La diferència clau entre el tiocianat de guanidina i el clorhidrat de guanidina és que el tiocianat de guanidina és un desnaturalitzant de proteïnes més fort que s'utilitza més habitualment en l'aïllament de l'ARN, mentre que el clorhidrat de guanidina és un desnaturalitzant proteic més feble que s'utilitza menys en l'aïllament de l'ARN.
La desnaturalització és el procés en què les proteïnes perden la seva estructura quaternària, estructura terciària i estructura secundària que normalment està present en el seu estat natiu. Es pot fer mitjançant l'aplicació d'algun estrès extern o compostos com un àcid o una base fort, una sal inorgànica concentrada, un dissolvent orgànic (alcohol, cloroform), agitació, radiació o calor. El tiocianat de guanidina i el clorhidrat de guanidina són dos tipus diferents de desnaturalitzants de proteïnes.
Què és el tiocianat de guanidina?
Tiocianat de guanidina (GTC) és un agent desnaturalitzador de proteïnes més fort que s'utilitza més habitualment en l'aïllament de l'ARN. També es coneix com a isotiocianat de guanidini (GITC). En ser un agent caotròpic, és un compost químic que s'utilitza habitualment com a desnaturalitzant general de proteïnes. Un agent caotròpic és una molècula en una solució d'aigua que pot interrompre la xarxa d'enllaços d'hidrogen entre les molècules d'aigua. Això té un efecte sobre l'estabilitat de l'estat natiu d' altres molècules de la solució, com ara macromolècules com proteïnes i àcids nucleics debilitant l'efecte hidrofòbic. Els agents caotròpics com el tiocianat de guanidina redueixen la quantitat d'ordre en l'estructura de la proteïna formada per les molècules d'aigua tant a granel com a les closques d'hidratació al voltant dels aminoàcids hidrofòbics. Això pot provocar la desnaturalització de proteïnes.
El tiocianat de guanidina es pot utilitzar per desactivar virus com la grip que causen mal alties com la grip espanyola de 1918. Per tant, es pot utilitzar en configuracions mèdiques o hospitalàries. A més, el tiocianat de guanidina també s'utilitza per lisar cèl·lules i partícules de virus en extraccions d'ARN i ADN. Aquí, la funció del tiocianat de guanidina és ajudar a l'acció de lisi i prevenir l'activitat dels enzims RNases i enzims DNases mitjançant la desnaturalització. En cas contrari, aquests enzims danyarien l'extracte (ARN o ADN).
Què és el clorhidrat de guanidina?
El clorhidrat de guanidina (GdnHCl) és un desnaturalitzant proteic més feble que s'utilitza amb menys freqüència en l'aïllament de l'ARN. També es coneix com a clorur de guanidini (GdmCl). És la sal clorhidrat de la guanidina. El clorhidrat de guanidina és caotròpic i un dels desnaturalitzants utilitzats en els estudis fisicoquímics del plegament de proteïnes.
Figura 01: clorhidrat de guanidina
El clorhidrat de guanidina també té la capacitat de disminuir l'activitat enzimàtica i augmentar la solubilitat de les molècules hidròfobes. Normalment, a concentracions més altes de clorhidrat de guanidina, les proteïnes perden la seva estructura ordenada. Les proteïnes tendeixen a enrotllar-se aleatòriament a aquesta concentració de clorhidrat de guanidina. En configuracions mèdiques o hospitalàries, el clorhidrat de guanidina està indicat per a la reducció dels símptomes de la debilitat muscular i la fatiga fàcil associats a la mal altia de la síndrome d'Eaton-Lambert. A més, els efectes secundaris de l'ús de clorhidrat de guanidina poden incloure perist altisme, diarrea i supressió mortal de la medul·la òssia.
Quines similituds hi ha entre el tiocianat de guanidina i el clorhidrat de guanidina?
- El tiocianat de guanidina i el clorhidrat de guanidina són dos tipus diferents de desnaturalitzants de proteïnes.
- Tots dos desnaturalitzants tenen guanidina a les seves estructures.
- Són agents caotròpics.
- Els dos desnaturalitzants es poden utilitzar per aïllar l'ARN.
- Tots dos s'utilitzen en configuracions mèdiques o hospitalàries.
Quina diferència hi ha entre el tiocianat de guanidina i el clorhidrat de guanidina?
El tiocianat de guanidina és un agent desnaturalitzant de proteïnes més fort que s'utilitza més habitualment en l'aïllament d'ARN, mentre que el clorhidrat de guanidina és un desnaturalitzant de proteïnes més feble que s'utilitza amb menys freqüència en l'aïllament d'ARN. Per tant, aquesta és la diferència clau entre el tiocianat de guanidina i el clorhidrat de guanidina. A més, la fórmula química del tiocianat de guanidina és C2H6N4S, mentre que la fórmula química de clorhidrat de guanidina és CH5N3HCl.
La infografia següent presenta les diferències entre el tiocianat de guanidina i el clorhidrat de guanidina en forma tabular per comparar-les.
Resum: tiocianat de guanidina vs clorhidrat de guanidina
El tiocianat de guanidina i el clorhidrat de guanidina són dos tipus diferents de desnaturalitzants de proteïnes. Tots dos desnaturalitzants són caòtrops. El tiocianat de guanidina és un agent desnaturalitzant de proteïnes més fort que s'utilitza més habitualment en l'aïllament d'ARN, mentre que el clorhidrat de guanidina és un desnaturalitzant de proteïnes més feble que s'utilitza amb menys freqüència en l'aïllament d'ARN. Així doncs, això resumeix la diferència entre el tiocianat de guanidina i el clorhidrat de guanidina.
