La diferència clau entre el cianol de xilè i el blau de bromofenol és que en un gel d'agarosa a l'1%, el cianol de xilè migra més lentament, mentre que el blau de bromofenol migra més ràpidament.
El cianol de xilè i el blau de bromofenol són importants com a marcadors de color que es poden utilitzar per controlar el procés d'electroforesi en gel d'agarosa i electroforesi en gel de poliacrilamida.
Què és el cianol de xilè?
El cianol de xilè és un marcador de color electroforètic o un colorant de seguiment. És útil per controlar el procés d'electroforesi en gel d'agarosa i electroforesi en gel de poliacrilamida. Quan aquesta substància es barreja amb la mostra, la concentració d'aquesta substància es converteix normalment al voltant de 0.005% a 0,03%. Alguns sinònims que podem utilitzar per a cianol de xilè inclouen Acid Blue 147, cianol de xilè, cianol de xilè FF, cianol de xilè FF, etc.
La fórmula química d'aquest compost és C25H27N2NaO 6S2 La massa molar del xileno-cianol és de 538,61 g/mol. Aquesta substància pot migrar a una velocitat d'uns 4-5 fragments d'ADN de parells de quilobases en gels d'agarosa a l'1%. Tanmateix, això depèn del buffer que utilitzem. Normalment, el cianol de xilè en gel de poliacrilamida al 6% pot migrar a una velocitat d'uns 140 fragments d'ADN de parells de bases. D' altra banda, pot migrar en un 20% d'electroforesi en gel de poliacrilamida desnaturalitzant a una velocitat d'oligonucleòtid de 25 bases.
El nombre de donants d'enllaç d'hidrogen del xileno cianol és de 2 m, i el nombre d'acceptants d'enllaç d'hidrogen és de 8. El nombre d'enllaços rotatius d'aquest compost es pot donar com a 7. La complexitat del xileno cianol es pot descriure com 1120 graus. Té un nombre d'estereocentres d'enllaç definit d'1.
Què és el blau de bromofenol?
El blau de bromofenol és un indicador de pH útil que és útil com a marcador de color electroforètic i colorant. Té el nom químic 3’, 3”, 5’, 5”-tetrabromofenolsulfonftaleïna, BPB. La fórmula química d'aquest compost és C19H10Br4O5 S. La massa molar d'aquest compost és de 669,96 g/mol. És inodor i la seva densitat es pot donar com a 2,2 g/mL. El seu punt de fusió és de 273 graus centígrads i el seu punt d'ebullició és de 279 graus centígrads. Podem preparar-lo afegint lentament l'excés de brom a una solució calenta de fenolsulfonftaleïna en àcid acètic glacial.
El blau de bromofenol és útil com a indicador àcid-base en el rang entre pH 3,0 i 4,6. És capaç de canviar de groc a pH 3,0 a pH 4,6. A més, és una reacció reversible. Estructuralment, el blau de bromofenol és similar a la fenolftaleïna.
A més, el podem utilitzar com a marcador de color per controlar el procés d'electroforesi en gel d'agarosa i electroforesi en gel de poliacrilamida. Aquesta substància pot portar una càrrega negativa a pH moderat, on pot migrar en la mateixa direcció que l'ADN o la proteïna en un gel. La taxa de migració pot variar segons la densitat del gel i la composició del tampó. Tanmateix, en un típic gel d'agarosa a l'1% en un tampó TAE o tampó TBE, aquesta substància migra a la mateixa velocitat que un fragment d'ADN d'uns 300 parells de bases.
Quina diferència hi ha entre el cianol de xilè i el blau de bromofenol?
El cianol de xilè i el blau de bromofenol són marcadors de color importants. La diferència clau entre el cianol de xilè i el blau de bromofenol és que en un gel d'agarosa a l'1%, el cianol de xilè migra més lentament, mentre que el blau de bromofenol migra més ràpidament.
A continuació es mostra un resum de la diferència entre el cianol de xilè i el blau de bromofenol en forma tabular per a una comparació de costat.
Resum: cianol de xilè vs blau de bromofenol
El cianol de xilè i el blau de bromofenol són importants com a marcadors de color utilitzats en el seguiment del procés d'electroforesi en gel d'agarosa i electroforesi en gel de poliacrilamida. La diferència clau entre el cianol de xilè i el blau de bromofenol és que en un gel d'agarosa a l'1%, el cianol de xilè migra més lentament mentre que el blau de bromofenol migra més ràpidament.
