La diferència clau entre la terminació dependent de Rho i la terminació independent de Rho és que a la terminació dependent de Rho, el factor Rho s'uneix a la transcripció i acaba la transcripció trencant els enllaços d'hidrogen entre la plantilla i la transcripció, mentre que la terminació independent de Rho acaba la transcripció mitjançant produint una estructura de bucle de forquilla i després una regió rica en U a la transcripció.
La transcripció és una de les dues etapes de l'expressió gènica. És el procés que produeix una seqüència d'ARNm a partir de la informació genètica amagada a la seqüència d'ADN del gen. La transcripció té lloc a través de tres passos: iniciació, allargament i terminació. L'enzim ARN polimerasa s'uneix a la seqüència promotora del gen i comença a catalitzar la síntesi de la cadena d'ARN. Fins que es troba la seqüència del terminador, l'ARN polimerasa afegeix nucleòtids i construeix la cadena d'ARN. En els procariotes, la terminació es produeix mitjançant dues estratègies de terminació principals: la terminació dependent de Rho i la terminació independent de Rho. El factor Rho és una proteïna que té activitat helicasa.
Què és la terminació de dependència de Rho?
La terminació dependent de Rho és un dels dos tipus d'estratègia de terminació de la transcripció que es produeixen en els procariotes. El factor Rho és una proteïna que té activitat helicasa.
Figura 01: Terminació de dependència de Rho
La proteïna Rho s'uneix a la transcripció d'ARN i es mou al llarg de l'ARN polimerasa en direcció 5'-3', afavorint la dissociació dels enllaços d'hidrogen entre la plantilla d'ADN i la transcripció d'ARN. Quan el factor Rho arriba a la bombolla de transcripció, separa l'híbrid d'ADN/ARN i allibera la transcripció de la bombolla de transcripció. Quan això passa, finalitza la transcripció.
Què és la terminació independent de Rho?
La terminació independent de Rho és la segona estratègia que finalitza la transcripció procariota. Normalment, una regió de terminació té una seqüència de repetició invertida. Immediatament després de la seqüència de repetició invertida, hi ha una regió rica en adenina (AAAA). Quan l'ARN polimerasa avança, produeix una seqüència d'ARNm. Com que les dues regions són complementàries a la regió de la seqüència de repetició invertida, forma una estructura de bucle de forquilla a causa dels enllaços d'hidrogen. La propera regió serà la regió rica en U. L'estructura de forquilla deixa l'activitat de l'ARN polimerasa.
Figura 02: Terminació independent de Rho
A més, a les regions riques en U, hi ha interaccions febles entre les bases U de transcripció i les bases A de la plantilla. Aquests enllaços febles adenina-uracil desestabilitzen la plantilla d'ADN i la transcripció d'ARN i se separen mútuament. Al final, la transcripció s'allibera del lloc de transcripció.
Quines similituds hi ha entre la terminació dependent de Rho i la terminació independent de Rho?
- La terminació dependent de Rho i la terminació independent de Rho són dues estratègies de terminació principals que es troben en els procariotes.
- Les dues formes alliberen la transcripció de la plantilla d'ADN per finalitzar la transcripció.
Quina diferència hi ha entre la terminació dependent de Rho i la terminació independent de Rho?
La terminació dependent de Rho està mediada per una proteïna Rho mentre que la terminació independent de Rho es produeix mitjançant la formació d'una estructura de bucle de forquilla. Per tant, aquesta és la diferència clau entre la terminació dependent de Rho i la terminació independent de Rho. A més, la proteïna Rho utilitza energia ATP mentre que la terminació independent Rho no implica la proteïna Rho i no utilitza energia ATP. Per tant, aquesta també és una diferència significativa entre la terminació dependent de Rho i la terminació independent de Rho.
La infografia següent mostra més comparacions relacionades amb la diferència entre la terminació dependent de Rho i la terminació independent de Rho.
Resum: Terminació dependent de Rho vs Rho independent
La terminació dependent de Rho i la terminació independent de Rho són els dos mecanismes principals de terminació de la transcripció que es produeixen en els procariotes. Una proteïna Rho és responsable de la terminació de la transcripció en la terminació dependent de Rho. En canvi, la terminació independent de Rho es produeix mitjançant una formació de l'estructura de bucle de forquilla. Per tant, aquesta és la diferència clau entre la terminació dependent de Rho i la terminació independent de Rho.
