa té diversos mecanismes de transposició.
Què són les integrases retrovirals?
En el context de la retroviral integrasa, es considera un enzim retroviral que ajuda a la integració del material genètic de retrovirus com el VIH en el material genètic (ADN) de la cèl·lula que està infectada. Aquestes integrases retrovirals sovint es confonen amb integrases de fags. Exemples d'integrases de fags són la integrasa de fags λ. Però aquests són enzims completament diferents i no s'han de confondre. Pel que fa a la formació del complex de preintegració retroviral, la integrasa retroviral té un paper important. Les proteïnes d'integrasa retroviral consisteixen típicament en tres (03) dominis canònics. Aquests dominis estan connectats mitjançant enllaçadors flexibles.
Els tres dominis inclouen un domini d'unió de zinc N terminal on es connecten i s'estabilitzen tres paquets helicoïdals mitjançant la coordinació amb la implicació d'un catió Zn2+, un plec RNasa H domini del nucli catalític i un domini d'unió a l'ADN C terminal, que és un plec SH3. Mitjançant la investigació i mitjançant la informació bioquímica i estructural, suggereix que la integrasa retroviral té la capacitat de funcionar com un dímer de dimmers (tetràmer). En el context de la multimerització i la unió a l'ADN viral, els tres dominis de la proteïna retroviral integrasa. La funció principal de la integrasa retroviral és inserir el seu material genètic per allotjar l'ADN. Aquest pas és el pas més crucial en la replicació viral del virus del VIH. Un cop integrat amb èxit, estarà a l'ADN cromosòmic de la cèl·lula durant la resta de la seva vida útil.
Figura 02: Integrases retrovirals
Per tant, un cop integrat no hi ha retorn per a la cel·la. Aquestes integrases retrovirals impliquen la catalització de dues reaccions principals, inclosa el processament de l'extrem 3' i la lligadura covalent. Durant el processament de l'extrem 3', s'eliminen 2-3 nucleòtids dels dos extrems 3' de l'ADN viral amb la intenció de revelar els dinucleòtids CA dels extrems 3' de l'ADN viral, i durant la lligadura covalent, els extrems 3' processats de L'ADN viral s'uneix de manera covalent a l'ADN cromosòmic hoste.
Quina semblança hi ha entre les transposases bacterianes i les integrases retrovirals?
Tant les transposases bacterianes com les integrases retrovirals tenen seqüències d'aminoàcids similars
Quina diferència hi ha entre les transposases bacterianes i les integrases retrovirals?
Transposases bacterianes versus integrases retrovirals |
|
| La transposasa bacteriana és un enzim lligat a l'extrem dels transposons alhora que facilita la catàlisi del moviment dels transposons a una altra part del genoma mitjançant diversos mecanismes. | Les integrases retrovirals es consideren un enzim retroviral que ajuda a la integració del material genètic de retrovirus com el VIH en el material genètic (ADN) de la cèl·lula que està infectada. |
| regions vinculants | |
| Es necessiten regions d'unió específiques elevades per a les transposases bacterianes. | Es necessita menys o cap seqüència de nucleòtids per a la unió. |
Resum: transposases bacterianes versus integrases retrovirals
Les transposases bacterianes es consideren un enzim retroviral que ajuda a la integració del material genètic de retrovirus com el VIH en el material genètic (ADN) de la cèl·lula que està infectada. Els elements genètics transposables han utilitzat dues estratègies importants per al desplaçament entre genomes o d'un lloc a un altre. Actualment s'estan classificant cinc famílies de transposases, però el nombre de famílies encara no ha augmentat amb nous caràcters de transposases. Integrasa retroviral, es considera un enzim retroviral que ajuda a la integració del material genètic del retrovirus com el VIH en el material genètic (ADN) de la cèl·lula infectada. Les proteïnes d'integrasa retroviral consisteixen típicament en tres (03) dominis canònics. La funció principal de la integrasa retroviral és inserir el seu material genètic per allotjar l'ADN. Aquest pas és el pas més crucial en la replicació viral del virus del VIH. Per tant, un cop integrat no hi ha retorn per a la cèl·lula. Aquesta és la diferència entre les transposases bacterianes i la integrasa retroviral.
Descarregueu el PDF de transposases bacterianes vs integrases retrovirals
Podeu descarregar la versió PDF d'aquest article i utilitzar-la per a finalitats fora de línia segons la nota de citació. Si us plau, descarregueu la versió PDF aquí: Diferència entre transposases bacterianes i integrases retrovirals
