La diferència clau entre l'ADN genòmic i l'aïllament de l'ADN plasmidi és que l'aïllament de l'ADN genòmic s'adreça a l'extracció d'ADN genòmic mentre que l'aïllament de l'ADN plasmidi s'orienta a l'extracció de l'ADN plasmidi dels bacteris.
L'aïllament de l'ADN és un procés químic que s'utilitza per aïllar l'ADN de diferents espècies o de diferents mostres. L'aïllament de l'ADN és important en les tècniques de biologia molecular aigües avall, com ara l'electroforesi en gel, la reacció en cadena de la polimerasa i les tècniques de seqüenciació d'ADN. Per tant, l'aïllament de l'ADN és un procés químic essencial en estudis de biologia molecular. En funció del propòsit de la investigació, de vegades és necessari aïllar l'ADN genòmic. A més, alguns estudis se centren en aïllar l'ADN plasmidi dels bacteris. L'aïllament de l'ADN genòmic és el procés d'aïllar l'ADN genòmic d'una mostra procariota o eucariota. Els passos d'aïllament difereixen segons el tipus de cèl·lula en què s'aïlla l'ADN. L'aïllament de l'ADN plasmidi és el procés d'aïllar l'ADN plasmidi d'una cèl·lula bacteriana. En comparació amb l'aïllament de l'ADN genòmic, el procés global és complex en l'aïllament de l'ADN plasmidi.
Què és l'aïllament de l'ADN genòmic?
L'aïllament de l'ADN genòmic és el procés d'extracció d'ADN genòmic sencer d'un organisme. Aquest procés particular implica tres esdeveniments principals. Són, lisi cel·lular o lisi nuclear, degradació de proteïnes o proteòlisi i precipitació d'ADN genòmic. El pas de lisi pot variar segons el tipus de cèl·lula. En els procariotes, com que hi ha una paret cel·lular de peptidoglicà, el primer pas hauria de ser la ruptura de la paret cel·lular. D' altra banda, en els eucariotes, l'etapa de lisi implica la ruptura de la membrana plasmàtica i la membrana nuclear per treure l'ADN a l'exterior. En canvi, els passos especials són essencials per lisar les parets cel·lulars de les plantes i dels fongs.
Figura 01: aïllament de l'ADN genòmic
En conseqüència, un cop finalitzat el pas de lisi, finalment l'ADN arribarà al sobrenedant. Simultàniament, la degradació de proteïnes també té lloc a la solució a causa de l'addició de proteïnasa K. El següent pas és separar l'ADN genòmic i les proteïnes degradades entre si. Per tant, les proteïnes degradades se separen per precipitació permetent que l'ADN genòmic romangui al sobrenedant. Després de la precipitació de proteïnes, l'ADN genòmic es pot precipitar i tornar a suspendre en un tampó adequat fins que es requereixi per a l'experiment.
L'ADN genòmic, que és un ADN lineal, conté tota la informació genètica d'un organisme. En altres paraules, el genoma és el material hereditari d'un organisme viu que és responsable de totes les activitats estructurals i funcionals de la cèl·lula. Consisteix en seqüències d'ADN codificants i no codificants. Quan s'aïlla l'ADN genòmic, inclou tot el genoma de l'organisme.
Què és l'aïllament d'ADN plasmidi?
L'aïllament d'ADN plasmidi és un procés especial i més complicat d'aïllament d'ADN. Els plasmidis són ADN extracromosòmic present a la majoria de cèl·lules bacterianes. Són ADN circular latent que dóna suport als bacteris per sobreviure en condicions ambientals dures. L'ADN plasmídic consta de gens resistents especials que proporcionen avantatges addicionals als bacteris, com ara la resistència als antibiòtics, les propietats de virulència i les propietats tòxiques.
Figura 02: Aïllament de l'ADN plasmidi
L'aïllament de l'ADN plasmidi també implica tres processos principals; lisi cel·lular, proteinòlisi i precipitació d'ADN. Tot i que el mecanisme bioquímic d'aïllament és similar al de l'aïllament de l'ADN genòmic, el procés és més complex que ell. El procés de lisi cel·lular és el procés més important d'aquest procediment. El més important és que l'ADN genòmic i l'ADN plasmidi no s'han de barrejar entre ells. Per tant, un procés de lisi molt més suau s'incorpora al procediment d'aïllament de l'ADN plasmidi. Per tant, en la majoria dels procediments d'aïllament d'ADN plasmidi s'utilitza el detergent; dodecilsulfat de sodi per a la lisi cel·lular.
Quines similituds hi ha entre l'ADN genòmic i l'aïllament de l'ADN plasmidi?
- L'aïllament de l'ADN genòmic i l'ADN plasmidi se centren en extreure l'ADN d'un organisme.
- A més, tots dos segueixen el mateix procés global que inclou la lisi cel·lular, la degradació de proteïnes i la precipitació de l'ADN.
- A més, l'ADN resultant d'ambdós processos és important per als processos posteriors.
- A més, ambdós processos d'aïllament inclouen els passos per purificar i emmagatzemar l'ADN en condicions d'emmagatzematge especificades.
- A més, la proteinasa K s'utilitza en ambdós mètodes per degradar proteïnes.
Quina diferència hi ha entre l'aïllament de l'ADN genòmic i l'ADN plasmidi?
L'aïllament de l'ADN genòmic se centra a extreure l'ADN genòmic sencer de l'organisme objectiu, mentre que l'aïllament de l'ADN plasmidi se centra a aïllar només l'ADN plasmidi de l'espècie bacteriana concreta. Per tant, aquesta és la diferència clau entre l'ADN genòmic i l'aïllament de l'ADN plasmidi. A més, una altra diferència entre l'ADN genòmic i l'aïllament de l'ADN plasmidi es troba en el procediment. L'aïllament de l'ADN genòmic és un procediment menys complex en comparació amb l'aïllament de l'ADN plasmidi. Per tant, en aïllar l'ADN plasmídic, cal prendre precaucions per evitar la barreja d'ADN genòmic i plasmidi entre si.
La informació següent proporciona més detalls sobre la diferència entre l'aïllament de l'ADN genòmic i l'ADN plasmidi.
Resum: ADN genòmic i aïllament d'ADN plasmidi
L'aïllament de l'ADN és un procés important en les tècniques de biologia molecular. Hi ha dos tipus d'ADN, a saber, l'ADN genòmic i l'ADN plasmidi (ADN extracromosòmic). En funció del requisit, es van dur a terme alguns procediments per aïllar l'ADN genòmic, mentre que alguns procediments se centren en aïllar només l'ADN plasmídic dels bacteris. Per tant, els passos implicats en ambdós processos difereixen lleugerament entre si. Tanmateix, el procés general és el mateix en ambdós aïllaments. L'ADN aïllat d'ambdós processos té un ús immens en processos posteriors com la clonació, l'electroforesi en gel i les reaccions en cadena de la polimerasa. Al final del protocol d'aïllament de l'ADN genòmic, es pot aïllar tot l'ADN genòmic de l'organisme com a producte final, mentre que al final del protocol d'aïllament de l'ADN plasmidi, es pot aïllar l'ADN plasmidi del bacteri respectiu com a producte final. Per tant, aquesta és la diferència entre l'ADN genòmic i l'aïllament de l'ADN plasmidi.
