La diferència clau entre el knockout genètic i el knockdown és que el gen knockout és una tècnica on el gen d'interès s'elimina completament (estat inoperatiu) per estudiar les funcions del gen, mentre que el knockout del gen és una altra tècnica on el gen de es silencia l'interès per investigar el paper del gen en particular en un sistema biològic.
Hi ha diferents tècniques genètiques en funcionament per investigar el funcionament dels gens dins dels sistemes biològics vius. El knockout genètic i el knockdown són dues d'aquestes tècniques. Aquestes tècniques ajuden els científics a identificar aspectes funcionals de diferents gens en organismes vius.
Què és Gene Knockout?
El knockout genètic és una tècnica genètica que fa que un o més gens no funcionin en els organismes vius. Aquest també és un procés d'apagar o eliminar un gen d'un organisme. L'aplicació principal d'aquesta tècnica és estudiar la funció dels gens. El procés avalua l'efecte del gen perdut o eliminat. El procés d'eliminació també implica certs enzims i tècniques d'empalmament.
Figura 01: Gen Knockout
Hi ha poques variacions en la tècnica d'eliminació de gens en funció del nombre de gens implicats. Són doble knockout (knockout de dos gens), triple knockout (knockout de tres gens) i quàdruple knockout (knockout de quatre gens). El nocaut genètic es classifica a més en dos grups; nocauts heterozigots i nocauts homozigots.
Què és Gene Knockdown?
El derrocament de gens és un procediment experimental on aquest procediment suprimeix o redueix l'expressió d'un gen o gens concrets d'un organisme. El silenciament gènic és la definició comuna per a la derrota gènica. Durant aquest procediment, l'activació o la degradació de l'ARNm produït implica interferència d'ARN (ARNi), ARN interferent petit (siRNA) i ARN de forquilla curta (shRNA).
Figura 02: silenciament genètic
L'ús principal de la derrota gènica és investigar el paper d'un gen en particular en el sistema biològic. Per tant, aquesta tècnica aconsegueix l'estudi dels oncogens (Bcl-2 i P53) i dels gens que causen mal alties neurològiques, infeccions víriques i mal alties hereditàries.
Quines similituds hi ha entre Gene Knockout i Knockdown?
- Tant l'eliminació de gens com la destrucció de gens són tècniques genètiques.
- Aquestes dues tècniques poden prevenir l'expressió gènica.
- L'ús principal d'ambdues tècniques és investigar la funció del gen d'interès.
- Tots dos són capaços d'identificar diferents mal alties (genètiques).
- Tots dos es podrien utilitzar per a un o més gens d'interès.
Quina diferència hi ha entre Gene Knockout i Knockdown?
Gene Knockout vs Knockdown |
|
| Gene knockout és l'operació de gens (eliminació de gens de l'ADN) d'un organisme mitjançant diferents tècniques genètiques. | El derrocament de gens és un procediment experimental per suprimir (reduir o silenciar) l'expressió d'un gen o gens concrets d'un organisme. |
| Funció | |
| Facilita l'estudi de les funcions dels gens mitjançant l'anàlisi dels resultats del gen perdut. | Facilita l'estudi dels oncogens, gens que causen mal alties neurològiques, infeccions víriques i mal alties hereditàries. |
| Implicació d'agents d'ARN | |
| La implicació d'agents d'ARN és insignificant en aquesta tècnica. | El procés implica agents com ara siRNA, shRNA i RNAi per inactivar l'ARNm. |
| Ús d'agents químics | |
| S'utilitzen agents enzimàtics. | No s'utilitzen aquests agents químics. |
| Efecte en el gen | |
| Elimina completament el gen de l'ADN. | Suprimir o silenciar el gen. |
| Classificació | |
| El doble knockout, el triple knockout i el quàdruple knockout i el knockout heterozigot i homozigot són diferents tipus de knockout genètic. | No hi ha aquests sistemes de classificació disponibles per al silenciament gènic. |
Resum: Gene Knockout vs Gene Knockdown
Les dues tècniques que hem comentat aquí; el knockout i el knockdown de gens, són mètodes per investigar les funcions de diferents gens. L'eliminació gènica fa que el gen sigui completament inoperatiu, mentre que l'eliminació gènica silencia el gen d'interès. Tanmateix, ambdós procediments impedeixen l'expressió gènica. Diferents agents són capaços de realitzar aquests dos processos. L'eliminació de gens és un tipus de supressió, mentre que la destrucció de gens és un tipus d'inactivació. Aquesta és la diferència entre el knock out genètic i el knockdown.
