La diferència clau entre les sondes d'ADN i d'ARN és que les sondes d'ADN són fragments d'ADN que són complementaris a les seqüències de nucleòtids diana, mentre que les sondes d'ARN són trams d'ARN monocatenari que són seqüències d'àcid nucleic complementàries de seqüències diana.
Una sonda és una seqüència curta d'ADN o ARN sintetitzada artificialment que es pot marcar de manera radioactiva o amb molècules no radioactives. Pot tenir una longitud de 100 a 1000 bases. Les sondes són útils per detectar seqüències de nucleòtids diana que són complementàries a la seqüència de la sonda. Un cop afegides, les sondes s'hibriditzen amb les seqüències complementàries o les seqüències diana i la fan visible per identificar les seqüències diana ja que porta radioactivitat. Les sondes són eines moleculars importants per a moltes àrees microbianes i moleculars, com ara la detecció de mal alties genètiques, en virologia, en patologia forense, en proves de paternitat, en empremtes digitals d'ADN, RFLP, citogenètica molecular, hibridació in situ, etc.
Què són les sondes d'ADN?
Les sondes d'ADN són trams d'ADN monocatenari. Es poden utilitzar per detectar la presència de seqüències d'àcids nucleics complementàries (seqüències diana) per hibridació. Un cop una sonda d'ADN hibridada amb la seva seqüència complementària, forma un híbrid de doble cadena. Per detectar-los, les sondes d'ADN generalment estan marcades amb radioisòtops, biotina, epítops o fluoròfors. Les sondes d'ADN marcades amb biotina es poden detectar amb fosfatasa alcalina marcada amb estreptavidina mitjançant diversos mètodes enzimàtics i químics.
Figura 01: sonda d'ADN
La seqüència de nucleòtids de la sonda d'ADN es coneix. Són seqüències curtes amb una longitud de 100 a 1000 parells de bases. Les sondes d'ADN llargues es poden generar mitjançant la tecnologia d'ADN recombinant. També es poden generar mitjançant PCR i clonació. Als laboratoris de microbiologia clínica, les sondes d'ADN estan disponibles per al diagnòstic ràpid de mal alties infeccioses.
Què són les sondes d'ARN?
Les sondes d'ARN són trams d'ARN monocatenaris. Són seqüències complementàries a les seqüències objectiu de la mostra. Normalment es sintetitzen amb les ARN polimerases dels bacteriòfags SP6, T7 o T3 mitjançant la transcripció in vitro d'ADN. Es poden generar sondes d'ARN llargues mitjançant transcripció in vitro a partir d'ADN plasmidi linealitzat. En general, les sondes d'ARN s'uneixen fortament i més estretament a les seves seqüències complementàries que les sondes d'ADN. De manera similar a les sondes d'ADN, les sondes d'ARN també es poden etiquetar mentre es transcriuen.
Quines similituds hi ha entre les sondes d'ADN i d'ARN?
- Tant les sondes d'ADN com d'ARN són seqüències de nucleòtids monocatenaris.
- Tots dos estan dissenyats i sintetitzats artificialment.
- A més, es poden etiquetar amb radioisòtops, epítops, biotina o fluoròfors.
- Tenen una forta afinitat cap a una seqüència diana específica d'ADN o ARN.
- S'utilitzen en diverses tècniques de blotting i hibridació in situ per a la detecció de seqüències d'àcid nucleic diana.
- Ambdós tipus de sondes es poden hibridar amb les seves seqüències complementàries.
- També s'utilitzen en la identificació de microorganismes i el diagnòstic de mal alties infeccioses, hereditàries i altres.
Quina diferència hi ha entre les sondes d'ADN i d'ARN?
La sonda d'ADN és un tram curt d'ADN que és complementari a la seqüència diana. D' altra banda, la sonda d'ARN és un tram curt d'ARN monocatenari complementari a la seqüència diana. Per tant, aquesta és la diferència clau entre les sondes d'ADN i d'ARN. A més, les sondes d'ADN contenen A, T, C i G mentre que les sondes d'ARN contenen A, U, C i G.
A més, una altra diferència entre les sondes d'ADN i d'ARN és la seva estabilitat termodinàmica. Les sondes d'ARN mostren una major estabilitat termodinàmica en comparació amb les sondes d'ADN.
A continuació, la infografia tabula les diferències importants entre les sondes d'ADN i d'ARN.
Resum: sondes d'ADN i ARN
Una sonda és un petit fragment d'ADN o ARN que s'utilitza per detectar la presència d'una seqüència específica a la mostra d'ADN o ARN mitjançant hibridació molecular. Les sondes d'ADN són fragments curts d'ADN monocatenari mentre que les sondes d'ARN són seqüències curtes d'ARN monocatenari. Són seqüències conegudes. L'estabilitat termodinàmica és més gran a les sondes d'ARN que a les sondes d'ADN. Les sondes d'ARN s'uneixen fortament a les seves seqüències complementàries que les sondes d'ADN. Així, això resumeix la diferència entre les sondes d'ADN i d'ARN.
