Diferència clau: VNTR vs STR
Els estudis d'ADN tenen una immensa utilitat per entendre i determinar relacions filogenètiques, diagnosticar mal alties genètiques i cartografiar els genomes dels organismes. S'utilitzen diverses tècniques associades a l'anàlisi d'ADN per a la identificació d'un gen particular o d'una seqüència d'ADN en un conjunt d'ADN desconegut. Es coneixen com a marcadors genètics. Els marcadors genètics s'utilitzen en biologia molecular per identificar la variació genètica entre individus i espècies. La repetició en tàndem de nombre variable (VNTR) i la repetició en tàndem curta (STR) són dos tipus de marcadors genètics que mostren polimorfisme entre els individus. Tots dos tipus són ADN repetitiu no codificant que són repeticions en tàndem. Estan disposats de cap a cua en els cromosomes. VNTR és una secció del genoma on la seqüència curta de nucleòtids es repeteix diverses vegades. STR és una altra secció de l'ADN dins del genoma que s'organitza com a unitats repetitives formades per dos a tretze nucleòtids en cent vegades. La diferència clau entre VNTR i STR és el nombre de nucleòtids en una seqüència repetida. Les unitats repetidores de VNTR consisteixen en 10 a 100 nucleòtids, mentre que la unitat repetitiva de STR consta de 2 a 13 nucleòtids. VNTR i STR s'utilitzen àmpliament en estudis forenses.
Què és VNTR?
Una repetició en tàndem és una seqüència curta d'ADN que es repeteix de cap a cua en un lloc cromosòmic específic. No hi ha cap altra seqüència o nucleòtid dins de la repetició en tàndem. Hi ha diversos tipus de repeticions en tàndem al genoma. VNTR és un tipus de repetició en tàndem entre ells que té unitats repetitives que consisteixen de 10 a 100 nucleòtids. VNTR és un tipus de minisatèl·lit. Aquestes repeticions en tàndem es poden trobar en molts cromosomes. S'intercalen dins del genoma humà i es troben predominantment a les regions subtelomèriques dels cromosomes.
Els VNTR mostren polimorfisme de repetició en tàndem entre individus. La longitud del VNTR en una ubicació particular del cromosoma és molt variable entre els individus a causa de la variació en el nombre d'unitats repetides organitzades en aquesta secció d'ADN. Per tant, VNTR es pot utilitzar com una eina poderosa en la identificació d'individus i l'anàlisi VNTR s'utilitza en molts camps, com ara la genètica, la investigació en biologia, la medicina forense i la impressió digital d'ADN. Els VNTR van ser els primers marcadors genètics utilitzats per quantificar l'empelt de trasplantament de medul·la òssia. Els VNTR també van ser els primers marcadors polimòrfics utilitzats en l'elaboració de perfils d'ADN en medicina forense.
Figura 01: variació dels VNTR en sis individus
L'anàlisi VNTR es realitza mitjançant un polimorfisme de longitud de fragment de restricció seguit d'hibridació del sud. Per tant, necessita una mostra d'ADN relativament gran. La interpretació del perfil VNTR també és problemàtica. A causa d'aquestes limitacions, l'ús de VNTR en genètica forense ha estat limitat i es substitueix per l'anàlisi STR.
Què és STR?
STR és una secció d'ADN altament repetitiva que consta de dues a tretze unitats que es repeteixen de nucleòtids organitzades en tàndem. STR és similar a VNTR. Però varia de VNTR del nombre de nucleòtids en una seqüència repetida i el nombre de repeticions. STR és un tipus de microsatèl·lit.
Anàlisi STR implicada en la mesura del nombre exacte d'unitats repetides. Els STR són molt variables entre individus, similars als VNT. Els perfils STR difereixen d'una persona a una altra. Per tant, l'anàlisi STR s'utilitza en biologia molecular per comparar loci específics de l'ADN de dues o més mostres. Per tant, els STR es consideren potents marcadors genètics en biologia molecular. Proporciona una eina excel·lent per a la identificació d'individus a causa del seu alt grau de polimorfisme i de longitud relativament curta.
En l'actualitat, els STR són l'eina de polimorfisme genètic analitzat més utilitzada en genètica forense. La majoria dels casos forenses inclouen anàlisis polimòrfiques STR. Els loci STR es distribueixen per tot el genoma. Hi ha milers d'STR localitzats als cromosomes que es poden utilitzar en anàlisis forenses. L'anàlisi STR no implica polimorfisme de longitud de restricció com l'anàlisi VNTR. L'anàlisi STR no talla l'ADN amb enzims de restricció. S'utilitzen sondes específiques per connectar les regions desitjades a l'ADN i mitjançant la tècnica de PCR, es determinen les longituds de l'STR.
Figura 02: variació STR entre mostres
Quines similituds hi ha entre VNTR i STR?
- VNTR i STR són ADN no codificant.
- Tots dos són repeticions en tàndem.
- Tots dos mostren polimorfisme entre individus a causa de la diferència en la longitud de la secció d'ADN.
- Tots dos s'utilitzen com a potents marcadors genètics en les empremtes digitals d'ADN i en estudis forenses.
Quina diferència hi ha entre VNTR i STR?
VNTR vs STR |
|
| VNTR és un ADN repetitiu no codificant que té una seqüència de nucleòtids curta repetida en tàndem. | STR és una secció d'ADN altament repetitiva que consta de dues a tretze unitats que es repeteixen de nucleòtids organitzades en tàndem. |
| Talla | |
| VNTR són més grans que els STR. | STR són més petits que els VNTR. |
| Nombre de nucleòtids en seqüència repetida | |
| La unitat repetida de VNTR consta de 10 a 100 nucleòtids. | La unitat repetida de STR consta de 2 a 13 nucleòtids. |
Resum: VNTR vs STR
VNTR i STR són dos potents marcadors genètics utilitzats en biologia molecular, especialment en el camp de la genètica forense. VNTR és un tipus de minisatèl·lit i STR és un microsatèl·lit. VNTR i STR són ADN no codificant i altament repetitiu. Són repeticions en tàndem. L'estructura general de VNTR i STR és la mateixa. Tanmateix, el nombre de nucleòtids en la seqüència repetida i la longitud són diferents. VNTR té seqüències repetides que consisteixen en 10 a 100 nucleòtids. STR té seqüències repetitives formades per 2 a 13 nucleòtids. Aquesta és la diferència entre VNTR i STR.
Baixa la versió PDF de VNTR vs STR
Podeu baixar la versió PDF d'aquest article i utilitzar-la per a finalitats fora de línia segons les notes de citació. Baixeu la versió PDF aquí Diferència entre VNTR i STR.
