La diferència clau entre MLVA i MLST és que MLVA utilitza el polimorfisme de seqüències d'ADN repetides en tàndem per caracteritzar espècies microbianes, mentre que MLST utilitza el polimorfisme de seqüències d'ADN de fragments interns de múltiples gens domèstics per caracteritzar espècies microbianes.
La mecanografia microbiana s'utilitza normalment per determinar l'origen i les rutes de les infeccions. Confirma o descarta brots. La tipificació microbiana també rastreja la transmissió creuada de patògens associats a l'assistència sanitària i reconeix les soques virulentes. A més, la tipificació microbiana avalua l'eficàcia de les mesures de control d'espècies microbianes patògenes. MLVA i MLST són dues tècniques de biologia molecular utilitzades en la tipificació microbiana.
Què és MLVA?
L'anàlisi VNTR de múltiples loci (MLVA) és un mètode biològic molecular que utilitza el polimorfisme de seqüències d'ADN repetides en tàndem per caracteritzar espècies microbianes. És un mètode utilitzat per a l'anàlisi genètica d'espècies microbianes particulars.
Durant el primer pas de MLVA, cada locus VNTR objectiu s'amplifica mitjançant PCR amb cebadors específics de la regió flanquejant. A continuació, els fragments obtinguts es separen per mida mitjançant electroforesi en un seqüenciador capil·lar. El genotipat de cada locus i els resultats recopilats a partir de cada mostra permeten caracteritzar un microorganisme del qual es coneix l'espècie. També permet identificar la subespècie mitjançant l'escriptura d'al·lels i la comparació amb les bases de dades MLVA.
Figura 01: MLVA
Aquest mètode MLVA és més selectiu que el mètode MLST. A més, el mètode MLVA no requereix un pas de seqüenciació d'ADN. Així, permet diferenciar subespècies properes o espècies clonals.
Què és MLST?
Multilocus sequence typing (MLST) és una tècnica que utilitza el polimorfisme de seqüències d'ADN de fragments interns de múltiples gens domèstics per caracteritzar espècies microbianes. MLST és una tècnica d'anàlisi genètica per a la tipificació de múltiples loci.
Figura 02: MLST
És un tipus de mecanografia de seqüenciació que s'utilitza com a tècnica de referència per distingir diferents soques d'espècies microbianes. Aquest mètode es basa en la seqüenciació de gens domèstics. Els gens domèstics normalment codifiquen proteïnes essencials d'agents microbians com ara un bacteri. Aquestes seqüències de gens domèstics tenen la particularitat de presentar un polimorfisme estable en el temps. Per tant, les diferències en les seqüències de gens domèstics són suficients per distingir les soques entre si. A més, el primer esquema MLST que es va desenvolupar va ser Neisseria meningitidis, l'agent causant de la meningitis meningocòccica i la septicèmia. Des de la seva introducció, MLST s'ha utilitzat no només per a patògens humans, sinó també per a patògens vegetals.
Quines similituds hi ha entre MLVA i MLST?
- MLVA i MLST són dues tècniques de biologia molecular utilitzades en la tipificació microbiana.
- Les dues tècniques es poden utilitzar per a l'anàlisi filogenètica microbiana.
- Les dues tècniques es basen en el polimorfisme genètic.
- Es poden utilitzar per a la detecció de mal alties humanes que causen patògens microbians.
- Les dues tècniques han de ser realitzades per biòlegs moleculars experts.
Quina diferència hi ha entre MLVA i MLST?
MLVA és una tècnica que utilitza el polimorfisme de seqüències d'ADN repetides en tàndem per caracteritzar espècies microbianes. Mentrestant, MLST és una tècnica que utilitza el polimorfisme de seqüències d'ADN de fragments interns de múltiples gens domèstics per caracteritzar espècies microbianes. Per tant, aquesta és la diferència clau entre MLVA i MLST. A més, el mètode MLVA és més selectiu que el mètode MLST.
La infografia següent presenta les diferències entre MLVA i MLST en forma de taula per a una comparació paral·lela.
Resum: MLVA vs MLST
MLVA i MLST són dues tècniques de biologia molecular utilitzades en la tipificació microbiana. MLVA utilitza el polimorfisme de seqüències d'ADN repetides en tàndem per caracteritzar espècies microbianes, mentre que MLST utilitza el polimorfisme de seqüències d'ADN de fragments interns de múltiples gens domèstics per caracteritzar espècies microbianes. Per tant, aquesta és la diferència clau entre MLVA i MLST.
