La diferència clau entre la serina i la tirosina recombinasa és que a la serina recombinasa, la serina és l'aminoàcid nucleòfil utilitzat per l'enzim per atacar l'ADN durant la recombinació específica del lloc, mentre que a la tirosina recombinasa, la tirosina és l'aminoàcid nucleòfil utilitzat. per l'enzim per atacar l'ADN durant la recombinació específica del lloc.
La recombinació específica del lloc (recombinació conservadora específica del lloc) és un tipus de tècnica de recombinació genètica on l'intercanvi de cadenes d'ADN té lloc entre segments que tenen un cert grau d'homologia de seqüència. Les recombinases específiques del lloc regulen el procés de recombinació específic del lloc. Aquests enzims s'agrupen en dues famílies com la família de la serina recombinasa i la família de la tirosina recombinasa. Els noms provenen del residu d'aminoàcid nucleòfil conservat present a les dues classes anteriors de recombinases que s'utilitza per atacar l'ADN i que s'hi uneix de manera covalent durant l'intercanvi de cadenes en recombinació específica del lloc.
Què és la serina recombinasa?
En el mètode de recombinació específic del lloc, es tallen dues seqüències d'ADN curtes ('llocs objectiu') en punts específics de les dues cadenes i els extrems tallats es tornen a unir a nous socis. Les tecnologies de recombinació específiques del lloc són eines genòmiques en enginyeria genètica que depenen dels enzims recombinases per substituir la secció objectiu de l'ADN. S'ha trobat que molts sistemes de recombinació específics del lloc realitzen aquests reordenaments d'ADN amb diferents propòsits. Però tots aquests enzims recombinases pertanyen a dues famílies. La serina recombinasa és una d'elles. Poden mediar fins a tres tipus de reordenaments d'ADN: integració, escisió i inversió.
Figura 01: serina recombinasa
Les recombinases específiques d'un lloc com la recombinasa serina realitzen un reordenament de l'ADN reconeixent i unint-se a una seqüència d'ADN curta (lloc objectiu), en la qual tallen la columna vertebral de l'ADN. Més tard, es produeix l'intercanvi de dues hèlixs d'ADN i es produeix la unió de les cadenes d'ADN. En la serina recombinasa, la serina és l'aminoàcid que utilitza l'enzim per atacar l'ADN durant la recombinació específica del lloc. Durant la ruptura de l'ADN, l'enllaç proteïna-ADN es forma mitjançant una reacció de transesterificació. L'enllaç fosfodièster es substitueix per l'enllaç fosforesina entre el grup fosfat 5' al lloc de ruptura i el grup hidroxil d'un residu de serina conservat. El nou enllaç emmagatzema energia que es gasta en tallar l'ADN al lloc objectiu. Aquesta energia s'utilitza més tard per unir l'ADN al grup hidroxil desoxiribosa corresponent a l' altre lloc. Exemples de serina recombinases són les resolvases/inversases de serina i les integrases de serina.
Què és la tirosina recombinasa?
Tirosina recombinasa és l' altra classe d'enzims que regula la recombinació conservadora específica del lloc. Tal com s'ha descrit anteriorment, la tirosina recombinasa també duu a terme la reordenació de l'ADN de la mateixa manera reconeixent i unint-se a una seqüència curta d'ADN (lloc objectiu), en la qual tallen la columna vertebral de l'ADN. Més tard, es produeix l'intercanvi de dues hèlixs d'ADN i la unió de cadenes d'ADN.
Figura 02: tirosina recombinasa
Però a la tirosina recombinasa, la tirosina és l'aminoàcid que utilitza l'enzim per atacar l'ADN durant la recombinació específica del lloc. La característica comuna d'aquesta classe és un residu de tirosina nucleòfil conservat que ataca l'ADN-fosfat cissil per formar un enllaç 3′-fosfotirosina. Les tirosina recombinases (A1) i les tirosina integrases (A2) són els grups d'enzims destacats de la família d'enzims de la tirosina recombinasa.
Quines similituds hi ha entre la serina i la tirosina recombinasa?
- Són una classe d'enzims recombinases.
- Tots dos regulen la recombinació específica del lloc.
- Són proteïnes.
- La reacció química bàsica és la mateixa per a tots dos.
- Tots dos catalitzen reaccions de transesterificació.
Quina diferència hi ha entre la serina i la tirosina recombinasa?
A la serina recombinase, la serina és l'aminoàcid nucleòfil que l'enzim utilitza per atacar l'ADN durant la recombinació específica del lloc. D' altra banda, a la tirosina recombinasa, la tirosina és l'aminoàcid nucleòfil que utilitza l'enzim per atacar l'ADN durant la recombinació específica del lloc. Per tant, aquesta és la diferència clau entre la serina i la tirosina recombinasa. La característica comuna de la serina recombinasa és que forma un enllaç fosfoserina amb l'ADN, mentre que la tirosina recombinasa forma un enllaç fosfotirosina amb l'ADN durant el procés de recombinació específic del lloc.
La infografia següent mostra les diferències entre la serina i la tirosina recombinasa en forma tabular.
-
Diferència entre serina i tirosina recombinasa en forma tabular
Resum: serina vs tirosina recombinasa
La recombinació pot ocórrer entre molècules d'ADN similars a la recombinació d'homòlegs o molècules diferents com a la recombinació no homòleg. La recombinació específica del lloc és un tipus de recombinació genètica en què l'intercanvi de cadenes d'ADN té lloc entre segments que tenen almenys un cert grau d'homologia de seqüència. Està catalitzat per recombinases. La majoria de recombinases s'agrupen en dues famílies: la serina recombinasa i la tirosina recombinasa. La serina recombinasa utilitza la serina com a aminoàcid nucleòfil per atacar l'ADN durant el procés de recombinació específic del lloc. La tirosina recombinasa utilitza la tirosina com a aminoàcid nucleòfil per atacar l'ADN durant el procés de recombinació específic del lloc. Per tant, aquesta és la diferència clau entre la serina i la tirosina recombinasa.
