La diferència clau entre el perfil de polisomes i el perfil de ribosomes és que el perfil de polisoma analitza el comportament dels ribosomes utilitzant tant ribosoma com ARNm (polisoma) durant la traducció, mentre que el perfil de ribosomes analitza el comportament dels ribosomes només utilitzant la seqüència d'ARNm durant la traducció..
La traducció és la segona fase de la síntesi de proteïnes que converteix la informació de l'ARNm en una seqüència d'aminoàcids. La traductomica és un estudi dels ORF (marcs de lectura oberts) que es tradueixen activament en una cèl·lula d'un organisme. Les tècniques de perfilació de polisomes i ribosomes són dos tipus de tècniques en l'àmbit de la biologia molecular per avaluar i inferir diferents paràmetres en el context de l'anàlisi del translatoma.
Què és el perfil de polisomes?
El perfil de polisoma és una tècnica que infereix l'estat de la traducció d'un ARNm específic mitjançant l'anàlisi del comportament tant del ribosoma com de l'ARNm (polisoma). En altres paraules, aquesta tècnica proporciona dades i conclusions sobre l'associació d'ARNm amb ribosomes. El polisoma fa referència al grup de ribosomes units a un ARNm que està present durant la fase d'allargament de la traducció.
Figura 01: Perfil de polisomes
El perfil de polisoma requereix el lisat cel·lular, que després es centrifuga. A continuació, la mostra centrifugada es separa en funció de les seves densitats per caracteritzar les subunitats petites i grans dels ribosomes i l'ARNm corresponent implicat en la formació del polisoma. A més, el procés també implica mesurar la densitat òptica. Es requereixen experts per realitzar el perfil de polisomes.
La tècnica de perfils de polisomes és una eina important per a moltes aplicacions. Els científics utilitzen aquesta tècnica per estudiar el grau de traducció a les cèl·lules. Més concretament, és una eina per proporcionar informació precisa sobre l'estudi de proteïnes individuals i els seus ARNm específics. En el context de l'estudi del grau de traducció d'un ARNm particular, la tècnica de perfilació de polisomes és vital. Aquí, les seqüències 3' i 5' d'un ARNm es poden investigar en referència als seus efectes sobre la quantitat d'ARNm produït i el nivell de traducció.
Què és el perfil de ribosomes?
El perfil del ribosoma és una tècnica que analitza el comportament del ribosoma respecte al seu ARNm durant la traducció. Aquesta tècnica la van trobar i desenvolupar Joan Steitz i Marilyn Kozak. Més tard aquesta tecnologia va ser desenvolupada per dos científics, Nicholas i Jonathan, en combinació amb la seqüenciació de nova generació, la qual cosa va conduir al desenvolupament de diferents tècniques relacionades com la metodologia Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP).
Figura 02: seqüenciació de ribosomes
El procediment de perfilació de ribosomes consisteix a aïllar l'ARNm, eliminar l'ARN que no està unit als ribosomes i separar l'ARNm unit als ribosomes. Després d'aquest procediment, l'aïllat d'ARNm es transcriu inversament i es produeix la síntesi d'ADNc. Finalment, les dades de la seqüència es poden alinear amb el perfil de traducció per deduir les característiques del comportament del ribosoma respecte a l'ARNm.
El perfil de ribosomes ajuda a molts investigadors a identificar i inferir la ubicació dels llocs d'inici de la traducció, el complement dels marcs de lectura oberts traduïts (ORF) en una cèl·lula o un teixit, la distribució dels ribosomes a l'ARNm i la taxa de traducció de ribosomes. El perfil de ribosomes també es coneix com a empremta de ribosomes o Ribo Seq.
Quines similituds hi ha entre el perfil de polisomes i el perfil de ribosomes?
- Els perfils de polisomes i ribosomes són tècniques de biologia molecular importants en la investigació.
- Ofereixen informació sobre el procés de traducció.
- Ambdós processos d'elaboració de perfils proporcionen dades mitjançant l'anàlisi del traductor.
- Es necessiten experts professionals per dur a terme les dues tècniques per obtenir resultats precisos.
- Les eines bioinformàtiques tenen un paper important en ambdues tècniques.
Quina diferència hi ha entre el perfil de polisomes i el perfil de ribosomes?
El perfil del polisoma analitza el comportament del ribosoma utilitzant tant el ribosoma com l'ARNm (polisoma) durant la traducció, mentre que el perfil del ribosoma analitza el comportament del ribosoma només utilitzant la seqüència d'ARNm durant la traducció. Per tant, aquesta és la diferència clau entre el perfil de polisoma i el perfil de ribosoma. A més, el perfil de polisomes implica tècniques com la centrifugació del gradient de densitat i les mesures de densitat òptica, mentre que el perfil de ribosomes implica tècniques d'extracció i seqüenciació d'ARNm. A més, el perfil de ribosomes és més precís que el perfil de polisoma.
La infografia següent presenta les diferències entre els perfils de polisomes i ribosomes en forma de taula per comparar-les.
Resum - Perfil de polisomes vs. Perfil de ribosomes
La traducció és la segona fase de la síntesi de proteïnes que consisteix a convertir la informació de la seqüència d'ARNm en una seqüència d'aminoàcids. Aquest procés requereix una plantilla d'ARNm, ribosomes, aminoàcids, ARNt i altres factors. El perfil de polisomes i ribosomes són dues tècniques moleculars. El perfil del polisoma analitza el comportament del ribosoma utilitzant tant el ribosoma com l'ARNm (polisoma) durant la traducció, mentre que el perfil del ribosoma analitza el comportament del ribosoma només utilitzant la seqüència d'ARNm durant la traducció. El perfil de polisomes implica tècniques com la centrifugació del gradient de densitat i les mesures de densitat òptica. El perfil de ribosomes implica tècniques com l'extracció d'ARNm, la síntesi d'ADNc i la seqüenciació. Per tant, això resumeix la diferència entre el perfil de polisomes i el perfil de ribosomes.
