La diferència clau entre el cebador i el promotor és que el cebador és una seqüència d'ADN curta sintetitzada comercialment que s'utilitza en la PCR per a l'amplificació d'una seqüència d'ADN objectiu, mentre que el promotor és una seqüència d'ADN específica que proporciona un lloc d'unió inicial segur per a l'ARN. polimerasa i factors de transcripció per iniciar la transcripció.
El cebador i el promotor són dos tipus de seqüències d'ADN. El primer és un petit fragment d'ADN necessari per a la reacció en cadena de la polimerasa (PCR). Té seqüències de nucleòtids curtes complementàries a l'extrem flanquejant de la cadena d'ADN. Hi ha dos tipus d'encebadors, i funcionen com a punts de partida per a la síntesi de noves cadenes d'ADN. En canvi, un promotor és una seqüència específica d'ADN situada aigües amunt del lloc d'inici de la transcripció d'un gen. Interacciona directament amb els components del mecanisme de transcripció com l'ARN polimerasa i els factors de transcripció per controlar la transcripció de l'ADN. Per tant, l'ARN polimerasa i altres factors de transcripció s'uneixen a la seqüència del promotor i inicien la transcripció.
Què és un manual?
Els cebadors són seqüències d'ADN curtes dissenyades per a l'amplificació de seqüències d'ADN diana. Estructuralment, posseeixen seqüències de nucleòtids curtes complementàries als extrems flanquejants de les cadenes dobles d'ADN. Solen tenir una longitud d'uns 20 nucleòtids. Durant la PCR, la polimerasa Taq catalitza l'addició de nucleòtids a la seqüència de nucleòtids preexistent. Per tant, els cebadors serveixen com a punts de partida per a la síntesi de noves cadenes. La polimerasa Taq només funciona en la direcció de 5' a 3'. Per tant, la síntesi d'ADN també té lloc en la mateixa direcció de 5' a 3'. Com que l'ADN és de doble cadena, es necessiten dos tipus d'encebadors en la PCR. Es coneixen com a cebador directe i cebador invers, en funció de la direcció de l'allargament de l'encebador durant la síntesi d'ADN.
Figura 01: inicis
El cebador cap endavant s'acumula amb la cadena d'ADN antisentit i inicia la síntesi de la cadena + del gen en direcció 5' a 3'. Té una seqüència de nucleòtids curta que és complementària a l'extrem flanqueig 3' de la cadena antisentit. L'imprimació inversa s'aconsegueix amb la cadena de sentit i inicia la síntesi d'una cadena complementària de la cadena codificant, que és una cadena del gen en direcció 5' a 3'. Així, l'imprimació inversa està dissenyada com a complement de l'extrem 3' de la cadena codificant. Tant els cebadors inversos com els directes són importants per a la producció de milions a milers de milions de còpies de regions particulars d'ADN a les quals es dirigeix o interessa.
Què és un promotor?
El promotor és una seqüència d'ADN situada aigües amunt o a l'extrem 5′ del lloc d'inici de la transcripció d'un gen. Proporciona un lloc d'unió per a l'ARN polimerasa i certs elements reguladors per tal d'iniciar la transcripció del gen. És una seqüència reguladora necessària per activar o desactivar un gen. Hi ha una seqüència de nucleòtids específica en el promotor. Pot tenir entre 100 i 1000 parells de bases. El promotor mostra la direcció de la transcripció. A més, indica la cadena de sentit que s'ha de transcriure.
Figura 02: promotor d'un gen
Hi ha tres tipus d'elements promotors com a promotor central, promotor proximal i promotor distal. El promotor central és la part mínima del promotor necessària per iniciar la transcripció. Es troba més proximal al codó inicial. La caixa TATA és una regió conservada que es troba en molts promotors del nucli eucariota. Es troba de 25 a 35 parells de bases aigües amunt del lloc d'inici de la transcripció. El promotor proximal es troba més aigües amunt del promotor central. Generalment, es troba a 250 parells de bases aigües amunt del codó inicial i conté elements reguladors primaris. El promotor distal es troba aigües amunt del promotor proximal i conté elements reguladors addicionals. Els promotors bacterians tenen dos elements de seqüència curta en els seus promotors. TATAAT és la seqüència consens situada a -10 del promotor bacterià mentre que TTGACA és la seqüència consens a -35. Es coneixen com a element -10 i element -35.
Quines similituds hi ha entre el primer i el promotor?
- El cebador i el promotor són dos tipus de seqüències d'ADN.
- Consten de seqüències de nucleòtids.
- Tant el cebador com el promotor són importants per a l'expressió gènica.
Quina diferència hi ha entre el primer i el promotor?
Primer és una seqüència de nucleòtids curta dissenyada per a l'amplificació de l'ADN objectiu. En canvi, el promotor és una seqüència d'ADN reguladora específica que es troba aigües amunt del lloc d'inici de la transcripció d'un gen. Per tant, aquesta és la diferència clau entre imprimació i promotor. Els cebadors tenen una longitud d'uns 20 parells de bases, mentre que el promotor pot tenir entre 100 i 1000 parells de bases. Funcionalment, els primers serveixen com a seqüències inicials per a la síntesi de la nova cadena, mentre que els promotors controlen la transcripció gènica proporcionant llocs d'unió per a l'ARN polimerasa i altres factors de transcripció..
A més, un promotor es defineix com la direcció de la transcripció i indica la cadena de sentit d'un gen. Estructuralment, el cebador és una seqüència d'ADN curta i monocatenària mentre que el promotor és una seqüència llarga d'ADN de doble cadena.
La informació gràfica següent tabula més comparacions relacionades amb la diferència entre imprimació i promotor.
Resum - Primer vs Promotor
Els cebadors són seqüències de nucleòtids curtes complementàries als extrems flanquejants de la doble cadena d'ADN objectiu. En la PCR s'utilitzen dos tipus d'encebadors. Serveixen com a seqüències de partida per a la síntesi de noves cadenes. Els primers estan dissenyats comercialment i són seqüències estables a la temperatura. D' altra banda, el promotor és una seqüència reguladora d'un gen situat aigües amunt del lloc d'inici de la transcripció. Els promotors controlen la transcripció dels gens. Proporcionen llocs d'unió per a l'ARN polimerasa i factors de transcripció per iniciar la transcripció. Per tant, aquest és el resum de la diferència entre imprimació i promotor.
