La diferència clau entre l'enllaçador i l'adaptador és que un enllaçador no té extrems cohesionats mentre que un adaptador té un extrem cohesionat.
La lligadura d'ADN és el procés d'unir dues molècules d'ADN juntes, formant enllaços fosfodièster. L'enzim anomenat ADN lligasa catalitza aquesta reacció. És un dels passos crítics en els camps biològics moleculars moderns com la tecnologia de l'ADN recombinant i la clonació d'ADN. L'eficiència de lligament depèn dels extrems de les molècules d'ADN a lligar. Hi ha dos tipus d'extrems d'ADN com a extrems enganxosos i extrems roms. L'eficiència de lligament és alta amb extrems enganxosos que amb extrems roms. Si les molècules d'ADN objectiu tenen extrems roms, seran útils molècules anomenades adaptadors o enllaços. Els adaptadors i enllaços són molècules d'oligonucleòtids sintetitzades químicament que ajuden a la lligadura de l'ADN. També tenen llocs de restricció interns. L'adaptador té un extrem enganxós i un extrem rom, mentre que l'enllaçador té dos extrems roms.
Què és un enllaçador?
Linker és una seqüència d'oligonucleòtids sintetitzada químicament que és de doble cadena. Linker té dos extrems roms. L'enllaçador s'utilitza per lligar molècules d'ADN que tenen extrems roms als vectors. Conté un o més llocs de restricció interns. Aquests llocs de restricció funcionen com a llocs de reconeixement d'enzims de restricció.
Figura 01: Enllaçador
Després de la lligadura, l'ADN es torna a restringir amb enzims de restricció per produir extrems cohesius. Els enllaçadors EcoRI i els enllaçadors sal-I són enllaçadors d'ús habitual.
Què és un adaptador?
Un adaptador és una seqüència d'oligonucleòtids de doble cadena que s'utilitza per unir dues molècules d'ADN. És una seqüència curta amb un extrem rom i un extrem enganxós o cohesionat. Per tant, consisteix en una cua monocatenària en un extrem, que millora l'eficiència de la lligadura de l'ADN.
Figura 02: Lligament de l'ADN mitjançant un adaptador
A més, l'adaptador té llocs de restricció interns. Per tant, després de la lligadura, l'ADN es pot restringir amb enzims de restricció adequats per tal de crear un nou terminal que sobresurt. Un desavantatge dels adaptadors és que dos adaptadors poden formar dimmers mitjançant l'aparellament de bases amb ells mateixos. Això es pot evitar tractant-los amb l'enzim anomenat fosfatasa alcalina.
Quines similituds hi ha entre Linker i Adaptor?
- Tant l'enllaç com l'adaptador són seqüències d'oligonucleòtids curtes de doble cadena.
- Porten llocs de restricció interns.
- A més, són molècules d'ADN sintetitzades químicament i són molècules sintètiques.
- Poden enllaçar dues molècules d'ADN juntes.
- Després de la lligadura d'enllaços i adaptadors, l'ADN es torna a restringir amb enzims de restricció per tal de produir extrems enganxosos.
Quina diferència hi ha entre l'enllaçador i l'adaptador?
Un enllaçador és un dúplex d'oligonucleòtids curts sintetitzat químicament amb dos extrems roms. Un adaptador és un dúplex d'oligonucleòtids curt sintetitzat químicament amb un extrem enganxós i un extrem rom. Per tant, aquesta és la diferència clau entre l'enllaç i l'adaptador. A més, els adaptadors poden formar dímers, mentre que els enllaços no formen dímers. Per tant, aquesta és una altra diferència significativa entre l'enllaç i l'adaptador.
A continuació es mostra un resum de les diferències entre l'enllaçador i l'adaptador en forma de taula.
Resum: Linker vs Adaptor
L'enllaç i l'adaptador són dos tipus d'oligonucleòtids sintetitzats químicament que són útils per lligar l'ADN d'extrem rom. L'enllaçador té dos extrems roms, mentre que l'adaptador té un extrem rom i un extrem cohesionat. Per tant, aquesta és la diferència clau entre l'enllaç i l'adaptador. Són molècules de doble cadena que tenen llocs de restricció interns. S'utilitzen àmpliament en tecnologia d'ADN recombinant i clonació d'ADN.
