La diferència clau entre CRISPR i CRISPR Cas9 és que CRISPR (repetició palindròmica curta agrupada regularment espaiada) és un mecanisme de defensa immune procariota natural, mentre que CRISPR cas9 és una nucleasa Cas9 guiada per ARN que forma part de la CRISPR adaptativa. sistema immunitari.
CRISPR és un sistema immunitari de defensa antiviral que es troba en bacteris i arquees. És una família de seqüències d'ADN que es troben al genoma bacterià. Consisteix en seqüències espaciadores que es deriven de fragments d'ADN de bacteriòfags que els havien infectat prèviament. En infeccions virals posteriors, els bacteris utilitzen aquestes seqüències per destruir l'ADN viral. Les seqüències CRISPR tenen repeticions palindròmiques curtes i seqüències espaciadores. A més, les seqüències espaciadores repetides CRISPR sovint tenen gens associats que codifiquen proteïnes Cas. Cas9 és una endonucleasa guiada per ARN. Juntament amb les seqüències CRISPR, la proteïna Cas9 actua com un sistema immunitari adaptatiu en bacteris contra bacteriòfags.
Què és CRISPR?
CRISPR són les sigles de Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeates. És un cúmul de seqüències d'ADN que es troben al genoma bacterià. Funciona com a mecanisme de defensa natural en bacteris i es va identificar per primera vegada a E. coli. En els bacteris, actua com a protecció immune adaptativa, especialment contra els bacteriòfags. Per tant, és un mecanisme específic de la seqüència.
Figura 01: CRISPR
El sistema CRISPR conté diverses seqüències de repetició d'ADN de segments curts. Aquestes repeticions són palindròmiques, tenint la mateixa seqüència de bases en llegir de 5’ a 3’ mentre que l’ altra dóna la mateixa seqüència en llegir de 3’ a 5’. A més, les repeticions són idèntiques. Es troben entre seqüències d'ADN "espaiadors" curtes que no són idèntiques. Però aquestes seqüències d'ADN espaciador són similars o coincideixen amb l'ADN del bacteriòfag estranger. Els gens associats a CRISPR es coneixen com a gens associats a CRISPR o gens Cas. Els gens Cas codifiquen les proteïnes Cas que són helicases o nucleases. Les helicases desenrotllen l'ADN mentre les nucleases tallen l'ADN. En general, tenint en compte el CRISPR, és un sistema immunitari de bacteris que treballa contra bacteriòfags (bacteris que infecten virus).
Què és CRISPR Cas9?
Cas9 o la proteïna 9 associada a CRISPR és una endonucleasa bacteriana guiada per ARN. Per tant, és un enzim que reconeix i talla l'ADN objectiu (especialment l'ADN bacteriòfag) complementari a l'ARN guia. Realitza un clivage específic de la cadena. La proteïna Cas9 està codificada per un gen associat a CRISPR. CRISPR cas9 és el sistema de nucleases CRISPR-Cas9 guiat per ARN que es pot utilitzar com a plataforma d'edició i orientació d'ADN programable per ARN per a l'edició del genoma, la pertorbació transcripcional, la modulació epigenètica i la imatge del genoma. Aquest sistema CRISPR cas9 és molt popular en els sistemes actuals d'edició del genoma.
Figura 02: CRISPR Cas9
En l'actualitat, el sistema CRISPR/Cas9 s'utilitza per alterar o modificar el genoma dels mamífers mitjançant la repressió de la transcripció o l'activació. Les cèl·lules de mamífer poden respondre a les ruptures d'ADN mediades per CRISPR/Cas9 mitjançant l'adopció d'un mecanisme de reparació. Es pot fer mitjançant el mètode d'unió d'extrems no homòlegs (NHEJ) o reparació dirigida per homologia (HDR). Ambdós mecanismes de reparació tenen lloc mitjançant la introducció de trencaments de doble cadena. Això resulta en l'edició de gens de mamífers. NHEJ pot provocar l'ablació de mutacions gèniques i es pot utilitzar per crear efectes de pèrdua de funció. L'HDR es pot utilitzar per introduir mutacions puntuals específiques o per introduir segments d'ADN de longitud variable. Actualment, el sistema CRISPR/Cas s'utilitza en els camps de les aplicacions terapèutiques, biomèdiques, agrícoles i de recerca.
Quines similituds hi ha entre CRISPR i CRISPR Cas9?
- Cas9 forma part del sistema CRISPR Cas.
- El sistema Crisper cas9 és un sistema immunitari que es troba de manera natural en els bacteris.
Quina diferència hi ha entre CRISPR i CRISPR Cas9?
CRISPR és un grup de seqüències d'ADN que es troben al genoma bacterià que funciona com a sistema de defensa natural contra els bacteriòfags. Consisteix en repeticions palindròmiques curtes regularment espaciades, espaiadors i gens associats. En canvi, cas9 és una proteïna 9 associada a CRISPR, que és un enzim endonucleasa guiat per ARN. Reconeix i escinda les cadenes dobles d'ADN dels virus. De fet, forma part del sistema de defensa CRISPR. Per tant, aquesta és la diferència clau entre CRISPR i CRISPR cas9.
Resum: CRISPR vs CRISPR Cas9
El CRISPR Cas és un sistema de defensa microbiana. CRISPR és un grup de seqüències d'ADN format per repeticions curtes palindròmiques, seqüències espaciadores i gens associats. Cas9 és una proteïna Cas que és una endonucleasa guiada per ARN. La proteïna CRISPR i Cas9 fan un sistema immunitari que funciona contra les infeccions de bacteriòfags en bacteris. La proteïna Cas9 és capaç de tallar l'ADN viral estrany i interrompre'l. CrRNA guia cas9 per reconèixer l'ADN viral. Per tant, el sistema CRISPR cas9 és un sistema immunitari natural que es troba en bacteris contra virus. Així, aquest és el resum de la diferència entre CRISPR i CRISPR cas9.
