La diferència clau entre els isoesquisòmers i els neosquisòmers és que els isoesquisòmers són enzims de restricció que tenen la mateixa seqüència de reconeixement i escinden l'ADN a les mateixes posicions, mentre que els neosquisòmers són enzims de restricció que tenen la mateixa seqüència de reconeixement però tallen l'ADN en posicions diferents..
Els enzims de restricció o les endonucleases de restricció són enzims que tallen l'ADN en fragments en llocs de reconeixement específics o a prop. Van tallar l'ADN als llocs de restricció. Els enzims de restricció es classifiquen generalment en cinc grups segons l'estructura, si tallen el seu substrat d'ADN al seu lloc de reconeixement i si els llocs de reconeixement i d'escissió estan separats els uns dels altres. Ja s'han identificat més de 3600 endonucleases de restricció. Hi ha aproximadament 800 enzims de restricció disponibles comercialment. Els isoquisòmers i els neosquisòmers són dos tipus d'enzims de restricció basats en el lloc de reconeixement i l'especificitat de clivage.
Què són els isoquizòmers?
Els isoquizòmers són enzims de restricció que tenen la mateixa seqüència de reconeixement i escinden l'ADN a les mateixes posicions. Aquests enzims de restricció tenen la mateixa especificitat. El primer enzim de restricció descobert que reconeix una seqüència determinada es coneix com a prototip, mentre que tots els enzims de restricció identificats posteriorment que reconeixen aquesta mateixa seqüència s'anomenen isoesquizòmers. Tanmateix, els isoesquizòmers poden diferir en les preferències del lloc, les condicions de reacció, la sensibilitat a la metilació i l'activitat de l'estrella. Els isoquisòmers s'aïllen de diferents soques de bacteris. Per tant, poden requerir condicions de reacció diferents. En alguns casos, només un d'un parell d'isosquizòmers pot reconèixer tant les formes metilades com les no metilades de llocs de restricció. D' altra banda, l' altre enzim de restricció només pot reconèixer la forma no metilada del lloc de restricció. Aquesta característica particular dels isoesquizòmers ajuda a identificar l'estat de metilació del lloc de restricció alhora que l'aïlla d'un estat bacterià.
Per exemple, AgeI i BshT1 reconeixen i uneixen 5'-A↓CCGGT en el mateix patró. HpaII i MSPI són altres parells d'isosquizòmers. Tots dos reconeixen la seqüència 5’-C↓CGG-3’ quan no està metilada. Però quan la segona C de la seqüència està metilada, només MSPI pot reconèixer aquesta seqüència mentre que HpaII no la pot reconèixer.
Què són els neosquizòmers?
Els neosquisòmers són enzims de restricció que tenen la mateixa seqüència de reconeixement però que escindeixen l'ADN en posicions diferents. En algunes aplicacions especials de biologia molecular, aquesta és una característica molt útil. Els neosquizòmers són un subconjunt d'isosquizòmers. Exemples coneguts de neosquizòmers són SmaI (5’-CCC↓GGG-3’) i XmaI (5’-C↓CCGGG-3’); tots dos reconeixen la seqüència 5'-CCCGGG-3' però els tallen en una posició diferent. Així, aquests dos enzims de restricció generen diferents tipus d'extrems. En aquest cas, SmaI produeix extrems roms i XmaI produeix extrems que sobresurten 5'.
Figura 01: Neosquizòmers
Un altre exemple és el parell d'enzims de restricció MaeII i Tail. El prototip MaeII (A↓CGT) produeix fragments d'ADN amb una extensió de 5' de 2 bases, i la cua de neosquizomer (ACGT↓) produeix fragments d'ADN amb una extensió de 4 bases 3'.
Quines similituds hi ha entre els isoquizòmers i els neosquizòmers?
- Els isoquizòmers i els neosquizòmers són dos tipus d'enzims de restricció.
- Es troben predominantment en procariotes.
- Formen part del sistema de modificació de restricció (RM) que es troba en bacteris i arquees.
- Tots dos són molècules de proteïnes.
- Tots dos tallen l'ADN en fragments.
Quina diferència hi ha entre els isoquizòmers i els neosquizòmers?
Els isoesquisòmers són enzims de restricció que tenen la mateixa seqüència de reconeixement i escinden l'ADN a les mateixes posicions, mentre que els neosquisòmers són enzims de restricció que tenen la mateixa seqüència de reconeixement però escinden l'ADN en posicions diferents. Per tant, aquesta és la diferència clau entre isoesquizòmers i neosquisòmers. A més, els isoesquisòmers tenen les mateixes especificitats mentre que els neosquisòmers tenen diferents especificitats.
La següent infografia enumera les diferències entre isoesquizòmers i neosquisòmers en forma de taula per comparar-les.
Resum: Isosquizòmers vs Neosquizòmers
Els enzims de restricció són enzims que tallen l'ADN. També s'anomenen tisores moleculars. Hi ha diferents tipus d'enzims de restricció. Basant-se en el lloc de reconeixement i l'especificitat d'escissió, els enzims de restricció són de dos tipus com isoquisòmers i neosquisòmers. Els isoquisòmers tenen la mateixa seqüència de reconeixement i tallen l'ADN a les mateixes posicions, mentre que els neosquisòmers tenen la mateixa seqüència de reconeixement però tallen l'ADN en posicions diferents. Per tant, aquesta és la diferència clau entre els isoesquizòmers i els neosquizòmers.
