La diferència clau entre la PCR de consens i la PCR pan és que la PCR de consens sempre s'adreça a regions conservades, mentre que la Pan PCR s'adreça a regions variables per identificar diferents soques d'un grup
La reacció en cadena de la polimerasa (PCR) és una tècnica d'amplificació gènica que consta de tres passos principals com la desnaturalització, el recuit i l'extensió. Això s'utilitza àmpliament en el diagnòstic i la identificació molecular. Les tècniques de PCR de consens i Pan PCR es basen en els objectius d'imprimació que utilitza cada tipus de PCR.
Què és la PCR de consens?
La PCR de consens és una tècnica de PCR que s'orienta a una regió conservada per a una espècie o gènere en particular. Per tant, s'escullen regions molt conservades per a l'amplificació. Mitjançant aquest mètode, els organismes es poden identificar i distingir en funció del seu consens. Aquest mètode identifica una regió conservada per a una espècie concreta. Per exemple, la regió d'ARNr 16s dels bacteris segueix sent una regió conservada entre els bacteris. Per tant, només cal un conjunt d'encebadors per a l'amplificació. En la majoria dels casos, es pot utilitzar un imprimador universal específic per a la regió conservada.
Figura 01: tècnica de PCR
Seguint un mètode de PCR de consens, es poden deduir la caracterització de les espècies i les relacions evolutives. A partir de l'eficiència d'amplificació de l'organisme mostra en particular, també es pot deduir el consens de l'organisme envers el grup. A més, dur a terme una PCR de consens és vital en estudis filogenètics. Permet la identificació d'una espècie i interpreta la desviació que l'organisme en particular mostra en termes de l'ancestre comú.
Què és Pan PCR?
Una PCR panoràmica és un mode de multiplexació de PCR. En aquesta tècnica, s'amplifiquen diferents soques utilitzant diversos objectius d'imprimació. Els objectius, però, poden ser objectius comuns per als grups de soques. Així, en Pan PCR, es poden utilitzar més de dos conjunts d'imprimacions alhora. Pot tenir lloc en un mètode de reacció d'un sol tub o com a mètode de reacció multitub. La Pan PCR requereix més temps i és més complexa en comparació amb una PCR de consens. Per aquest motiu, la interpretació dels resultats de la PCR també pot ser més complexa a la Pan PCR.
La principal aplicació de Pan PCR és en el diagnòstic molecular. Permet distingir entre diferents soques d'una espècie mitjançant l'amplificació diana. Pan PCR és una tècnica ideal per identificar diferents soques d'una sola espècie causant una mal altia. En la majoria dels casos, l'automatització de tècniques Pan PCR per a diverses condicions de salut és molt important i és una tècnica fiable i altament eficient.
Quines similituds hi ha entre la PCR de consens i la PCR panoràmica?
- Consensus PCR i Pan PCR són dos tipus de tècniques de PCR.
- Ambdós procediments segueixen el procediment general de tres passos: desnaturalització, recuit i extensió.
- Utilitzen imprimacions específiques de l'objectiu.
- Les dues reaccions tenen lloc en un termociclador.
- Aquestes reaccions es poden automatitzar.
- Tots dos es poden utilitzar en el diagnòstic i la identificació molecular; tanmateix, la precisió varia.
- Aquests procediments requereixen validació.
Quina diferència hi ha entre la PCR de consens i la PCR panoràmica?
Tant Consensus com Pan PCR segueixen el mateix procediment rutinari. Tanmateix, la diferència clau entre la PCR de consens i la Pan PCR es basa en els objectius d'imprimació que utilitza cada procediment. Tot i que la PCR de consens sempre s'adreça a regions conservades, una PCR Pan s'adreça a regions variables per identificar diferents soques d'un grup. A causa d'aquesta diferència, els protocols de disseny d'imprimadors, el nombre de conjunts d'imprimadors utilitzats i les aplicacions específiques varien.
La infografia següent resumeix la diferència entre Consensus PCR i Pan PCR.
Resum: PCR de consens vs PCR panoràmica
PCR, introduïda per Mulli, té un paper revolucionari important en les aplicacions de la biologia molecular. El consens i la Pan PCR són dos tipus de PCR basats en les seves regions objectiu d'inici. Tot i que la PCR de consens s'adreça a regions conservades, la Pan PCR s'adreça a regions variables i té un paper important en la identificació de soques. A causa d'aquesta diferència bàsica entre la PCR de consens i la Pan PCR, les funcions específiques de cada tipus de PCR també varien des de l'anàlisi filogenètica fins a la caracterització molecular i el diagnòstic molecular.
