La diferència clau entre el factor sigma i el factor rho és que el factor sigma és una proteïna necessària per iniciar la transcripció en bacteris, mentre que el factor rho és una proteïna necessària per acabar la transcripció en bacteris.
El factor sigma i el factor rho són dos factors importants per a la transcripció bacteriana. La transcripció bacteriana és un procés en què un tros d'ADN bacterià es copia en una cadena d'ARNm (ARN missatger) de nova creació. Aquest procés està catalitzat per un enzim conegut com a ARN polimerasa. Els bacteris depenen molt de la transcripció i la traducció per respondre correctament al seu entorn. L'ARN polimerasa bacteriana consta d'un nucli i una estructura holoenzim. El nucli conté les subunitats β, β′, α i 2ω mentre que l'holoenzim conté el factor sigma. A més, un factor auxiliar de l'ARN polimerasa conegut com a factor rho també és molt important per a la transcripció bacteriana.
Què és Sigma Factor?
El factor sigma o factor d'especificitat és una proteïna necessària per iniciar la transcripció en bacteris. És un factor d'inici de la transcripció bacteriana. Aquest factor permet la unió de l'enzim ARN polimerasa a una regió específica d'ADN anomenada regió promotora durant la transcripció. El factor Sigma és normalment homòleg al factor de transcripció arquea B i al factor de transcripció eucariota TF11B. A més, el factor sigma específic d'un gen determinat varia en funció del gen i dels senyals ambientals. Els promotors són seleccionats per l'ARN polimerasa en funció del factor sigma associat.
Figura 01: Factor Sigma
El factor sigma també es pot trobar al cloroplast de les plantes com a part de la polimerasa codificada per plastids (PEP). El factor sigma i l'ARN polimerasa en conjunt es coneix com a holoenzim de l'ARN polimerasa. El pes molecular del factor sigma és d'uns 70 kDa. Després de l'inici de la transcripció, el factor sigma es dissocia del complex. Aleshores, l'ARN polimerasa continua allargant-se fins que finalitza la transcripció.
Què és el factor Rho?
El factor Rho és una proteïna procariota implicada en la terminació de la transcripció. El factor Rho normalment s'uneix al lloc de pausa del terminador de transcripció. Aquest lloc és una regió exposada de l'ARN monocatenari a prop del marc de lectura obert en seqüències pobres en guanina rica en citosina. És una proteïna de transcripció essencial en procariotes. A Escherichia coli, el factor rho és d'aproximadament 274,6 kDa hexàmer de subunitats idèntiques. Cada subunitat té un domini d'unió a l'ARN i un domini d'hidròlisi d'ATP. A més, la funció del factor rho és l'activitat de l'helicasa.
Figura 02: Factor Rho
El factor Rho s'uneix a la molècula d'ARN i després utilitza la seva activitat ATPasa per proporcionar energia per translocar les molècules d'ARN. El factor Rho duu a terme la translocació fins que arriba a la regió helicoïdal ARN-ADN, on desenrotlla l'estructura dúplex híbrida (ARN-ADN). Aquest procés posa en pausa l'ARN polimerasa al lloc de terminació i finalitza el procés de transcripció.
Quines similituds hi ha entre el factor Sigma i el factor Rho?
- El factor sigma i el factor rho són dos factors importants per a la transcripció bacteriana.
- Tots dos només estan presents en procariotes.
- Són proteïnes formades per aminoàcids.
- Tots dos són proteïnes que uneixen àcids nucleics.
- Els procariotes depenen molt d'aquests factors per generar ARNm que poden produir proteïnes peculiars i ajudar-los a respondre específicament al seu entorn.
Quina diferència hi ha entre el factor Sigma i el factor Rho?
El factor Sigma és una proteïna necessària per iniciar la transcripció en bacteris, mentre que el factor rho és una proteïna necessària per a la finalització de la transcripció en bacteris. Per tant, aquesta és la diferència clau entre el factor sigma i el factor rho. A més, el factor sigma és una proteïna que uneix l'ADN, mentre que el factor rho és una proteïna que uneix l'ARN.
La infografia següent presenta les diferències entre el factor sigma i el factor rho en forma de taula per comparar-les.
Resum: Factor Sigma vs Factor Rho
La transcripció és el procés on la informació de l'ADN es copia en una nova molècula anomenada ARNm (ARN missatger). Aquest m-RNA està implicat en última instància en la producció d'una proteïna específica. El factor sigma i el factor rho són dos factors importants per a la transcripció bacteriana. Són proteïnes. El factor Sigma participa en l'inici de la transcripció en bacteris. El factor Rho és responsable de la terminació de la transcripció en bacteris. Per tant, aquest és el resum de la diferència entre el factor sigma i el factor rho.
