La diferència clau entre Cosmid i Phagemid està en el tipus de seqüències que conté. Un còsmid conté un lloc cos i un plasmidi. Per tant, és un vector híbrid mentre que un fagèmid és un plasmidi que conté un origen F1 de replicació del fag F1.
Els còsmids i els fagèmids s'utilitzen amb finalitats de clonació, especialment per clonar fragments més grans d'ADN. Aquests s'utilitzen àmpliament especialment en la clonació de gens responsables de la producció de diverses proteïnes. Els còsmids i els fagèmids es repliquen sols com a plasmidis o s'empaqueten en partícules virals i després es repliquen.
Què és un còsmid?
Un còsmid, conegut com a plasmidi híbrid, inclou llocs cos extrets de partícules de fag Lambda i un plasmidi. Aquests llocs cos són fragments llargs d'ADN amb 200 parells de bases. Per tant, tenen extrems cohesius o enganxosos que permeten que el plasmidi encaixi a l'ADN viral. Per tant, els llocs cos són vitals per empaquetar l'ADN.
Hi ha tres llocs de cos;
- Lloc cosN: implicat en tallar la cadena d'ADN mitjançant l'activitat de la terminasa
- cosB lloc – dedicat a mantenir la terminació.
- Lloc cosQ: implicat en la prevenció de la degradació de l'ADN per les DNases.
Figura 01: còsmid
A més, els còsmids poden replicar l'ADN monocatenari o l'ADN de doble cadena mitjançant un origen de replicació adequat. Els còsmids solen contenir gens de resistència als antibiòtics com a marcadors per a la selecció de transformants. Així, l'ús d'un còsmid com a vector pot facilitar la clonació, i la digestió amb enzims de restricció del vector pot extreure aquests fragments.
Què és un famímid (fàsmid)?
Fagemid, també anomenat Phasmid, també és un tipus de vector híbrid. El fagèmid conté un origen especial de replicació anomenat origen de replicació f1. L'origen f1 dels extractes de replicació d'un fag f1.
Fagemid pot replicar l'ADN de cadena simple i de doble cadena. La replicació pot tenir lloc com a plasmidi mentre es sotmet a una replicació independent o es pot empaquetar en partícules de fags i finalment infectar l'hoste bacterian E coli. Quan s'infecten les cèl·lules d'E coli, el fag f1 requereix la presència d'un pilus. Per tant, els pili sexuals són importants durant l'envasament in vitro dels fagèmids.
Quines similituds hi ha entre còsmid i fagèmid?
- Tant Cosmid com Phagemid són vectors de clonació utilitzats en la tecnologia d'ADN recombinant.
- El còsmid i el fagèmid poden replicar l'ADN de cadena simple i de doble cadena.
- Tots dos poden experimentar una replicació independent similar als plasmidis.
- El còsmid i el fagèmid poden patir un envasament in vitro i infectar cèl·lules bacterianes.
- Tant Cosmid com Phagemid requereixen un origen de replicació adequat per a la clonació.
Quina diferència hi ha entre còsmid i fagèmid?
Còsmid vs Phagemid |
|
| El còsmid és un vector híbrid que conté un lloc cos i un plasmidi. | Fagemid és un plasmidi que conté un origen de replicació F1 del fag F1. |
| Presència de llocs Cos | |
| Els llocs Cos estan presents al còsmid i són necessaris per a l'envasament in vitro. | Els llocs Cos no hi ha fagemid. |
| Presència de l'origen de la replicació F1 | |
| Al còsmid, l'origen de la replicació fi pot presentar-se o no. | L'origen de la replicació F1 està present al fagèmid. |
| Presència de gens resistents als antibiòtics | |
| Els gens resistents als antibiòtics estan presents als còsmids per identificar els transformants dels no transformants. | Els gens resistents als antibiòtics estan absents als fagèmids. |
| Requisit d'embalatge in vitro | |
| Requereix un lloc cos. | Requereix un pilus sexual. |
Resum: còsmid vs fagèmid
Cosmid i Phagemid són vectors de clonació utilitzats en la tecnologia d'ADN recombinant. Els còsmids són vectors híbrids que contenen extrems especials enganxosos coneguts com a llocs cos. Els envasos in vitro requereixen aquests llocs cos. Mentre que els fagèmids són plasmidis que contenen un origen de replicació f1 extret del fag f1. Tant el còsmid com el fagèmid poden experimentar una replicació independent o empaquetament in vitro a les cèl·lules bacterianes. Aquestes són les diferències importants entre còsmid i fagèmid.
