La diferència clau entre els retrotransposons LTR i no LTR és que els retrotransposons LTR són un tipus de retrotransposons que tenen repeticions terminals llargues a la seva estructura, mentre que els retrotransposons no LTR són un tipus de retrotransposons que no tenen repeticions terminals llargues. en la seva estructura.
Retrotransposons (elements transposables de classe I o transposons mitjançant intermedis d'ARN) són un tipus de component genètic que es pot copiar i enganxar en diferents ubicacions genòmiques. Ho fan convertint l'ARN de nou en ADN mitjançant un procés anomenat transcripció inversa mitjançant un intermedi de transposició d'ARN. Hi ha dos tipus principals de retrotransposons com LTR i retrotransposons no LTR
Què són els retrotransposons LTR?
Els retrotransposons LTR són un tipus de retrotransposons que tenen repeticions terminals llargues en la seva estructura. Es poden trobar cadenes llargues d'ADN repetitiu a cada extrem d'un retrotransposó LTR. Es coneixen com a repeticions terminals llargues (LTR). Cada LTR té uns quants centenars de parells de bases de llarg. Els retrotransposons LTR solen tenir més de 5 quilobases de llarg. A més, entre les repeticions terminals llargues, hi ha gens que es poden transcriure equivalents als gens de retrovirus gag i pol. Aquests gens se superposen de manera que codifiquen una proteasa que normalment processa la transcripció resultant en productes gènics funcionals.
Figura 01: Retrotransposons LTR
El gen Gag dels retrotransposons fa un producte que s'associa amb altres transcripcions de retrotransposons per formar partícules semblants a virus. El gen Pol fa productes que inclouen enzims com els dominis de transcriptasa inversa, integrasa i ribonucleasa H. L'enzim transcriptasa inversa realitza la transcripció inversa de l'ADN del retrotransposó. L'enzim integrasa integra l'ADN del retrotransposó a l'ADN del genoma eucariota. Els dominis de la ribonucleasa H són útils per tallar els enllaços fosfodièster entre els intermedis d'ARN. Els retrotransposons LTR també codifiquen transcripcions amb llocs d'unió d'ARNt de manera que es puguin sotmetre a la transcripció inversa amb força facilitat. A més, com que el retrotransposó conté informació del genoma eucariota, pot inserir còpies de si mateix en altres ubicacions genòmiques dins d'una cèl·lula eucariota.
Què són els retrotransposons no LTR?
Retrotransposons no LTR són un tipus de retrotransposons que no tenen repeticions terminals llargues a la seva estructura. Igual que els retrotransposons LTR, els retrotransposons no LTR també contenen gens per a la transcriptasa inversa, la proteïna d'unió a l'ARN, la nucleasa i, de vegades, els dominis H de la ribonucleasa. Però els f alten les llargues repeticions terminals; en canvi, tenen repeticions curtes que poden tenir un ordre invertit de bases al costat de l' altre. Les proteïnes d'unió a l'ARN s'uneixen a l'intermedi de transposició d'ARN i les nucleases trenquen els enllaços fosfodièster entre els nucleòtids dels àcids nucleics.
Figura 02: retrotransposons LTR i no LTR
Tot i que són retrotransposons, no poden dur a terme la transcripció inversa mitjançant un intermedi d'ARN de la mateixa manera que els retrotransposons LTR. Això es deu al fet que els retrotransposons no LTR no contenen seqüències que s'uneixin a l'ARNt. Per tant, un retrotransposó no LTR transcrit a ARNm i traduït a proteïnes actua com a transcriptasa inversa. La transcriptasa inversa fa una còpia d'ADN de l'ARN del retrotransposó no LTR que es pot integrar al genoma en un lloc nou. A més, els retrotransposons que no són LTR es divideixen en dos tipus: LINEs (elements nuclears intercalats llargs) i SINE (elements nuclears intercalats curts).
Quines similituds hi ha entre els retrotransposons LTR i no LTR?
- Retrotransposons LTR i no LTR són els dos tipus principals de retrotransposons.
- Ambdós tipus contenen gens per a enzims com la transcriptasa inversa, la proteïna d'unió a l'ARN, la nucleasa i els dominis de la ribonucleasa H.
- Es poden trobar al genoma humà.
- Ambdós tipus són evolutius importants.
Quina diferència hi ha entre retrotransposons LTR i no LTR?
Els retrotransposons LTR tenen repeticions terminals llargues a la seva estructura, mentre que els retrotransposons no LTR no tenen repeticions terminals llargues en la seva estructura. Per tant, aquesta és la diferència clau entre els retrotransposons LTR i no LTR. A més, els retrotransposons LTR tenen repeticions directes llargues que són només una seqüència de bases que es repeteixen. D' altra banda, els retrotransposons que no són LTR tenen repeticions curtes que poden tenir un ordre invertit de bases al costat de l' altre.
La infografia següent presenta les diferències entre els retrotransposons LTR i els que no són LTR en forma de taula per comparar-les.
Resum: retrotransposons LTR i no LTR
Els retrotransposons LTR i no LTR són els dos tipus principals de retrotransposons. Els retrotransposons LTR tenen repeticions terminals llargues a la seva estructura, mentre que els retrotransposons no LTR no tenen repeticions terminals llargues a la seva estructura. Per tant, aquesta és la diferència clau entre retrotransposons LTR i no LTR.
