Diferència clau: ADN aigües amunt i aigües avall
És important tenir un coneixement general sobre la composició i l'estructura de l'ADN per entendre la diferència entre l'ADN aigües amunt i aigües avall. L'ADN està format per cadenes de polinucleòtids. Els nucleòtids són els blocs de construcció que creen cadenes de polinucleòtids i cada nucleòtid està format per tres components: un sucre de cinc carbonis, una base nitrogenada i un grup fosfat. Un grup fosfat i un grup OH estan units al carboni en posició 5’ i al carboni en posició 3’ de la molècula de sucre en un nucleòtid, respectivament. Els nucleòtids s'uneixen per enllaços fosfodièster formats entre el grup fosfat 5' d'un nucleòtid i el grup 3' OH del nucleòtid adjacent. Si una cadena de polinucleòtids té un grup fosfat 5' lliure, s'assigna com a extrem 5'; si té un grup OH lliure de 3’, s’assigna com a extrem de 3’. Per tant, les cadenes d'ADN solen tenir extrems 5' i 3' segons les posicions finals de les cadenes polinucleòtids. L'ADN també existeix com a forma de doble cadena. Dos fils són antiparal·lels entre si. Per tant, l'ADN té dues cadenes que van en direcció 5' a 3' i 3' a 5'. L'ADN aigües amunt i aigües avall es fa referència a la transcripció i la síntesi de la cadena d'ARNm de 5' a 3'. Si es considera l'ADN cap a l'extrem 5 de la cadena codificant del lloc d'inici de la transcripció, es coneix com a ADN aigües amunt. Si es considera l'ADN cap a l'extrem 3' de la cadena codificant del lloc d'inici de la transcripció, es coneix com ADN aigües avall. Aquesta és la diferència clau entre l'ADN aigües amunt i aigües avall.
Què és l'ADN upstream?
Un gen és una unitat d'herència estructural i funcional que es troba a l'ADN d'un organisme. S'emmagatzema amb instruccions per construir una proteïna. El gen té una regió específica d'una molècula d'ADN. Quan es requereix, es transcriu i es tradueix a una proteïna mitjançant la síntesi d'una cadena d'ARNm. Normalment, una cadena codificant del gen va des de la direcció 5' fins a la 3'. Quan es transcriu, produeix una cadena d'ARNm en la mateixa direcció 5' a 3'. Durant la transcripció, la cadena antisentit de 3' a 5' serveix com a cadena de plantilla i inicia la síntesi d'ARNm. Hi ha un lloc d'inici de la transcripció al gen. En referència al lloc d'inici de la transcripció, la regió d'ADN cap a l'extrem 5' de la cadena codificant es coneix com ADN aigües amunt. Un promotor del gen es troba normalment a la regió aigües amunt de l'ADN. En els gens eucariotes, hi ha caixes TATA, elements proximals promotors i potenciadors a la zona aigües amunt del gen. La regió aigües amunt del gen es fa referència amb nombres negatius. L'ADN aigües amunt d'un gen és de gran importància per a la transcripció.
Què és l'ADN avall?
El lloc d'inici de la transcripció es coneix com a punt +1 d'un gen. La regió d'ADN des del punt +1 cap a l'extrem 3' de la cadena codificant es coneix com ADN aigües avall. En altres paraules, aigües avall del gen és des del lloc d'inici de la transcripció cap a l'extrem 5' de la cadena de plantilla. Per tant, l'ADN aigües avall d'una regió gènica inclou unitat transcripcional i altres seqüències com la seqüència del terminador. El promotor pot influir en la seqüència aigües avall d'un gen. La part aigües avall d'un gen es fa referència amb nombres positius. L'ADN aigües avall d'un gen és la regió real que dóna el producte proteic.
Figura 01: ADN aigües amunt i aigües avall
Quina diferència hi ha entre l'ADN aigües amunt i aigües avall?
Avant amunt vs ADN descendent |
|
| La La regió d'ADN cap a l'extrem 5' de la seqüència de codificació del lloc d'inici de la transcripció es coneix com ADN aigües amunt. | La La regió d'ADN cap a l'extrem 3' de la cadena codificant del lloc d'inici de la transcripció es coneix com a ADN aigües avall. |
| Elements | |
| Els promotors i els potenciadors es troben a l'ADN aigües amunt | La unitat de transcripció i les seqüències de terminació es troben a l'ADN aigües avall. |
| Numeració | |
| Els nucleòtids de la regió aigües amunt es refereixen amb nombres negatius | Els nucleòtids es refereixen amb nombres positius. |
| Funció | |
| Aquesta regió conté els elements necessaris per regular i iniciar la transcripció | Aquesta regió conté instruccions per produir una proteïna i acabar la transcripció |
Resum: ADN aigües amunt i aigües avall
És fàcil identificar aigües amunt i aigües avall d'una cadena d'ARN. Pel que fa al lloc de referència, la regió cap a l'extrem 5' de la cadena d'ARN es coneix com a ARN aigües amunt, mentre que la regió cap a l'extrem 3' es coneix com a ARN aigües avall. Tanmateix, a l'ADN, hi ha dues cadenes que corren en ambdues direccions 5' a 3' i 3' a 5'. Per tant, la diferència entre l'ADN aigües amunt i aigües avall és complicada. Per tant, es diferencia en referència a la transcripció d'un gen. Des del lloc d'inici de la transcripció cap a l'extrem 5 de la cadena de sentit, la regió d'ADN es coneix com ADN aigües amunt, mentre que des del lloc d'inici de la transcripció cap a l'extrem 3' de la cadena de sentit es coneix com ADN aigües avall. Aquesta és la diferència entre aigües amunt i aigües avall de l'ADN.
